Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Anopheles gambiae
cluster # 8326 cluster # 8326       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_8326#0 length = 1669 sequences # 10  

consensusID : consensus_8326#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1669
fasta sequence
                              [CAAGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT-CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA-CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC-TCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT-TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC-GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCA-TTCGTCGAGCGACAGGTCGGCAAGTTGCCGCACGCTAGCGGTAGTGGCGTTGACGGCGGCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAG-CTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGC-GCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTAC-GCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATG-CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGCATCGAGTGTAACCGTTTCGCGATGCGTGCTGGCCGTACATGACCCAGCACTGTCGCGTCCTGGAGGTAGAAGCTGTTCTGCCAGTTGCGATGCGTCAAGCTAAACTGCCACAGCGCGACGCTGTTCAGCGTGTTCGCAAACAGGTACTGGAACTGGGCCGCATGGTACGCAAGCGGGTGGTTTATTACCTGGCGTTCCGTGCGTAGCAGGTACTGGTCGTACGGCTTGCTCGTCACCGACTGTCCCATGAGCGTAATGTTGGCTGCATTTATGCTAGCCACCTTCAGCCGCAACGAGCCGTTCAGCAACAGCTTGCCGGTGTAAAGCTGTCGGAAATCGCCCGGCCCGG]

[+] EMBL CNS09K0L             [CAAGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CNS09ASV             [ acGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACAAAACCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGCAGCGGGAG GTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGGCGCAATGaaataaaa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CNS08OB4             [                                                               CCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCT AACGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL BX619334             [                                                                                                                 GGAACACGCTCGGCGGTCGTCCCGGCGGAGGATGGTGGNTCGCGTCGCAGGCACCCCACGGGCNGCCCGCTCGACCNGCTTGATCGAACNGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCNGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGGCGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAACAGC TCGCTTTGCAGCGGGAGCG TCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGGCGAGCGGCGTCCGGTCTGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCAAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CNS08TF9             [                                                                                                                        GCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGGGGGGGGGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATCGGGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CNS09ASU             [                                                                                                                                                                                                                            AGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGCGTC CTTTGCAGCGGGAGCG TCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAG TTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCA TTCGTCGAGCGACAGGTCGGCAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CNS09K0K             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGCGGGAGCG TCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAG TTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCACTTCGTCGAGCGACAGGTCGGCAAGCTGCCGCACGCTAGCGGTAGTGGCGTTGACGGCGGCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAG CTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGC GCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTAC GCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATG CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL BM588918             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CNS08OB3             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAGTCTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGCGGCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTACTGCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGTACATGTCGCACCGACGTCG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL BM592765             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAG CTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGCGGCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTAC GCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATG CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGCATCGAGTGTAACCGTTTCGCGATGCGTGCTGGCCGTACATGACCCAGCACTGTCGCGTCCTGGAGGTAGAAGCTGTTCTGCCAGTTGCGATGCGTCAAGCTAAACTGCCACAGCGCGACGCTGTTCAGCGTGTTCGCAAACAGGTACTGGAACTGGGCCGCATGGTACGCAAGCGGGTGGTTTATTACCTGGCGTTCCGTGCGTAGCAGGTACTGGTCGTACGGCTTGCTCGTCACCGACTGTCCCATGAGCGTAATGTTGGCTGCATTTATGCTAGCCACCTTCAGCCGCAACGAGCCGTTCAGCAACAGCTTGCCGGTGTAAAGCTGTCGGAAATCGCCCGGCCCGG]


>consensus_8326#0 CAAGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCT GCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACAC GCTCGGCGGTCGTCCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCACCCACGGGCCGCCCG CTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTG CCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAG CAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACG CAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAA CATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAG CTCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCC GGTTGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTT CGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTT CGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGC GCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGA GCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCG AGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATCGG GGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCATTCGTCGAGCGACAGGTCGGC AAGTTGCCGCACGCTAGCGGTAGTGGCGTTGACGGCGGCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCG CCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGC GGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAGCTCGGTACGACCGTACAG TGCTTTGGGTGCGCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCG TCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTACGCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCG GTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATGCGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGC ATCGAGTGTAACCGTTTCGCGATGCGTGCTGGCCGTACATGACCCAGCACTGTCGCGTCC TGGAGGTAGAAGCTGTTCTGCCAGTTGCGATGCGTCAAGCTAAACTGCCACAGCGCGACG CTGTTCAGCGTGTTCGCAAACAGGTACTGGAACTGGGCCGCATGGTACGCAAGCGGGTGG TTTATTACCTGGCGTTCCGTGCGTAGCAGGTACTGGTCGTACGGCTTGCTCGTCACCGAC TGTCCCATGAGCGTAATGTTGGCTGCATTTATGCTAGCCACCTTCAGCCGCAACGAGCCG TTCAGCAACAGCTTGCCGGTGTAAAGCTGTCGGAAATCGCCCGGCCCGG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)