These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Anopheles gambiae see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_8326#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1669 fasta sequence [CAAGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT-CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA-CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC-TCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT-TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC-GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCA-TTCGTCGAGCGACAGGTCGGCAAGTTGCCGCACGCTAGCGGTAGTGGCGTTGACGGCGGCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAG-CTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGC-GCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTAC-GCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATG-CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGCATCGAGTGTAACCGTTTCGCGATGCGTGCTGGCCGTACATGACCCAGCACTGTCGCGTCCTGGAGGTAGAAGCTGTTCTGCCAGTTGCGATGCGTCAAGCTAAACTGCCACAGCGCGACGCTGTTCAGCGTGTTCGCAAACAGGTACTGGAACTGGGCCGCATGGTACGCAAGCGGGTGGTTTATTACCTGGCGTTCCGTGCGTAGCAGGTACTGGTCGTACGGCTTGCTCGTCACCGACTGTCCCATGAGCGTAATGTTGGCTGCATTTATGCTAGCCACCTTCAGCCGCAACGAGCCGTTCAGCAACAGCTTGCCGGTGTAAAGCTGTCGGAAATCGCCCGGCCCGG] [+] EMBL CNS09K0L [CAAGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGCAGCGGGAGCGTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACACAG ] [+] EMBL CNS09ASV [ acGTGCACGCCAGCGATGGTGCGCGCTGTGAGGAAGCCGGTGTCCGCCACCAGCAAGCTGCCCCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACAAAACCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGCAGCGGGAG GTTCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGGCGCAATGaaataaaa ] [+] EMBL CNS08OB4 [ CCGTATCGATACCGGATCGGGCCCAGCCGGCAGCAGTGCCTGCTCGTGCTGGAACACGCT AACGGTCGT CCGGCGGAGGATGCTGGGTCGCGTCGCAGGCA CCCACGGGCCGCCCGCTCGACCCGCTTGATCGAACCGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCCGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGACGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAGCAGC TCGCTTTGC ] [-] EMBL BX619334 [ GGAACACGCTCGGCGGTCGTCCCGGCGGAGGATGGTGGNTCGCGTCGCAGGCACCCCACGGGCNGCCCGCTCGACCNGCTTGATCGAACNGCCGGCCTGGGTGGAACAGTTGCCGAAGTGAACGCTCTGCCNGGCAAAGACGAGCCCGCCGGTAACGAGCCGCGTTTGGTCGAGCGAGGGTGCCAGCAGCAGCTGGTGCAGCGGATGGGTCGGATCGCGCACGTGCCCGTGGATGCTGCCGTGGCAACGCAGGCGCGTCACGCTGTGTGGTATGCGGACCGGCGGCGAACCGGCGACGTTCGGCTCGAACATCCAGGGCGGCAGCTTCGGGAGTTGCAGCACGCTGACCTCTAGCCGATCGATCAACAGC TCGCTTTGCAGCGGGAGCG TCTCGTCGGAGCGTAGGGCGAGCCGGGCGAGCGGCGTCCGGTCTGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCAAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGC ] [+] EMBL CNS08TF9 [ GCTCGGCGGTCGT CCGGCGGAGGATGGGGGGGGGCGTCGCAGGCA 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TTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGCTGCCGGATCTGGACCGGTCCCAGGACGCGCTTGTGGCCCGCGATCGGGCGGCCGGGCCGTGCGCCCCTGCTCGGTACCGTCTCCTGGAGCAGCCGCTGAACGGGACAAAAGTTGATGTGCCCGACCGATGCGGCCGCAATGCGCTGCGAGTCGGCCGGCGCGATGATCTTCGCAAAGGACGGAACCTTCCCGCCGACGGCCACATC GGGGTGCTGGTGGTGCACGGAAGCGACAAAGCGCTGCAGCACTTCGTCGAGCGACAGGTCGGCAAGCTGCCGCACGCTAGCGGTAGTGGCGTTGACGGCGGCCAGCTGAAGCTGCTGGTACCGCCGGCGCGGTGGTTTCGCCAGCTCGGCCAGCTCGTACGCCGTCCTGCCGTTGAAGCCGGCGGTTTGCAGCGGGCCACGCATCACGACCGCGCTCTGTCGCAG CTCGGTACGACCGTACAGTGCTTTGGGTGC GCAGCCGCCCTCCCGTGCGTCTGCTGTTCGTCATTGCGCCAGAGGGCGTCCGGGCTGAGCGTACCGTCGATCGAACCAGTAC GCAGGTGCGTCATACGCAGCGTGCCGGTAAACTCCTTCACATCACACACACGAACATG CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGC ] [-] EMBL BM588918 [ GTAGGGCGAGCCGGACGAGCGGCGTCCGGT TGATGAGCTTCGCGGTGAGGTAGCCGGTATCGAGCGTGCCAAAGTGCCACCGGGCTTCGATGCTCTGCGGTATCGCGTCCGTACCGCGCGTTACGATGCGCCCCAGCTGCCCCGTTTCGTGCCCATTGATGCGGTCGACGGCGAGCCGg ] [-] EMBL CNS08OB3 [ 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CGCACCGACGTCGATGCGGTTTTGCTGCATCGAGTGTAACCGTTTCGCGATGCGTGCTGGCCGTACATGACCCAGCACTGTCGCGTCCTGGAGGTAGAAGCTGTTCTGCCAGTTGCGATGCGTCAAGCTAAACTGCCACAGCGCGACGCTGTTCAGCGTGTTCGCAAACAGGTACTGGAACTGGGCCGCATGGTACGCAAGCGGGTGGTTTATTACCTGGCGTTCCGTGCGTAGCAGGTACTGGTCGTACGGCTTGCTCGTCACCGACTGTCCCATGAGCGTAATGTTGGCTGCATTTATGCTAGCCACCTTCAGCCGCAACGAGCCGTTCAGCAACAGCTTGCCGGTGTAAAGCTGTCGGAAATCGCCCGGCCCGG] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||