cluster # 8820

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Anopheles gambiae
cluster # 8820 cluster # 8820 Sequences # 12 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

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consensus_8820#0 length = 1753 sequences # 12
consensusID : consensus_8820#0
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Sequences nbr = 12
consensus length = 1753
fasta sequence
                              [CAATTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCGAGTTTATTATACACATCCCGTCTGCTTCTCTGTCACTCGAGCCACG-TTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTTAGTAGATTGCCTATACTCTTTCTATCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGTTATCTATTCTTGATCCATTAGGTTTCGTTTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTGCGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT-GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC-GTTCTTTCTC-----TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG-CTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTAATGGTGCAGATGCTCTGCTGCATATTCTACTGCTGCTTGCGAACAACGGGGGGAAAAGGTTTGCCTAAGATTGGGGTGCTTAGGTGTCGTGTATGTGTGTGTGTAGGTGAGGATCACCTGGGTCGGGGGGGTTGTGTCACTGCGGACAAAAAAGCACTCCCGGTTACGCCAGAATAGGGAGGGGGTGGGGAGAGAAATGTGTTGCGTTTTACTCTTGCTTGTTTATTTTCATTATTTTATTCACACTTGTACGCGTGTACAGGCTGTTGCTGTAAAATGTTTAGTTGACCTACAATCGTTAAGGTTGCTGCTATTATTATCAACGATGTATTGGTTTTATGCTATCCGCAGTTCACTCTGCCATGTAATGGCCGATAACGCCCCAATGTAACGCCCGCGTAACGTCGCTGCCATCTTGGATTGGACAGACAGTATGTAATTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGCCATCACTTGAATTTTCCCACTTTTAATCCAAGATGCCGCTGCTTAAAGCCCGTACCAGGTGAACTAAATTGCCCAGTTTAGTTTCCCTTTTAGTGTTTAAATTTTAAGGATTTAAAGTAACGAGTAACTTTGACAAACATAATGGAATAATGCACCTTAGAATACGGAATTAAAAACGGAAATCAATCATAATAATATCCATCTTCACAGAAAAATCTATAGACAAAAAAAAGAATTCAAAAAAGAATAGCATAATACCGAAAAATCAAACAGCAAACGCGTTACGAGAATGCACAGAAATGGCATAATTAAGTATCTTGGTTGTACCAACTGGTAAACGTGACGCGTAATGGTCGTAACGTTCGTAACGCACTTCTTAAATTCCACCAACTGCACTCCTACCAGTAGGCAGCTTACCGTAACACACGTAACTGCACTTTTGTGTGTGTGTATCTTACTGCTTGCGGGGCGTGCCCTCTCCCACACGCCTGCTACCCTTCTACTGTCCAAAAATAACCTCAGTTATACCTAAACTGTTACACCCCGATACTGTTGAGTAATAACCAGTAGG]

[-] EMBL BM631655             [CAATTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCGAGTTTATTATACACATCCCGTCTGCTTCTCTGTCACACGTGCCACG TTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTTAGTAGATTGCCTATACTCTTTCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL BX612292             [    TCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCGAGTTTATTATACACATCCCGTCTGCTTCTCTGTCACTCGAGCCACG TTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTTAGTAGATTGCCTATACTCTTTCTATCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGTTATCTATTCTTGATCCATTAGGTTTCGTTTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTGCGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC GTTCTTTCTC     TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGACAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG CTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CNS08D7V             [         TCTTCTTCTTCTCCTTCTTCGAGTTTATTATACACATCCCGTCTGCTTCTCTGTCACTCGAGCCACGTTTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTTAGTAGATTGCCTATACTCTTTCTATCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGTTATCTATTCTTGATCCATTAGGTTTCGTTTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTGCGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGTAATA AGAAGTTTTGAGTTTTTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTCAGTTCTTTCTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX608687             [                                                              TCACTCGAGCCACG TTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTTAGTAGATTGCCTATACTCTTTCTATCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGTTATCTATTCTTGATCCATTAGGTTTCGTTTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTGCGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC GTTCTTTCTC     TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG CTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL AGA283772            [                                                                                                                                                                                                            TTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTGCGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC GTTCTTTCTC     TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTGCCTGGTGGGCTTTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BM626611             [                                                                                                                                                                                                                                                                                     taTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTTTTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC GTTCTTTCTCTGTGTTGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG CTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTAATGGTGCAGATGCTCTGCTGCATATTCTACTGCcgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL BX610887             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAATCTGCTTTGTCTCGCTGTGT GTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTACTTTTTC GTTCTTTCTC     TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG CTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL BX627026             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CTTTCTC     TGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGATTGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCAGCTTTGTGCTTGCNTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAAAGTAAACCACTCCTCTCTG CTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTAATGGTGCAGATGCTCTGCTGCATATTCTACTGCTGCTTGCGAACAACGGGGGGAAAAGGTTTGCCTAAGATTGGGGTGCTTAGGTGTCGTGTATGTGTGTGTGTAGGTGAGGATCACCTGGGTCGGGGGGGTTGTGTCACTGCGGACAAAAAAGCACTCCCGGTTACGCCAGAATAGGGAGGGGGTGGGGAGAGAAATGTGTTGCGTTTTACTCTTGCTTGTTTATTTTCATTATTTTATTCACACTTGTACGCGTGTACAGGCTGTTGCTGTAAAATGTTTAGTTGACCTACAATCGTTAAGGTTGCTGCTATTATTATCAACGATGTATTGGTTTTATGCTATCCGCAGTTCACTCTGCCATGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL AGA285063            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTAATGGTGCAGATGCTCTGCTGCATATTCTACTGCTGCTTGCGAACAACGGGGGGAAAAGGTTTGCCTAAGATTGGGGTGCTTAGGTGTCGTGTATGTGTGTGTGTAGGTGAGGATCACCTGGGTCGGGGGGGTTGTGTCACTGCGGACAAAAAAGCACTCCCGGTTACGCCAGAATAGGGAGGGGGTGGGGAGAGAAATGTGTTGCGTTTTACTCTTGCTTGTTTATTTTCATTATTTTATTCACACTTGTACGCGTGTACAGGCTGTTGCTGTAAAATGTTTAGTTGACCTACAATCGTTAAGGTTGCTGCTATTATTATCAACGATGTATTGGTTTTATGCTATCCGCAGTTCACTCTGCCATGTAATGGCCGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL AGA285491            [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GAAAAGGTTTGCCTAAGATTGCCGTGCTTAAGTGTCGTCTATATGTGTGTGTAGGTGAGGATCACCTGGGTC GGGGGGTTGTGTCACTGCGGACAAAAAAGCACTCCCGGTTACGCCAGAATAGGGAGGGGGTGGGGAGAGAAATGTGTTGCGTTTTACTCTTGCTTGTTTATTTTCATTATTTTATTCACACTTGTACGCGTGTACAGGCTGTTGCTGTAAAATGTTTAGTTGACTTACACTCGTTAAGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CNS091YQ             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    gcCTTTTTTTTGTTT TTTTTATTATTTTATTCACACTTGTACGCGTGTACAGGCTGTTGCTGTAAAATGTTTAGTTGACCTACAATCGCTAAGGTTGCTGCTATTATTATCAACGATGTATTGGTTTTATGCTATCCGCAGTTCACTCTGCCATGTAATGGCCGATAACGCCCCAATGTAACGCCCGCGTAACGTCGCTGCCATCTTGGATTGGACAGACAGTATGTAATTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGCCATCACTTGAATTTTCCCACTTTTAATCCAAGATGCCGCTGCTTAAAGCCCGTACCAGGTGAACTAAATTGCCCAGTTTAGTTTCCCTTTTAGTGTTTAAATTTTAAGGATTTAAAGTAACGAGTAACTTTGACAAACATAATGGAATAATGCACCTTAGAATACGGAATTAAAAACGGAAATCAATCATAATAATATCCATCTTCACAGAAAAATCTATAGACAAAAAAAAGAATTCAAAAAAGAATAGCATAATACCGAAAAATCAAACAGCAAACGCGTTACGAGAATGCACAGAAATGGCATAATTAAGTATCTTGGTTGTACCAACTGGTAAACGTGACGCGTAATGGTCGTAACGTTCGTAACGCACTTCTTAAATTCCACCAACTGCACTCCTACCAGTAGGCAGCTTACCGTAACACACGTAACT                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CNS091YP             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CCCCAATGTAACGCCCGCGTAACGTCGCTGCCATCTTGGATTGGACAGACAGTATGTAATTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGCCATCACTTGAATTTTCCCACTTTTAATCCAAGATGCCGCTGCTTAAAGCCCGTACCAGGTGAACTAAATTGCCCAGTTTAGTTTCCCTTTTAGTGTTTAAATTTTAAGGATTTAAAGTAACGAGTAACTTTGACAAACATAATGGAATAATGCACCTTAGAATACGGAATTAAAAACGGAAATCAATCATAATAATATCCATCTTCACAGAAAAATCTATAGACAAAAAAAAGAATTCAAAAAAGAATAGCATAATACCGAAAAATCAAACAGCAAACGCGTTACGAGAATGCACAGAAATGGCATAATTAAGTATCTTGGTTGTACCAACTGGTAAACGTGACGCGTAATGGTCGTAACGTTCGTAACGCACTTCTTAAATTCCACCAACTGCACTCCTACCAGTAGGCAGCTTACCGTAACACACGTAACTGCACTTTTGTGTGTGTGTATCTTACTGCTTGCGGGGCGTGCCCTCTCCCACACGCCTGCTACCCTTCTACTGTCCAAAAATAACCTCAGTTATACCTAAACTGTTACACCCCGATACTGTTGAGTAATAACCAGTAGG]




>consensus_8820#0
CAATTCTCTTCTTCTTCTTCTCCTTCTTCGAGTTTATTATACACATCCCGTCTGCTTCTC
TGTCACTCGAGCCACGTTCAATTACATACTTACATTGTTTACCTTTCGCCTTTCCCACTT
AGTAGATTGCCTATACTCTTTCTATCTTTTTCTTTCTCTCTCTCTCTCGTTCTGTTATCT
ATTCTTGATCCATTAGGTTTCGTTTATTTTTCTGGTTTTATTTAACTACCAGCCATCCTG
CGCTCTCATTAACCCGTACGATATTGTTCGTTTTATTTTTCTACCCTTTGCAGTTCCCTT
TTATTTTAAATACAGTACCACCAGCGGAAACTGTCGTACCAAACAATCGACTGTCCTTAA
TCTGCTTTGTCTCGCTGTGTGTATAGAAGTTTTGAGTTTGTTTGTCTATTTGTGTGTTAC
TTTTTCGTTCTTTCTCTGTTTCAACATATCCTCATTCAAATTACAATTGCAATTATTGAT
TGAGTGAGTTTCACAAACAGGCTATTGTATCCTTTTTCTTCCCAATACCCCCCTCCCCCA
GCTTTGTGCTTGCCTAGTTTTTAGCCAAATGTATCACCTTAAGTACAGTTTCGTTTTAAA
AGTAAACCACTCCTCTCTGCTGGTGGGCTTTCTGATAAACGCGGTTTCCACACTCACACA
TACGCATCATCCCCCTTCATACCTTTTTGCTTCTTTTCCCATTTTATTTCGGTAATGGTG
CAGATGCTCTGCTGCATATTCTACTGCTGCTTGCGAACAACGGGGGGAAAAGGTTTGCCT
AAGATTGGGGTGCTTAGGTGTCGTGTATGTGTGTGTGTAGGTGAGGATCACCTGGGTCGG
GGGGGTTGTGTCACTGCGGACAAAAAAGCACTCCCGGTTACGCCAGAATAGGGAGGGGGT
GGGGAGAGAAATGTGTTGCGTTTTACTCTTGCTTGTTTATTTTCATTATTTTATTCACAC
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GCTGCTATTATTATCAACGATGTATTGGTTTTATGCTATCCGCAGTTCACTCTGCCATGT
AATGGCCGATAACGCCCCAATGTAACGCCCGCGTAACGTCGCTGCCATCTTGGATTGGAC
AGACAGTATGTAATTGTTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTGGCCATCACTTGAATTTTCCC
ACTTTTAATCCAAGATGCCGCTGCTTAAAGCCCGTACCAGGTGAACTAAATTGCCCAGTT
TAGTTTCCCTTTTAGTGTTTAAATTTTAAGGATTTAAAGTAACGAGTAACTTTGACAAAC
ATAATGGAATAATGCACCTTAGAATACGGAATTAAAAACGGAAATCAATCATAATAATAT
CCATCTTCACAGAAAAATCTATAGACAAAAAAAAGAATTCAAAAAAGAATAGCATAATAC
CGAAAAATCAAACAGCAAACGCGTTACGAGAATGCACAGAAATGGCATAATTAAGTATCT
TGGTTGTACCAACTGGTAAACGTGACGCGTAATGGTCGTAACGTTCGTAACGCACTTCTT
AAATTCCACCAACTGCACTCCTACCAGTAGGCAGCTTACCGTAACACACGTAACTGCACT
TTTGTGTGTGTGTATCTTACTGCTTGCGGGGCGTGCCCTCTCCCACACGCCTGCTACCCT
TCTACTGTCCAAAAATAACCTCAGTTATACCTAAACTGTTACACCCCGATACTGTTGAGT
AATAACCAGTAGG
clustalw multiple alignements is not computed in this case