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consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9440#6 GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 380
consensus_9440#4 GAGTTT-ATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AATTATGCTT 454
consensus_9440#5 GAGTTTCATACT-GTAA-TGATT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCTCAATTATGCTT 390
consensus_9440#7 GAGTGT-ATACT-GGAA-TGACT-GCAGG---TTGATCT-TCTAATTCT-AAGTATGCTT 402
consensus_9440#1 ANGTTCTATACTTGTAACTGATTTGCACGCGTTTGATCTCTCTAATTCTAA--TTCACTG 417
consensus_9440#3 GAGCTTTATACT-GTAACTGATT-GCACG-GTTNGATCT-TCTAATTCTCACANTCTCAT 400
* ***** * ** *** * *** * * ***** ********* * *
consensus_9440#0 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 353
consensus_9440#2 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 445
consensus_9440#6 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAAGACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 439
consensus_9440#4 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTANCTCAA-ACTATTT-CTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 512
consensus_9440#5 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTNTCTTATGAAGTTAGTTTAGCATT 449
consensus_9440#7 TATTGGGGGGGTTACGGGCTGTAGCTCAA-ACTATTT-CTT------------------- 441
consensus_9440#1 GCCTCTTCACTACGGGGCGGCGGGTTT---ACCGGGGGCCTGTTAAGC--GTCCAAACCC 472
consensus_9440#3 GGCTCTCTACTNCGCGNGGCGCGGTCT---ACCGCGCGC-TGTCAGC----TCAAAACTC 452
* * ** * *
consensus_9440#0 -AATT-TTATTAA-GTTTTATTTTT--TTAGT-AGGT-AATTATAATTTTT-TAA--GTT 403
consensus_9440#2 CAATTATTATTAA-GTTTTATTTTTATTCAGT-AGGT-AATTATAATTTTTATAA--GTT 500
consensus_9440#6 -AATTTNATTAAA-GTTTTATTTTTN-TTAGT-AGGT-AATTATAAGTTN---------- 484
consensus_9440#4 -AATT-TTATTAA-GTTTTATTTTT--TTAGT-AGGT-AATTATAATTTTT-TAA--GTT 562
consensus_9440#5 AATTTNTACTTAACGTTTCAATTTCTCTNAGTCAGGTCAATTATAATCTCTCTCACCGTT 509
consensus_9440#7 ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1 TNACTTCTACCTTCNATGGAACGC-TCTC----CGGT-CCACA--GCCACT-CCAAACNC 523
consensus_9440#3 AATCTCCTCCTCTACTCAGCACACGTCTCA---CGGTATCACAACGCCACTTNCANACTA 509
consensus_9440#0 TTTAT---TTT-TATCAAG-ATTATGTTTGATTTATTTTTTT------TTGTT-TTCCAT 451
consensus_9440#2 NANANATTTTC-NATCAAG-ATTATGTNTNGATTCTATTAATAANAACNNGTGATNCCAT 558
consensus_9440#6 ------------------------------------------------------------
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consensus_9440#5 CTCCCATTNTCCNATCAAGCANTATGTTCCGACTCCNNCCCCCCGCCC------------ 557
consensus_9440#7 ------------------------------------------------------------
consensus_9440#1 ACTCTA--CTCNANACGGATATGCTCGAGTTCCTTCACNCTCCACNCTACGCGCGTACAC 581
consensus_9440#3 TCTCTAATTTCNCACCGCTTACAAACTTNNCNCACTACTCNAAGCACAACAGGCTTACAC 569
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consensus_9440#1 TGC-TACTAACCCNTCNCTATTNTCAAACACGGGCTNCACGCGCTACTNTNGAACTNTAT 640
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consensus_9440#0 AAAAAAAAAGGGGAATCAGAATTAGTTT-CTGGATTTAATGTTG-AATACAGAAGTGGGG 565
consensus_9440#2 TTCGCTGAAGGGGNATCAGAATTAGTTTTCTGGGATTAATGTTGGAATACAGAAGATGGG 677
consensus_9440#6 ------------------------------------------------------------
consensus_9440#4 ------------------------------------------------------------
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consensus_9440#1 AACTCCCACACGAAAATTCTTAAATTTTGCTTTGCTCTGGTAANTGATACTNAAGTAC-A 699
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consensus_9440#6 ------------------------------------------------------------
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consensus_9440#1 GNCACAGCGCTACTACCTGGGGCTGCTTCAAGGCCCTTACTCCCTNTTAGGGTGTCGTAA 819
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consensus_9440#0 ATTTCTTTTATTTTTATTTGAGTTCGAGGGACTTTACCTCGATTTCGTTATGATAAACTA 744
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| Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||