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Anopheles gambiae
cluster # 9612 cluster # 9612       Sequences # 18       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9612#0 length = 1193 sequences # 18  

consensusID : consensus_9612#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 18
consensus length = 1193
fasta sequence
                              [CCGCCCACGCGCGGGATAGGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGACATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGG--TGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT-GGTGGTGGTGGTAG-CGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC-AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGCTGGTGGATCTTATCATGGTGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCGGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG-AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATAACCATCACCAAGCATGTCGATCAAAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACGGTGGTGAAAGAAGTCCCAGTGCACTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGG-TTATGGAGGCGGTGCCGGACACTCCAGTGCAAGTGCTAGTGCAAGTGCGCACGCTAGTGCAAGTGCAGGAAGCTTCGGCGGTGGTTACGGTGGCTCCAACGGTGGTGGCTATGGTGGTGGTGGAGGTGGTAGCGGAAATGTTG]

[+] EMBL BM591219             [CCGCCCACGCGTCCGATAGGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGACATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGGGAGGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM644550             [      cCGCTCGGGATACGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACGAAAGTGAACAGCAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGGCATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGT  TGGAGGTAGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGCTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTGCATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTCCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGCTGGTAG TGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCATACTCCTTCGGATCATCTTACTCCTCCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM600216             [        cCGCGGGATAGGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGGCACGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGG  TGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGCTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTGCATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGCTGGTAG TGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCATACTCCTTCGGATCATCTTACTCCTCCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM617443             [               ccgGGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGACATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BM584627             [                    ccgGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTGCGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGACATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGG  AGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BX614228             [                                                                                gAAAGTGAACAGCAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCTGCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGTCTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGGCATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGGTGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGG  TGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCCAGTCATTCCGGCGGTTCC   GGTGGTGCCTGCAGCAGTGCATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BM580697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                   ccGGAGGTGGTGGTGG  AGGAGGTGGCAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTATGGGTGGTGGTGGTAG CGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACCAAAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BM617752             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   cCGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGGTGGTAG CGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGCTGGTGGATCTTATCATGGTGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCGGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATAACCATCACCAAGCATGTCGATCAAAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCT                                                                                                                                                                                                                                                           ]
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[+] EMBL BM643942             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccgCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGCTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTGCATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGCTGGTAG TGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCATACTCCTTCGGATCATCTTACTCCTCCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCATGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGGAACAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGgt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
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[+] EMBL BM646500             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ccgGGACCTGGCTACTCCAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGGCAGCAGTGCATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGCTGGTAGTGGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCATACTCCTTCGGATCATCTTACTCCTCCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCATGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGGAACAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGGTGGCGGATCTTATCATGGAGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCCGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATCACCATCACCAAGCATGTCGATCAAGGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCG                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BM612767             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ccgGCCGGCAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGGTGGTAG CGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGCTGGTGGATCTTATCATGGTGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCGGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATAACCATCACCAAGCATGTCGATCAAAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACGGTGGTGAAAGAAGTCCCAGTGCACTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGG TTATGGAGGCGGTGCCGGACACTCCAGTGCAAGT                                                                                                             ]
[+] EMBL BM652738             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ccgGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGGAGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGGACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTAT GGTGGTGCTGGTAG TGGTGGAGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCATACTCCTTCGGATCATCTTACTCCTCCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCATGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGGAACAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGGTGGCGGATCTTATCATGGAGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCCGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATCACCATCACCAAGCATGTCGATCAAGGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACG                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL BM651176             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ccGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTCCGGCAGTAACGGTGGCTACC AAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTTCGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGCTGGTGGATCTTATCATGGTGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCGGGTGGACACGGTGGCCATGGTGGCCACGG AGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATAACCATCACCAAGCATGTCGATCAAAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACGGTGGTGAAAGAAGTCCCAGTGCACTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTTTATGGAGGCGGTGCCGGACACTCCAGTGCAAGTGCTAGTGCAAGTGCGCA                                                                                            ]
[+] EMBL BM596786             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ccgATAACCATCACCAAGCATGTCGATCAAAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCCCTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACGGTGGTGAAAGAAGTCCCAGTGCACTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGG TTATGGAGGCGGTGCCGGACACTCCAGTGCAAGTGCTAGTGCAAGTGCGCACGCTAGTGCAAGTGCAGGAAGCTTCGGCGGTGGTTACGGTGGCTCCAACGGTGGTGGCTATGGTGGTGGTGGAGGTGGTAGCGGAAATGTTG]


>consensus_9612#0 CCGCCCACGCGCGGGATAGGATCGGACGGAGCTAGATCCTGTGCTGCGCTTTGAACGGTG CGTGATAGGAAAGAAATAACAAAAGTGAACAACAAAACCGATCAAAATGAAGTGTTTCCT GCTCGTTACGCTTCTCACCCTGTCGCTGGCAAATGCGCACCTGTTCAAGAAAAAGCTCGT CTTAACGTCCGAATCTGACGGAGGACATGGCGGCGGCGGTGGAGGCAGCTTTTCATTGGG TGGCGGAAGCTTTGGCCTTTCCTTCGGTGGTGGACTAGGAGGTGGTGGTGGTGGAGGTGG CAGTCACGGAGGCTCTACTGGAGGAGGCTATGGTGGCGCATCTGGTGGACCTGGTTACTC CAGTGGAGGATACGGAGGAGGTGCGCCAAGCCATTCGGGCGGTGGCGGAGGTGGTGCCGG CAGCAGTACATTTGCAAGCGCTAGTGCCAGTGCAAGTGCCAATGCCGGTGGTGTTTCTGG AGGACATTCGGGACAGGGTGATTATTCCGGTTACGGACCGGCTCCAGCGGGATCTGCTGG ACATGGACATCATGGTGGCTATGGTGGCAATGGTGGTTATGGTGGTGGTGGTAGCGGTGG AGCTGTTGGTGGACATTCAGTGCACACTCCTTCGGACCATCTTACACCACCGGCCCAGTC CGGCAGTAACGGTGGCTACCAAGGATCGGGTGGCGCTTCTCACGGCTACTCCAACAGTTT CGCCAATGCCGACGCAGCTGCAGGAGCACACGCTGGAGCTCCGCAAGGATCTGCTGGTGG ATCTTATCATGGTGGATCACAACCGGTAGGAGCACCATCGGGTGGACACGGTGGCCATGG TGGCCACGGAGGAGGGCATGGTTTCACGAAACAAATAACCATCACCAAGCATGTCGATCA AAGTCCTCCACCGCGTCCGATTGTGATTGAAAAGCCCGTACCTGTGCCGGTTGATCGTCC CTATCCGGTGTACATCGAAAAGGAGGTACCGGTGACGGTGGTGAAAGAAGTCCCAGTGCA CTCCGGTGGTGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTTATGGAGGCGGTGCCGGACACTCCAGTGC AAGTGCTAGTGCAAGTGCGCACGCTAGTGCAAGTGCAGGAAGCTTCGGCGGTGGTTACGG TGGCTCCAACGGTGGTGGCTATGGTGGTGGTGGAGGTGGTAGCGGAAATGTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Wed Dec 3 12:11:56 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)