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Apis mellifera
cluster # 1002 cluster # 1002       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1002#0 length = 638 sequences # 3  

consensusID : consensus_1002#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 638
fasta sequence
                              [AAAGGAAACATCAATTAAAAAATGGCTGTAGCTGTTAGAACATTATCAAAATTTACAGTTAGAAAGTGTGGTAATTTATTAGGTACTCAAATAAGATTTAACTATGTAGATACTAGAAAAAACTTGAAAATTGATTCCAATACCAAAGTTATATGTCAAGGTTTCACTGGTAAACAGGGGACATTTCATTGTCAACAAGCCATTGAATATGGTACTAAAATAGTAGGTGGTGTTAATCCCAAAAAAGCTGGTACACAACATCTTGGAAAACCAGTTTTTAAAAATGTAAAAGAGGCAAAAGAAGCTACAGGTGCTACTGCATCTGTTATTTATGTTCCTCCTCCAAGCGCAGCTGCAGCTATTATGGAGGCAATAGATGCTGAAATGCCATTAATTGTATGTATTACTGAAGGTATTCCACAACATGATATGGTCAAAGTTAAAAGACGACTTTTGGAGCAAAATAAATCTCGTTTAGTTGGTCCAAATTGTCCAGGAATAATAGCTCCAGAACAGTGCAAAATAGGTATTATGCCAGGGCATATACATCAAAAAGGAAAAATTGGTATTGTATCAAGATCAGGAACATTAACATATGAAGCTGTGAATCAAACAACACTTGCTGGTCTTGGACAAAC]

[+] EMBL BI515965             [AAAGGAAACATCAATTAAAAAATGGCTGTAGCTGTTAGAACATTATCAAAATTTACAGTTAGAAAGTGTGGTAATTTATTAGGTACTCAAATAAGATTTAACTATGTAGATACTAGAAAAAACTTGAAAATTGATTCCAATACCAAAGTTATATGTCAAGGTTTCACTGGTAAACAGGGGACATTTCATTGTCAACAAGCCATTGAATATGGTACTAAAATAGTAGGTGGTGTTAATCCCAAAAAAGCTGGTACACAACATCTTGGAAAACCAGTTTTTAAAAATGTAAAAGAGGCAAAAGAAGCTACAGGTGCTACTGCATCTGTTATTTATGTTCCTCCTCCAAGCGCAGCTGCAGCTATTATGGAGGCAATAGATGCTGAAATGCCATTAATTGTATGTATTACTGAAGGTATTCCACAACATGATATGGTCAAAGTTAAAAGACGACTTTTGGAGCAAAATAAATCTCGTTTAGTTGGTCCAAATTG                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI515467             [                                                                                                TTTAACTATGTAGATACTAGAAAAAACTTGAAAATTGATTCCAATACCAAAGTTATATGTCAAGGTTTCACTGGTAAACAGGGGACATTTCATTGTCAACAAGCCATTGAATATGGTACTAAAATAGTAGGTGGTGTTAATCCCAAAAAAGCTGGTACACAACATCTTGGAAAACCAGTTTTTAAAAATGTAAAAGAGGCAAAAGAAGCTACAGGTGCTACTGCATCTGTTATTTATGTTCCTCCTCCAAGTGCAGCTGCAGCTATTATGGAGGCAATAGATGCTGAAATGCCATTAATTGTATGTATTACTGAAGGTATTCCACAACATGATATGGTCAAAGTTAAAAGACGACTTTTGGAGCAAAATAAATCTCGTTTAGTTGGTCCAAATTGTCCAGGAATAATAGCTCCAGAACAGTGCAAAATAGGTATTATGCCAGGGCATATACATCAAAAAGGAAAAATTGGTATTGTATCAAGATCAGGAACATTAACATATGAAGCTGTGAATCAAACAACACTTGCTGGTCTTGGACAAAC]
[+] EMBL BI511131             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGCCATTAATTGTATGTATTACTGAAGGTATTCCACAACATGATATGGTCAAAGTTAAAAGACGACTTTTGGAGCAAAATAAATCTCGTTTAGTTGGTCCAAATTGTCCAGGAATAATAGCTCCAGAACAGTGCAAAATAGGTATTATGCCAGGGCATATACATCAAAAAGGAAAAATTGGTATTGTATCAAGATCAGGAACATTAACATATGAAGCTGTGAATCAAACAACACTTGCTGGTCTTGGACAAAC]


>consensus_1002#0 AAAGGAAACATCAATTAAAAAATGGCTGTAGCTGTTAGAACATTATCAAAATTTACAGTT AGAAAGTGTGGTAATTTATTAGGTACTCAAATAAGATTTAACTATGTAGATACTAGAAAA AACTTGAAAATTGATTCCAATACCAAAGTTATATGTCAAGGTTTCACTGGTAAACAGGGG ACATTTCATTGTCAACAAGCCATTGAATATGGTACTAAAATAGTAGGTGGTGTTAATCCC AAAAAAGCTGGTACACAACATCTTGGAAAACCAGTTTTTAAAAATGTAAAAGAGGCAAAA GAAGCTACAGGTGCTACTGCATCTGTTATTTATGTTCCTCCTCCAAGCGCAGCTGCAGCT ATTATGGAGGCAATAGATGCTGAAATGCCATTAATTGTATGTATTACTGAAGGTATTCCA CAACATGATATGGTCAAAGTTAAAAGACGACTTTTGGAGCAAAATAAATCTCGTTTAGTT GGTCCAAATTGTCCAGGAATAATAGCTCCAGAACAGTGCAAAATAGGTATTATGCCAGGG CATATACATCAAAAAGGAAAAATTGGTATTGTATCAAGATCAGGAACATTAACATATGAA GCTGTGAATCAAACAACACTTGCTGGTCTTGGACAAAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)