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Apis mellifera
cluster # 1006 cluster # 1006       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1006#0 length = 718 sequences # 3  

consensusID : consensus_1006#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 718
fasta sequence
                              [GACGCGACATCATAATCGTTCAAACTTGTCTTCTTTTCTATTCTGACGTAATAATTCGTTTTAAAAAAAAAAATCTAATCCCAGCATCCCCGAATATCATGTAATGCTAGCGAATGTTTCCTACGTTCGATTATGGTTTAAGTTCCGAGTCTTAAGTTTAGCTTCGAATTATATTTGCAGCGATGCGTTGATAATGTTTGCGTGCTGCAATGTTCAATTACATACATATGAACGCGAGGACACCATTTTTCTGTAACAGATTATAATTATCATTTTACGATATAATAATAATATTTATTCGTCGAAACAATTAAAAATACCCACCCGTGTATTTTTAATAAAGATAATAATAATAATAATTTGTAGGGGTGTCCTCGTTGTAAGGAAAAGAAAAAAAAAGAGCTTAATATCGTATCCTTTGTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATTGTGTGCATGATTGTACCTACGAGCGAATCGAGAAACTCCGAGCAGTTCTCTTCGTTCTTTTTTTTTCCTTCCCCCCCGCCCCCCTTTCTTTTTTTGTAAACAAACGATTCAGCACGAGATCTTAATTAAAATTCATTTCCTTTACTTACTTCTTTTTTTTTTCCTGTTTCTATTAATTTCAACACCCGATACATATACATACATATGGTGTCGAATCCAGGGTTTTGAATTAATTCGCCAAAATTTCGAACACTTTTCAAACGCAT]

[+] EMBL BI509182             [GACGCGACATCATAATCGTTCAAACTTGTCTTCTTTTCTATTCTGACGTAATAATTCGTTTTAAAAAAAAAAATCTAATCCCAGCATCCCCGAATATCATGTAATGCTAGCGAATGTTTCCTACGTTCGATTATGGTTTAAGTTCCGAGTCTTAAGTTTAGCTTCGAATTATATTTGCAGCGATGCGTTGATAATGTTTGCGTGCTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI504971             [GACGCGACATCATAATCGTTCAAACTTGTCTTCTTTTCTATTCTGACGTAATAATTCGTTTTAAAAAAAAAAATCTAATCCCAGCATCCCCGAATATCATGTAATGCTAGCGAATGTTTCCTACGTTCGATTATGGTTTAAGTTCCGAGTCTTAAGTTTAGCTTCGAATTATATTTGCAGCGATGCGTTGATAATGTTTGCGTGCTGCAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL BI509860             [                                                                                             ATATCATGTAATGCTAGCGAATGTTTCCTACGTTCGATTATGGTTTAAGTTCCGAGTCNTAAGTTTAGCTTCGAATTATATTTGCAGCGATGCGTTGATAATGTTTGCGTGCTGATTTGTTCAATTACATACATATGAACGCGAGGACACCATTTTTCTGTAACAGATTATAATTATCATTTTACGATATAATAATAATATTTATTCGTCGAAACAATTAAAAATACCCACCCGTGTATTTTTAATAAAGATAATAATAATAATAATTTGTAGGGGTGTCCTCGTTGTAAGGAAAAGAAAAAAAAAGAGCTTAATATCGTATCCTTTGTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATTGTGTGCATGATTGTACCTACGAGCGAATCGAGAAACTCCGAGCAGTTCTCTTCGTTCTTTTTTTTTCCTTCCCCCCCGCCCCCCTTTCTTTTTTTGTAAACAAACGATTCAGCACGAGATCTTAATTAAAATTCATTTCCTTTACTTACTTCTTTTTTTTTTCCTGTTTCTATTAATTTCAACACCCGATACATATACATACATATGGTGTCGAATCCAGGGTTTTGAATTAATTCGCCAAAATTTCGAACACTTTTCAAACGCAT]


>consensus_1006#0 GACGCGACATCATAATCGTTCAAACTTGTCTTCTTTTCTATTCTGACGTAATAATTCGTT TTAAAAAAAAAAATCTAATCCCAGCATCCCCGAATATCATGTAATGCTAGCGAATGTTTC CTACGTTCGATTATGGTTTAAGTTCCGAGTCTTAAGTTTAGCTTCGAATTATATTTGCAG CGATGCGTTGATAATGTTTGCGTGCTGCAATGTTCAATTACATACATATGAACGCGAGGA CACCATTTTTCTGTAACAGATTATAATTATCATTTTACGATATAATAATAATATTTATTC GTCGAAACAATTAAAAATACCCACCCGTGTATTTTTAATAAAGATAATAATAATAATAAT TTGTAGGGGTGTCCTCGTTGTAAGGAAAAGAAAAAAAAAGAGCTTAATATCGTATCCTTT GTTATTATTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAATTGTGTGCATGATTGTACCTACGAGCGAAT CGAGAAACTCCGAGCAGTTCTCTTCGTTCTTTTTTTTTCCTTCCCCCCCGCCCCCCTTTC TTTTTTTGTAAACAAACGATTCAGCACGAGATCTTAATTAAAATTCATTTCCTTTACTTA CTTCTTTTTTTTTTCCTGTTTCTATTAATTTCAACACCCGATACATATACATACATATGG TGTCGAATCCAGGGTTTTGAATTAATTCGCCAAAATTTCGAACACTTTTCAAACGCAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)