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Apis mellifera
cluster # 1022 cluster # 1022       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1022#0 length = 567 sequences # 3  

consensusID : consensus_1022#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 567
fasta sequence
                              [TGACTCATATAAACTAGTGTGCCGCAATTAGTCAGCGCCAGTCACTGACTAGCGCGGNNNATACCTTTGGAGCTGACGGACTGACGTCGTATTCGAGTGCAAATGACTACATGTCAAAGTCAGTGAGCGGCGTACTTTAAGTGCACTTTCTACCGGTGGAGCTGGATTTCCTCCGATCGAATAAAAAATGTTGGCTCTTATTAATCGAATTTTGGATTGGTTTAAATCCCTCTTTTGGAAAGAAGAGATGGAACTCACCCTTGTTGGCTTACAATATAGTGGAAAAACCACCTTCGTGAATGTTATAGCGTCAGGACAATTCAGTGAAGATATGATTCCAACAGTTGGTTTTAATATGCGTAAAATAACAAAAGGCAATGTAACTATAAAAGTTTGGGATATTGGAGGTCAACCAAGGTTTAGGTCTATGTGGGAGAGATATTGCAGAGGAGTAAATGCAATAGTATATATGGTAGATGCAGCTGATTCTGAAAAAATTGAAGCAAGCCGCAATGAACTACATAATTTATTAGATAAACCTCAATTATCTGGTATACCAGTATTGGT]

[+] EMBL BI509282             [TGACTCATATAAACTAGTGTGCCGCAATTAGTCAGCGCCAGTCACTGACTAGCGC GNNNATACCTTTGGAGCTGACGGACTGACGTCGTATTCGAGTGCAAATGACTACATGTCAAAGTCAGTGAGTGGCGTACTTTAAGTGCACTTTCTACCGGTGGAGCTGGATTTCCTCCGATCGAATAAAAAATGTTGGCTCTTATTAATCGAATTTTGGATTGGTTTAAATCCCTCTTTTGGAAAGAAGAGATGGAACTCACCCTTGTTGGCTTACAATATAGTGGAAAAACCACCTTCGTGAATGTTATAGCGTCAGGACAATTCAGTGAAGATATGATTCCAACAGTTGGTTTTAATATGCGTAAAATAACAAAAGGCAATGTAACTATAAAAGTTTGGGATATTGGAGGTCAACCAAGGTTTAGGTCTATGTGGGAGAGATATTGCAGAGGAGTAAATGCAATAGTATATATGGTAGATGCAGCTGATTCTGAAAAAATTGAAGCAAGCCGCAATGAACTACATAATTTATTAGATAAACCTCAATTATCTGGTATA           ]
[+] EMBL BI503012             [                               TCAGCGCCAGTCACTGACTAGCGCGGTACATACCTTTGGAGCTGACGGACTGACGTCGTATTCGAGTGCAAATGACTACATGTCAAAGTCAGTGAGCGGCGTACTTTAAGTGCACTTTCTACCGGTGGAGCTGGATTTCCTCCGATCGAATAAAAAATGTTGGCTCTTATTAATCGAATTTTGGATTGGTTTAAATCCCTCTTTTGGAAAGAAGAGATGGAACTCACCCTTGTTGGCTTACAATATAGTGGAAAAACCACCTTCGTGAATGTTATAGCGTCAGGACAATTCAGTGAAGATATGATTCCAACAGTTGGTTTTAATATGCGTAAAATAACAAAAGGCAATGTAACTATAAAAGTTTGGGATATTGGAGGTCAACCAAGGTTTAGGTCTATGTGGGAGAG  ATTGCAGAGGAGTAAATGCAATAGTATATATGGTAGATGCAGCTGATTCTGAAAAAATTGAAGCAAGCCGCAATGAACTACATAATTTATTAGATAAACCTCAATTATCTGGT              ]
[+] EMBL BI503711             [                                                                                                                                                                             CGATCGAATAAAAAATGTTGGCTCTTATTAATCGAATTTTGGATTGGTTTAAATCCCTCTTTTGGAAAGAAGAGATGGAACTCACCCTTGTTGGCTTACAATATAGTGGAAAAACCACCTTCGTGAATGTTATAGCGTCAGGACAATTCAGTGAAGATATGATTCCAACAGTTGGTTTTAATATGCGTAAAATAACAAAAGGCAATGTAACTATAAAAGTTTGGGATATTGGAGGTCAACCAAGGTTTAGGTCTATGTGGGAGAGATATTGCAGAGGAGTAAATGCAATAGTATATATGGTAGATGCAGCTGATTCTGAAAAAATTGAAGCAAGCCGCAATGAACTACATAATTTATTAGATAAACCTCAATTATCTGGTATACCAGTATTGGT]


>consensus_1022#0 TGACTCATATAAACTAGTGTGCCGCAATTAGTCAGCGCCAGTCACTGACTAGCGCGGNNN ATACCTTTGGAGCTGACGGACTGACGTCGTATTCGAGTGCAAATGACTACATGTCAAAGT CAGTGAGCGGCGTACTTTAAGTGCACTTTCTACCGGTGGAGCTGGATTTCCTCCGATCGA ATAAAAAATGTTGGCTCTTATTAATCGAATTTTGGATTGGTTTAAATCCCTCTTTTGGAA AGAAGAGATGGAACTCACCCTTGTTGGCTTACAATATAGTGGAAAAACCACCTTCGTGAA TGTTATAGCGTCAGGACAATTCAGTGAAGATATGATTCCAACAGTTGGTTTTAATATGCG TAAAATAACAAAAGGCAATGTAACTATAAAAGTTTGGGATATTGGAGGTCAACCAAGGTT TAGGTCTATGTGGGAGAGATATTGCAGAGGAGTAAATGCAATAGTATATATGGTAGATGC AGCTGATTCTGAAAAAATTGAAGCAAGCCGCAATGAACTACATAATTTATTAGATAAACC TCAATTATCTGGTATACCAGTATTGGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)