Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1121 cluster # 1121       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1121#0 length = 1031 sequences # 3  

consensusID : consensus_1121#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 1031
fasta sequence
                              [GTTCAGGAGCGCTGCTAACTTTTATTATGAATGTTCTCTACGGTATTATTCCAAATCAGGACAACAGAATTACATGGCAGAATATAATCGAGACGTTTAAATGGGCTTATGCTAAAAGAACGAAATTAGCTGATCCTGATTTCGCTAACATTACCCAAGTACTTAATAATTTGACGTCTGTCGATTATGCAAATATGATTCAGAAGAAAATTAAAATAAACGAGACAAGTAACGATCCGACTTATTATGGTGCTATTACCGTCCCACCAGACGATTCAGGAACGTCTCACGTCTCCGTTTTGGCTCCCGATGGATCTGCCGTATCTGTCACATCAACGATAAATCAAGTTTTTGGGGCAATGATACGTTCAGAATCGACTGGCATAATATTTAACGATGAAATGGATGATTTTAGCTCCCCAAATATAACTAACGCATTCGGTGTACCACCATCGCCTGCAAATTTCATTAAGCCTGGAAAGAGACCTTTGAGTTCTATGAGCCCGACAATTGTTGTAGATAAAGATGAACATGTCCGTTTAGTAATTGGTGCTGCAGGTGGAACTAAAATCACTACCTCAATTGCAACAGCAATGATATTAAATCTTTGGTCAGGATATGATATAAAACAGGCTATTGATCTACCTAGAATTCATCATCAACTATTACCAATGACTGTTCAATATGAACAAGGATTTTCTACAGATATATTAAATTACTTATCGAATATTGGACATAATGTTACAACTTATACGGGAATTGGTAGTGCAATTACAGCTATATCTAAACAAAATGGAGAAATATTTGCTACTTCGGATTTTCGAAGAGAAGGAAAAACTGCTGGTTTTTAAGCAATTATTTAAATTTTTTTATCCATGAACAAAATAGCAAATAAAATGACTCAGTGACATAGATAAGAAATAATGTTGCGATATACACAAGTAGATAGGACATTGTTGCGATAAAAAATTAATTTACCTTTCTAATAAAGCAATGCACATAATCGTACGATCTCGCTATGAAAACTGTAA]

[+] EMBL BI505987             [GTTCAGGAGCGCTGCTAACTTTTATTATGAATGTTCTCTACGGTATTATTCCAAATCAGGACAACAGAATTACATGGCAGAATATAATCGAGACGTTTAAATGGGCTTATGCTAAAAGAACGAAATTAGCTGATCCTGATTTCGCTAACATTACCCAAGTACTTAATAATTTGACGTCTGTCGATTATGCAAATATGATTCAGAAGAAAATTAAAATAAACGAGACAAGTAACGATCCGACTTATTATGGTGCTATTACCGTCCCACCAGACGATTCAGGAACGTCTCACGTCTCCGTTTTGGCTCCCGATGGATCTGCCGTATCTGTCACATCAACGATAAATCAAGTTTTTGGGGCAATGATACGTTCAGAATCGACTGGCATAATATTTAACGATGAAATGGATGATTTTAGCTCCCCAAATATAACTAACGCATTCGGTGTACCACCATCGCCTGCAAATTTCATTAAGCCTGGAAAGAGACCTTTGAGTTCTATGAGCCCGACAATTGTTGTAGATAAAGATGAACATGTCCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI507247             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGGCTCCCGATGGATCTGCCGTATCTGTCACATCAACGATAAATCAAGTTTTTGGGGCAATGATACGTTCAGAATCGACTGGCATAATATTTAACGATGAAATGGATGATTTTAGCTCCCCAAATATAACTAACGCATTCGGTGTACCACCATCGCCTGCAAATTTCATTAAGCCTGGAAAGAGACCTTTGAGTTCTATGAGCCCGACAATTGTTGTAGATAAAGATGAACATGTCCGTTTAGTAATTGGTGCTGCAGGTGGAACTAAAATCACTACCTCAATTGCAACAGCAATGATATTAAATCTTTGGTCAGGATATGATATAAAACAGGCTATTGATCTACCTAGAATTCATCATCAACTATTACCAATGACTGTTCAATATGAACAAGGATTTTCTACAGATATATTAAATTACTTATCGAATATTGGACATAATGTTACAACTTATACGGGAATTGGTAGTGCAATTACAGCTATATCTAAACAAAATGGAGAAATATTTGCTACTTCGGATTTTCGAAGAGAAGGAAAAACTGCTGGTTTTTAAGCAATTATTTAAATTTTTTTATCCATGAACAAAATAGCAAATAAAATGA                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI508257             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CGATGAAATGGATGATTTTAGCTCCCCAAATATAACTAACGCATTCGGTGTACCACCATCGCCTGCAAATTTCATTAAGCCTGGAAAGAGACCTTTGAGTTCTATGAGCCCGACAATTGTTGTAGATAAAGATGAACATGTCCGTTTAGTAATTGGTGCTGCAGGTGGAACTAAAATCACTACCTCAATTGCAACAGCAATGATATTAAATCTTTGGTCAGGATATGATATAAAACAGGCTATTGATCTACCTAGAATTCATCATCAACTATTACCAATGACTGTTCAATATGAACAAGGATTTTCTACAGATATATTAAATTACTTATCGAATATTGGACATAATGTTACAACTTATACGGGAATTGGTAGTGCAATTACAGCTATATCTAAACAAAATGGAGAAATATTTGCTACTTCGGATTTTCGAAGAGAAGGAAAAACTGCTGGTTTTTAAGCAATTATTTAAATTTTTTTATCCATGAACAAAATAGCAAATAAAATGACTCAGTGACATAGATAAGAAATAATGTTGCGATATACACAAGTAGATAGGACATTGTTGCGATAAAAAATTAATTTACCTTTCTAATAAAGCAATGCACATAATCGTACGATCTCGCTATGAAAACTGTAA]


>consensus_1121#0 GTTCAGGAGCGCTGCTAACTTTTATTATGAATGTTCTCTACGGTATTATTCCAAATCAGG ACAACAGAATTACATGGCAGAATATAATCGAGACGTTTAAATGGGCTTATGCTAAAAGAA CGAAATTAGCTGATCCTGATTTCGCTAACATTACCCAAGTACTTAATAATTTGACGTCTG TCGATTATGCAAATATGATTCAGAAGAAAATTAAAATAAACGAGACAAGTAACGATCCGA CTTATTATGGTGCTATTACCGTCCCACCAGACGATTCAGGAACGTCTCACGTCTCCGTTT TGGCTCCCGATGGATCTGCCGTATCTGTCACATCAACGATAAATCAAGTTTTTGGGGCAA TGATACGTTCAGAATCGACTGGCATAATATTTAACGATGAAATGGATGATTTTAGCTCCC CAAATATAACTAACGCATTCGGTGTACCACCATCGCCTGCAAATTTCATTAAGCCTGGAA AGAGACCTTTGAGTTCTATGAGCCCGACAATTGTTGTAGATAAAGATGAACATGTCCGTT TAGTAATTGGTGCTGCAGGTGGAACTAAAATCACTACCTCAATTGCAACAGCAATGATAT TAAATCTTTGGTCAGGATATGATATAAAACAGGCTATTGATCTACCTAGAATTCATCATC AACTATTACCAATGACTGTTCAATATGAACAAGGATTTTCTACAGATATATTAAATTACT TATCGAATATTGGACATAATGTTACAACTTATACGGGAATTGGTAGTGCAATTACAGCTA TATCTAAACAAAATGGAGAAATATTTGCTACTTCGGATTTTCGAAGAGAAGGAAAAACTG CTGGTTTTTAAGCAATTATTTAAATTTTTTTATCCATGAACAAAATAGCAAATAAAATGA CTCAGTGACATAGATAAGAAATAATGTTGCGATATACACAAGTAGATAGGACATTGTTGC GATAAAAAATTAATTTACCTTTCTAATAAAGCAATGCACATAATCGTACGATCTCGCTAT GAAAACTGTAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)