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Apis mellifera
cluster # 1125 cluster # 1125       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1125#0 length = 999 sequences # 3  

consensusID : consensus_1125#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 999
fasta sequence
                              [ACGGTTAATTTTGAATTATTTCAATAATATAATTATCGATGACTTCATAGATACTTCAGAATTTTTTAAATATTATAGATGAATTTTTTAAATATTTCAGATAAAAATTTTGAGTTGTGACACTTACTTTTTTTAGCGATCAATGGTAATTTTGACGTCTAGTAACTTGACAATTTTGTATCGTTTCTTCATCAATGGCACTTTATACTCTTTTCTTTACCGTTATGAGGCGTCTGCTGCCGTGTGATACTAATATTTTCGTGCATGCCTTTATGCCTACGTCTCAGTTGATATTCCTCTTTGTGTTTGTGTGATAGTATATTTCTATATATGAAGTTCGAATTCGGATATAATGAATAAATTGTGAATCACTTATTTTTCAATAATTTATATTAATTAATAATGGATATCGATAGGTTAATTAAAAAAAAGAAACGAGTCAAGCGTGATGGTAACCTTCAACAATTGGCTGAAATTGTTAAAGAGCTTGGTGATGTATATTTTGAAAATAGCAAGTATGAAGAAGCTTTACAGGAGTATATACAACAATTGGAAATCTGTAATATATTAGGAGATAAATTAAATATAGCAATAGCTCATAGAATGATTGGAGAGATTCATGTAAATATTGGTACATATGAAGAAGCATTAAATCATCAAAATCTTTACTTGGATAGAAGGAGCCAAGGATATTAAAAATTTATTAGAAGAACAAAGAGCTTATGCAACATTAGGTAGAACATATTTTTGTTGGGCTGAAAGTTTGCCTGAAAAATCCGAAAAAAAAATTGATATTCTCACAAATGCAAGAAAAATTGGGAAAAACTGATATTGAATTGAAAGAATTAATTACAATGAGGGCACGATTGTTGTTAAATTTGGGTTTGGTATTACAAGCTGAAAAAAATCATCAAGAAGCTGTGGATTTAATGGAAAAAGCTGCATTATTATGCGAAACACATAATTTGCGAGAAGATTTCCATAGAACGCAAATTGCTC]

[+] EMBL BI506051             [ACGGTTAATTTTGAATTATTTCAATAATATAATTATCGATGACTTCATAGATACTTCAGAATTTTTTAAATATTATAGATGAATTTTTTAAATATTTCAGATAAAAATTTTGAGTTGTGACACTTACTTTTTTTAGCGATCAATGGTAATTTTGACGTCTAGTAACTTGACAATTTTGTATCGTTTCTTCATCAATGGCACTTTATACTCTTTTCTTTACCGTTATGAGGCGTCTGCTGCCGTGTGATACTAATATTTTCGTGCATGCCTTTATGCCTACGTCTCAGTTGATATTCCTCTTTGTGTTTGTGTGATAGTATATTTCTATATATGAAGTTCGAATTCGGATATAATGAATAAATTGTGAATCACTTATTTTTCAATAATTTATATTAATTAATAATGGATATCGATAGGTTAATTAAAAAAAAGAAACGAGTCAAGCGTGATGGTAACCTTCAACAATTGGCTGAAATTGTTAAAGAGCTTGGTGATGTATATTTTGAAAATAGCAAGTATGAAGAAGCTTTACAGGAGTATATACAACAATTGGAAATCTGTAATATATTAGGAGATAAATTAAATATAGCAATAGCTCATAGAATGATTGGAGAGATTCATGTAAATATTGGTACATATGAAGAAGCATTAAATCATCAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI514031             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTAACCTTCAACAATTGGCTGAAATTGTTAAAGAGCTTGGTGATGTATATTTTGAAAATAGCAAGTATGAAGAAGCTTTACAGGAGTATATACAACAATTGGAAATCTGTAATATATTAGGAGATAAATTAAATATAGCAATAGCTCATAGAATGATTGGAGAGATTCATGTAAATATTGGTACATATGAAGAAGCATTAAATCATCAAAATCTTTACTTGGATAGAAGGAGCCAAGGATATTAAAAATTTATTAGAAGAACAAAGAGCTTATGCAACATTAGGTAGAACATATTTTTGTTGGGCTGAAAGTTTGCCTGAAAAATCCGAAAAAAAAATTGATATTCTCACAAATGCAAGAAAAATTGGGAAAAACTGATATTGAATTGAAAGAATTAATTACAATGAGGGCACGATTGTTGTTAAATTTGGGTTTGGTATTACAAGCTGAAAAAAATCATCAAGAAGCTGTGGATTTAATGGAAAAAGCTGCATTATTATGCGAAACACATAATTTGCGAGAAGATTTCCATAGAACGCAAATTGCTC]
[+] EMBL BI514127             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GGTAACCTTCAACAATTGGCTGAAATTGTTAAAGAGCTTGGTGATGTATATTTTGAAAATAGCAAGTATGAAGAAGCTTTACAGGAGTATATACAACAATTGGAAATCTGTAATATATTAGGAGATAAATTAAATATAGCAATAGCTCATAGAATGATTGGAGAGATTCATGTAAATATTGGTACATATGAAGAAGCATTAAATCATCAAAATCTTTACTTGGATAGAAGGAGCCAAGGATATTAAAAATTTATTAGAAGAACAAAGAGCTTATGCAACATTAGGTAGAACATATTTTTGTTGGGCTGAAAGTTTGCCTGAAAAATCCGAAAAAAAAATTGATATTCTCACAAATGCAAGAAAAATTGGGAAAAACTGATATTGAATTGAAAGAATTAATTACAATGAGGGCACGATTGTTGTTAAATTTGGGTTTGGTATTACAAGCTGAAAAAAATCATCAAGAAGCTGTGGATTTAATGGAAAAAGCTGCATTATTA                                                 ]


>consensus_1125#0 ACGGTTAATTTTGAATTATTTCAATAATATAATTATCGATGACTTCATAGATACTTCAGA ATTTTTTAAATATTATAGATGAATTTTTTAAATATTTCAGATAAAAATTTTGAGTTGTGA CACTTACTTTTTTTAGCGATCAATGGTAATTTTGACGTCTAGTAACTTGACAATTTTGTA TCGTTTCTTCATCAATGGCACTTTATACTCTTTTCTTTACCGTTATGAGGCGTCTGCTGC CGTGTGATACTAATATTTTCGTGCATGCCTTTATGCCTACGTCTCAGTTGATATTCCTCT TTGTGTTTGTGTGATAGTATATTTCTATATATGAAGTTCGAATTCGGATATAATGAATAA ATTGTGAATCACTTATTTTTCAATAATTTATATTAATTAATAATGGATATCGATAGGTTA ATTAAAAAAAAGAAACGAGTCAAGCGTGATGGTAACCTTCAACAATTGGCTGAAATTGTT AAAGAGCTTGGTGATGTATATTTTGAAAATAGCAAGTATGAAGAAGCTTTACAGGAGTAT ATACAACAATTGGAAATCTGTAATATATTAGGAGATAAATTAAATATAGCAATAGCTCAT AGAATGATTGGAGAGATTCATGTAAATATTGGTACATATGAAGAAGCATTAAATCATCAA AATCTTTACTTGGATAGAAGGAGCCAAGGATATTAAAAATTTATTAGAAGAACAAAGAGC TTATGCAACATTAGGTAGAACATATTTTTGTTGGGCTGAAAGTTTGCCTGAAAAATCCGA AAAAAAAATTGATATTCTCACAAATGCAAGAAAAATTGGGAAAAACTGATATTGAATTGA AAGAATTAATTACAATGAGGGCACGATTGTTGTTAAATTTGGGTTTGGTATTACAAGCTG AAAAAAATCATCAAGAAGCTGTGGATTTAATGGAAAAAGCTGCATTATTATGCGAAACAC ATAATTTGCGAGAAGATTTCCATAGAACGCAAATTGCTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)