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Apis mellifera
cluster # 1140 cluster # 1140       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1140#0 length = 794 sequences # 3  

consensusID : consensus_1140#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 794
fasta sequence
                              [CGTTCTCTCTGAAAATCTGAGTACAGGGTTCTCAGGATTTAGATCTATCAGCTGCGATACTGCCAGAGAATGTAATACTAGTGAAGAGAATGATAATCAAGTGTGCGGACGTGTCGAATCCTACTCGACCGTTGAAATATTGCGTCGAATGGGCCAGACGAATTGCAGAAGAGTATTTTAGTCAAGTACG-ATAATAACACATACGTTTCCTTCCTTTCTTTTTAGATTTCTTTTTAATTTGACAATTATTCTTTCTCGACTAGAGATTACTGTGAGTTTACACGTTTAAAAAATTGTTCACATATATCACATTGTACTGAACGTATGCTTCAAAATGAGAAAGAGTTTTTGATTATTTTGATGCATTTGATTGAATTTATTTCAGACTGACGAAGAAAAACAATTGCATCTTCCAGTAATGATGCCAATGTTCGACAGAATAACATGCTCGATACCAAGAGCGCAAATTGGTTTTATCGATTTCATTATCAACGACATGGTCGAGGCATGGGATGGTCAGTAACTCTTATATCTTGAATGCTTATAAACGTATGTATTGTTATCATGGACACAATTTTATTTACAGTATTCATCAATATGCCGGAGATAGTGGGATTTATGAGACAAAATTATGATAAATGGAAAGAATATAACGTAAGTAATGATTAAATCTTGAATTTTATTTCTATTTTTTTAATTTAATTATTCTCTCCATTTTTTTACTTCTAAAATTTATTAAATTTGGTTATATTCTGAGAATAAAACACTACTTTTTTTTTATCAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI517260             [CGTTCTCTCTGAAAATCTGAGTACAGGGTTCTCAGGATTTAGATCTATCAGCTGCGATACTGCCAGAGAATGTAATACTAGTGAAGAGAATGATAATCAAGTGTGCGGACGTGTCGAATCCTACTCGACCGTTGAAATATTGCGTCGAATGGGCCAGACGAATTGCAGAAGAGTATTTTAGTCAAGTACG  TAATAACACATACGTTTCCTTCCTTTCTTTTTAGATTTCTTTTTAATTTGACAATTATTCTTTCTCGACTAGAGATTACTGTGAGTTTACACGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL BI512347             [                                                               CAGAGAATGTAATACTAGTGAAGAGAATGATAATCAAGTGTGCGGACGTGTCGAATCCTACTCGACCGTTGAAATATTGCGTCGAATGGGCCAGACGAATTGCAGAAGAGTATTTTAGTCAAGTACGTATAATAACACATACGTTTCCTTCCTTTCTTTTTAGATTTCTTTTTAATTTGACAATTATTCTTTCTCGACTAGAGATTACTGTGAGTTTACACGTTTAAAAAATTGTTCACATATATCACATTGTACTGAACGTATGCTTCAAAATGAGAAAGAGTTTTTGATTATTTTGATGCATTTGATTGAATTTATTTCAGACTGACGAAGAAAAACAATTGCATCTTCCAGTAATGATGCCAATGTTCGACAGAATAACATGCTCGATACCAAGAGCGCAAATTGGTTTTATCGATTTCATTATCAACGACATGGTCGAGGCATGGGATGGTCAGTAACTCTTATATCTTGAATGCTTATAAACGTATG                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI507254             [                                                                                                                                                                                                                                      CTTTTTAATTTGACAATTATTCTTTCTCGACTAGAGATTACTGTGAGTTTACACGTTTAAAAAATTGTTCACATATATCACATTGTACTGAACGTATGCTTCAAAATGAGAAAGAGTTTTTGATTATTTTGATGCATTTGATTGAATTTATTTCAGACTGACGAAGAAAAACAATTGCATCTTCCAGTAATGATGCCAATGTTCGACAGAATAACATGCTCGATACCAAGAGCGCAAATTGGTTTTATCGATTTCATTATCAACGACATGGTCGAGGCATGGGATGGTCAGTAACTCTTATATCTTGAATGCTTATAAACGTATGTATTGTTATCATGGACACAATTTTATTTACAGTATTCATCAATATGCCGGAGATAGTGGGATTTATGAGACAAAATTATGATAAATGGAAAGAATATAACGTAAGTAATGATTAAATCTTGAATTTTATTTCTATTTTTTTAATTTAATTATTCTCTCCATTTTTTTACTTCTAAAATTTATTAAATTTGGTTATATTCTGAGAATAAAACACTACTTTTTTTTTATCAAAAAAAAAAAA]


>consensus_1140#0 CGTTCTCTCTGAAAATCTGAGTACAGGGTTCTCAGGATTTAGATCTATCAGCTGCGATAC TGCCAGAGAATGTAATACTAGTGAAGAGAATGATAATCAAGTGTGCGGACGTGTCGAATC CTACTCGACCGTTGAAATATTGCGTCGAATGGGCCAGACGAATTGCAGAAGAGTATTTTA GTCAAGTACGATAATAACACATACGTTTCCTTCCTTTCTTTTTAGATTTCTTTTTAATTT GACAATTATTCTTTCTCGACTAGAGATTACTGTGAGTTTACACGTTTAAAAAATTGTTCA CATATATCACATTGTACTGAACGTATGCTTCAAAATGAGAAAGAGTTTTTGATTATTTTG ATGCATTTGATTGAATTTATTTCAGACTGACGAAGAAAAACAATTGCATCTTCCAGTAAT GATGCCAATGTTCGACAGAATAACATGCTCGATACCAAGAGCGCAAATTGGTTTTATCGA TTTCATTATCAACGACATGGTCGAGGCATGGGATGGTCAGTAACTCTTATATCTTGAATG CTTATAAACGTATGTATTGTTATCATGGACACAATTTTATTTACAGTATTCATCAATATG CCGGAGATAGTGGGATTTATGAGACAAAATTATGATAAATGGAAAGAATATAACGTAAGT AATGATTAAATCTTGAATTTTATTTCTATTTTTTTAATTTAATTATTCTCTCCATTTTTT TACTTCTAAAATTTATTAAATTTGGTTATATTCTGAGAATAAAACACTACTTTTTTTTTA TCAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)