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Apis mellifera
cluster # 1197 cluster # 1197       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1197#0 length = 518 sequences # 3  

consensusID : consensus_1197#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 518
fasta sequence
                              [AAAGAGTGATAACATTTTACATTATGCGCCATAATTATATTGTAATATTAATATTATCTTTATTAACGTGGACATATGCTGAGGAACTTTATTCTGATAAATATGATTATGTGAATATTGACGAAATTTTAGCAAATGATCGTCTACGAAATCAATATTATGATTGTTTCATCGATGCAGGCTCTTGTTTAACTCCGGATTCAGTATTCTTTAAAAGTCACATAACAGAAGCGTTTCAAACACAATGTAAAAAATGTACTGAAATTCAAAAACAAAACTTGGACAAATTAGCAGAATGGTTTACTACAAATGAACCAGAAAAATGGAATCATTTCGTGGAAATAATGATAAAGAAAAAAGACGAAGGCGCATAAGATTCACGTTAAATAATTATTAATATAATTAATTTTTTATATAAATTATAGTATAGAATAGTAGCAATTAATAGTAATTGAAATATATCTATTATATTCTAATTATATCATGTAATGACAAATATAATAAAATTATCATAAAAA]

[+] EMBL BE844374             [AAAGAGTGATAACATTTTACATTATGCGCCATAATTATATTGTAATATTAATATTATCTTTATTAACGTGGACATATGCTGAGGAACTTTATTCTGATAAATATGATTATGTGAATATTGACGAAATTTTAGCAAATGATCGTCTACGAAATCAATATTATGATTGTTTCATCGATGCAGGCTCTTGTTTAACTCCGGATTCAGTATTCTTTAAAAGTCACATAACAGAAGCGTTTCAAACACAATGTAAAAAATGTACTGAAATTCAAAAACAAAACTTGGACAAATTATCAGAATGGTTTACTACAAATGAACCAGAAA                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL BE844373             [ AAGAGTGATAACATTTTACATTATGCGCCATAATTATATTGTAATATTAATATTATCTTTATTAACGTGGACATATGCTGAGGAACTTTATTCTGATAAATATGATTATGTGAATATTGACGAAATTTTAGCAAATGATCGTCTACGAAATCAATATTATGATTGTTTCATCGATGCAGGCTCTTGTTTAACTCCGGATTCAGTATTCTTTAAAAGTCACATAACAGAAGCGTTTCAAACACAATGTAAAAAATGTACTGAAATTCAAAAACAAAACTTGGACAAATTAGCAGAATGGTTTACTACAAATGAACCAGAAAAATGGAATCATTTCGTGGAAATAATGATAAAGAAAAAAGACGAAGGCGCATAAGATTCACGTTAAATAATTATTAATATAATTAATTTTTTATATAAATTATAGTATAGAATAGTAGCAATTAATAGTAATTGAAATATATCTATTATATTCTAATTATATCATGTAATGACAAATATAATAAAATTATCATAAAAA]
[+] EMBL BE844397             [                                                                  taTGGACATATGCTGAGGAACTTTATTCTGATAAATATGATTATGTGAATATTGACGAAATTTTAGCAAATGATCGTCTACGAAATCAATATTATGATTGTTTCATCGATGCAGGCTCTTGTTTAACTCCGGATTCAGTATTCTTTAAAAGTCACATAACAGAAGCGTTTCAAACACAATGTAAGAAATGTACTGAAATTCAAAAACAAAACTTGGACAAATTAGCAGAATGGTTTACTACAAATGAACCAGAAAAATGGAATCATTTCGTGGAAATAATGATAAAGAAAAAAGACGAAGGCGCATAAGATTCACGTTAAATAATTATTAATATAATTAATTTTTTATATAAATTATAGTATAGAATAGTAGCAATTAATAGTAATTGAAATATATCTATTATATTCTAATTATATCATGTAATGACAAATATAATAAAATTATCATAAA  ]


>consensus_1197#0 AAAGAGTGATAACATTTTACATTATGCGCCATAATTATATTGTAATATTAATATTATCTT TATTAACGTGGACATATGCTGAGGAACTTTATTCTGATAAATATGATTATGTGAATATTG ACGAAATTTTAGCAAATGATCGTCTACGAAATCAATATTATGATTGTTTCATCGATGCAG GCTCTTGTTTAACTCCGGATTCAGTATTCTTTAAAAGTCACATAACAGAAGCGTTTCAAA CACAATGTAAAAAATGTACTGAAATTCAAAAACAAAACTTGGACAAATTAGCAGAATGGT TTACTACAAATGAACCAGAAAAATGGAATCATTTCGTGGAAATAATGATAAAGAAAAAAG ACGAAGGCGCATAAGATTCACGTTAAATAATTATTAATATAATTAATTTTTTATATAAAT TATAGTATAGAATAGTAGCAATTAATAGTAATTGAAATATATCTATTATATTCTAATTAT ATCATGTAATGACAAATATAATAAAATTATCATAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)