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Apis mellifera
cluster # 1288 cluster # 1288       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1288#0 length = 2766 sequences # 2  
consensusID : consensus_1288#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 2766
fasta sequence 
                              [TTCTTATAAATTATAATTAAATTCTACGTGTCCGATTCGACGTAACAGTTATACAATGTACATAATATTTGCTTATGATGATCCATCTGTAATACTGCACACCCCTCAATATATTTTTCCTCCGCTCCATCTGGTCTGGTCACTCTGGTCGCGACATCATCATAGTCTCTTGGAAACTGATTTAATTCCGTTCCAATCTCTCAATTATCATCGTATTATCTTACAATCTCACAAATCTGCTTTCGGCGTTACATCGTTGAGAAGAATTTGTTCGTCAATCGTTTTTTGCGACATAACACGCTTTTGGTCGATGACATTTTATAGTCGTTCATATTGTTTGGCTTCGTTCAAACAGCGAATCGATCGATTGCAAAATTGCAGTAAGGAATTCGAGGATTTAAAATTAACTTAAATCGTTTCTAATAAAGAGGCAAGTTTCAGCTGCCTTGATACGGCATTTGATCCGGCACGGCAGACGAGTGATTTTGGCTTGGACTTTGATGGAAATGGGGACTGCTACCGTCTTGAGATATCTCACCAACCGTTGGCTCTTCATATTTTCCTCTCTTAAAACGACCGTACAGGGAAGAGTACGGTAGGTTATAATGGATTGCTGCTTGATTAATGCTCATGTGACCTAACCTGACAGCTTCGAGGGCTTCGGTCATAGCATCCTCGCTCCATGGTGTAGGATTGCTCCTGCTGAGCTCTATTCCTTCCCTTTTGCATCGACCGTACAACGTCCCCGTCGGTATTCCGAATTCCGTGGAGGCCCTTTGCACAGACGTTTGGCCGGAACGTATCGCTTCGAGGGCGCGATCGAGGTCGGCGGGCGACCACGTAGTAGGACTGGCGTTGAAAGGCGCCGCCAATCTGATCCCCTCCCTTCTCGCGATTTTGTACAACGTGCTGGATGGTATGCCAAACGCTTTCGAAGCTTTGTTCGCCGATATCGTGCCCGTTCGTAACGCGTCAAGCGCGTTGTTCAGACTCTCGTCGCTCCACGATTTAGTGGGCCCGTCCTTTTTCGGTGTGTCGATGCCAAGCCGATGCGCTCTTTGCCACAGGGTCGTGGACGGTATACCGAACGTTGCAGAGGCTTTCGTGAGGCTCATATCGTGATTTCTCAACGCCTCGAGGGCGGCGTCCATGTCCTCTTGGGTCCACGATTTCGAGCCGTGGTGGTGAGAACTGGATTGTCCAGAATGTCCCCTTGAATTATTTTCCCCCGAATCCGAGTGGACAGAACTACCGGAGGGCATTAATCCGAGCAACTCTGGCGTGATCATCATCATGTTATCGCTGTCGGCCGCGTTCTTCGAACTGACGCTCGCCCGATCCGACATGTGGCTGTCGATGTCGATCGTGTCCGACGAGTCCATCGTGTGCAACGTTTCGAATTTGATCTTCACACTGTCACAATTTTGAATGTCTGTGGAATGATGATCCGGGTCTCTTAAATGGGTGATCGTAGTGCCTACCAACGTGGCACTCGGTGGTGTCGGTTGCGTTTCTGGCGGTAGATCAACCTCTCCTGGATCCGGATGATGGCCATAATGTCCGAGGCCTGTATGACAAAACATGTCACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTCGCACCGTTACCGTTGCCGTTGTCGTTAGCGCCGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTATTATTGTTATTATTGCTAGCGTTGGTGTTGGCGTTGCCCGCGGTAATCGTACTATTGTTACTGTTGCGTTGGCAAGTTTCCAAGACTACTGCTCCCGCTGTTGCCTCCGTGCACTCTTCATCTTCGGGTTGCCAGTCTATGTGGGTCTCTTTATGCTCCCAATTGTAATTTTCGTTCGACTCCTCCTCTTTGTAACGATCGTAATGCCTGGAATCCGTGGCACGAGGCTCGAACGTCGTTCTGGGCCTCTTGTATCTCGGATGATGCCTCTTCAGCTTGGTGAAATTTATCCTAGGTGTGCCGGGCTCCCTAGGCGGCGAGCTCAAACTTACCGAGGGCGGGCCGTCTCTGCTCTCAGGCACCTCGCACAATCCTTTGATCTTTAGTTGATCGGCTGTTTTCAACAGCGACTGAAGTTCTGCTTGCGAAACATCGATCTCCCCTCTATAGACGAATTCTATTATAAATTTGAGATCATTGAAGCATACATCTTGTGGCATAATGATTGTCGGATGTTTGCAGGGATTTGAAAGTAGGAGCTTTTGAAAGTAGGAACTGCACGCCGATAATACCACTTTGTGCGCTTTTAAGGAAGCTTCGTTACATGCCAGTGTAACGTCGACAAAAGCTTCCGTTTGAAGCAGTTGATGGAAAACGGACGTCATGTTTGATTGGTAGTTATTCCAGCGCAGGCAGTAGTGCTGCCCGGCCATGCCGCCGCTTACCATGACCTGACCCTCGAACAAAATCACTACTGGAGTTAAACTTTGGCTGATGTTTGGCAACTCTGTGCCAAGGTTCGCAGAAGACACTCACTTTTACTATAGTTATGACACTTGGTATACACGACTACGCGCAATAAGATGTCTTATAAAGGATTTTTCACAAAACGTGTGTTCACGCGATGACACAAGGACAATTGTCAGTCGTCGCGTAAAGCACGTACTGCGCCGACGACTGGCAGTTGTCACTCTCGGTTTGCCCGTGAAAACGTCGCGGCACGAAGTGGCGTAGCGAATCACGGAGAGAGACGGAAAAAGAGAAAGACATAAATGCACACTAGGGGGCACCGTGATGGCGGCGGACGACCCGTGTTCC]

[-] EMBL AF084556             [TTCTTATAAATTATAATTAAATTCTACGTGTCCGATTCGACGTAACAGTTATACAATGTACATAATATTTGCTTATGATGATCCATCTGTAATACTGCACACCCCTCAATATATTTTTCCTCCGCTCCATCTGGTCTGGTCACTCTGGTCGCGACATCATCATAGTCTCTTGGAAACTGATTTAATTCCGTTCCAATCTCTCAATTATCATCGTATTATCTTACAATCTCACAAATCTGCTTTCGGCGTTACATCGTTGAGAAGAATTTGTTCGTCAATCGTTTTTTGCGACATAACACGCTTTTGGTCGATGACATTTTATAGTCGTTCATATTGTTTGGCTTCGTTCAAACAGCGAATCGATCGATTGCAAAATTGCAGTAAGGAATTCGAGGATTTAAAATTAACTTAAATCGTTTCTAATAAAGAGGCAAGTTTCAGCTGCCTTGATACGGCATTTGATCCGGCACGGCAGACGAGTGATTTTGGCTTGGACTTTGATGGAAATGGGGACTGCTACCGTCTTGAGATATCTCACCAACCGTTGGCTCTTCATATTTTCCTCTCTTAAAACGACCGTACAAGGAAGAGTACGGTAGGTTATAATGGATTGCTGCTTGATTAATGCTCATGTGACCTAACCTGACAGCTTCGAGGGCTTCGGTCATAGCATCCTCGCTCCATGGTGTAGGATTGCTCCTGCTGAGCTCTATTCCTTCCCTTTTGCATCGACCGTACAACGTCCCCGTCGGTATTCCGAATTCCGTGGAGGCCCTTTGCACAGACGTTTGGCCGGAACGTATCGCTTCGAGGGCGCGATCGAGGTCGGCGGGCGACCACGTAGTAGGACTGGCGTTGAAAGGCGCCGCCAATCTGATCCCCTCCCTTCTCGCGATTTTGTACAACGTGCTGGATGGTATGCCAAACGCTTTCGAAGCTTTGTTCGCCGATATCGTGCCCGTTCGTAACGCGTCAAGCGCGTTGTTCAGACTCTCGTCGCTCCACGATTTAGTGGGCCCGTCCTTTTTCGGTGTGTCGATGCCAAGCCGATGCGCTCTTTGCCACAGGGTCGTGGACGGTATACCGAACGTTGCAGAGGCTTTCGTGAGGCTCATATCGTGATTTCTCAACGCCTCGAGGGCGGCGTCCATGTCCTCTTGGGTCCACGATTTCGAGCCGTGGTGGTGAGAACTGGATTGTCCAGAATGTCCCCTTGAATTATTTTCCCCCGAATCCGAGTGGACAGAACTACCGGAGGGCATTAATCCGAGCAACTCTGGCGTGATCATCATCATGTTATCGCTGTCGGCCGCGTTCTTCGAACTGACGCTCGCCCGATCCGACATGTGGCTGTCGATGTCGATCGTGTCCGACGAGTCCATCGTGTGCAACGTTTCGAATTTGATCTTCACACTGTCACAATTTTGAATGTCTGTGGAATGATGATCCGGGTCTCTTAAATGGGTGATCGTAGTGCCTACCAACGTGGCACTCGGTGGTGTCGGTTGCGTTTCTGGCGGTAGATCAACCTCTCCTGGATCCGGATGATGGCCATAATGTCCGAGGCCTGTATGACAAAACATGTCACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTCGCACCGTTACCGTTGCCGTTGTCGTTAGCGCCGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTATTATTGTTATTATTGCTAGCGTTGGTGTTGGCGTTGCCCGCGGTAATCGTACTATTGTTACTGTTGCGTTGGCAAGTTTCCAAGACTACTGCTCCCGCTGTTGCCTCCGTGCACTCTTCATCTTCGGGTTGCCAGTCTATGTGGGTCTCTTTATGCTCCCAATTGTAATTTTCGTTCGACTCCTCCTCTTTGTAACGATCGTAATGCCTGGAATCCGTGGCACGAGGCTCGAACGTCGTTCTGGGCCTCTTGTATCTCGGATGATGCCTCTTCAGCTTGGTGAAATTTATCCTAGGTGTGCCGGGCTCCCTAGGCGGCGAGCTCAAACTTACCGAGGGCGGGCCGTCTCTGCTCTCAGGCACCTCGCACAATCCTTTGATCTTTAGTTGATCGGCTGTTTTCAACAGCGACTGAAGTTCTGCTTGCGAAACATCGATCTCCCCTCTATAGACGAATTCTATTATAAATTTGAGATCATTGAAGCATACATCTTGTGGCATAATGATTGTCGGATGTTTGCAGGGATTTGAAAGTAGGAGCTTTTGAAAGTAGGAACTGCACGCCGATAATACCACTTTGTGCGCTTTTAAGGAAGCTTCGTTACATGCCAGTGTAACGTCGACAAAAGCTTCCGTTTGAAGCAGTTGATGGAAAACGGACGTCATGTTTGATTGGTAGTTATTCCAGCGCAGGCAGTAGTGCTGCCCGGCCATGCCGCCGCTTACCATGACCTGACCCTCGAACAAAATCACTACTGGAGTTAAACTTTGGCTGATGTTTGGCAACTCTGTGCCAAGGTTCGCAGAAGACACTCACTTTTACTATAGTTATGACACTTGGTATACACGACTACGCGCAATAAGATGTCTTATAAAGGATTTTTCACAAAACGTGTGTTCACGCGATGACACAAGGACAATTGTCAGTCGTCGCGTAAAGCACGTACTGCGCCGACGACTGGCAGTTGTCACTCTCGGTTTGCCCGTGAAAACGTCGCGGCACGAAGTGGCGTAGCGAATCACGGAGAGAGACGGAAAAAGAGAAAGACATAAATGCACACTAGGGGGCACCGTGATGGCGGCGGACGACCCGTGTTCC]
[+] EMBL BI507531             [                                                                                                                                                 TGGTCGCGACATCATCATAGTCTCTTGGAAACTGATTTAATTCCGTTCCAATCTCTCAATTATCATCGTATTATCTTACAATCTCACAAATCTGCTTTCGGCGTTACATCGTTGAGAAGAATTTGTTCGTCAATCGTTTTTTGCGACATAACACGCTTTTGGTCGATGACATTTTATAGTCGTTCATATTGTTTGGCTTCGTTCAAACAGCGAATCGATCGATTGCAAAATTGCAGTAAGGAATTCGAGGATTTAAAATTAACTTAAATCGTTTCTAATAAAGAGGCAAGTTTCAGCTGCCTTGATACGGCATTTGATCCGGCACGGCAGACGAGTGATTTTGGCTTGGACTTTGATGGAAATGGGGACTGCTACCGTCTTGAGATATCTCACCAACCGTTGGCTCTTCATATTTTCCTCTCTTAAAACGACCGTACAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]




>consensus_1288#0
TTCTTATAAATTATAATTAAATTCTACGTGTCCGATTCGACGTAACAGTTATACAATGTA
CATAATATTTGCTTATGATGATCCATCTGTAATACTGCACACCCCTCAATATATTTTTCC
TCCGCTCCATCTGGTCTGGTCACTCTGGTCGCGACATCATCATAGTCTCTTGGAAACTGA
TTTAATTCCGTTCCAATCTCTCAATTATCATCGTATTATCTTACAATCTCACAAATCTGC
TTTCGGCGTTACATCGTTGAGAAGAATTTGTTCGTCAATCGTTTTTTGCGACATAACACG
CTTTTGGTCGATGACATTTTATAGTCGTTCATATTGTTTGGCTTCGTTCAAACAGCGAAT
CGATCGATTGCAAAATTGCAGTAAGGAATTCGAGGATTTAAAATTAACTTAAATCGTTTC
TAATAAAGAGGCAAGTTTCAGCTGCCTTGATACGGCATTTGATCCGGCACGGCAGACGAG
TGATTTTGGCTTGGACTTTGATGGAAATGGGGACTGCTACCGTCTTGAGATATCTCACCA
ACCGTTGGCTCTTCATATTTTCCTCTCTTAAAACGACCGTACAGGGAAGAGTACGGTAGG
TTATAATGGATTGCTGCTTGATTAATGCTCATGTGACCTAACCTGACAGCTTCGAGGGCT
TCGGTCATAGCATCCTCGCTCCATGGTGTAGGATTGCTCCTGCTGAGCTCTATTCCTTCC
CTTTTGCATCGACCGTACAACGTCCCCGTCGGTATTCCGAATTCCGTGGAGGCCCTTTGC
ACAGACGTTTGGCCGGAACGTATCGCTTCGAGGGCGCGATCGAGGTCGGCGGGCGACCAC
GTAGTAGGACTGGCGTTGAAAGGCGCCGCCAATCTGATCCCCTCCCTTCTCGCGATTTTG
TACAACGTGCTGGATGGTATGCCAAACGCTTTCGAAGCTTTGTTCGCCGATATCGTGCCC
GTTCGTAACGCGTCAAGCGCGTTGTTCAGACTCTCGTCGCTCCACGATTTAGTGGGCCCG
TCCTTTTTCGGTGTGTCGATGCCAAGCCGATGCGCTCTTTGCCACAGGGTCGTGGACGGT
ATACCGAACGTTGCAGAGGCTTTCGTGAGGCTCATATCGTGATTTCTCAACGCCTCGAGG
GCGGCGTCCATGTCCTCTTGGGTCCACGATTTCGAGCCGTGGTGGTGAGAACTGGATTGT
CCAGAATGTCCCCTTGAATTATTTTCCCCCGAATCCGAGTGGACAGAACTACCGGAGGGC
ATTAATCCGAGCAACTCTGGCGTGATCATCATCATGTTATCGCTGTCGGCCGCGTTCTTC
GAACTGACGCTCGCCCGATCCGACATGTGGCTGTCGATGTCGATCGTGTCCGACGAGTCC
ATCGTGTGCAACGTTTCGAATTTGATCTTCACACTGTCACAATTTTGAATGTCTGTGGAA
TGATGATCCGGGTCTCTTAAATGGGTGATCGTAGTGCCTACCAACGTGGCACTCGGTGGT
GTCGGTTGCGTTTCTGGCGGTAGATCAACCTCTCCTGGATCCGGATGATGGCCATAATGT
CCGAGGCCTGTATGACAAAACATGTCACCGTTGTTGTTGTTGTTGCTCGCACCGTTACCG
TTGCCGTTGTCGTTAGCGCCGTTGTTGTTGTTGTTGTTATTGTTATTATTATTGTTATTA
TTGCTAGCGTTGGTGTTGGCGTTGCCCGCGGTAATCGTACTATTGTTACTGTTGCGTTGG
CAAGTTTCCAAGACTACTGCTCCCGCTGTTGCCTCCGTGCACTCTTCATCTTCGGGTTGC
CAGTCTATGTGGGTCTCTTTATGCTCCCAATTGTAATTTTCGTTCGACTCCTCCTCTTTG
TAACGATCGTAATGCCTGGAATCCGTGGCACGAGGCTCGAACGTCGTTCTGGGCCTCTTG
TATCTCGGATGATGCCTCTTCAGCTTGGTGAAATTTATCCTAGGTGTGCCGGGCTCCCTA
GGCGGCGAGCTCAAACTTACCGAGGGCGGGCCGTCTCTGCTCTCAGGCACCTCGCACAAT
CCTTTGATCTTTAGTTGATCGGCTGTTTTCAACAGCGACTGAAGTTCTGCTTGCGAAACA
TCGATCTCCCCTCTATAGACGAATTCTATTATAAATTTGAGATCATTGAAGCATACATCT
TGTGGCATAATGATTGTCGGATGTTTGCAGGGATTTGAAAGTAGGAGCTTTTGAAAGTAG
GAACTGCACGCCGATAATACCACTTTGTGCGCTTTTAAGGAAGCTTCGTTACATGCCAGT
GTAACGTCGACAAAAGCTTCCGTTTGAAGCAGTTGATGGAAAACGGACGTCATGTTTGAT
TGGTAGTTATTCCAGCGCAGGCAGTAGTGCTGCCCGGCCATGCCGCCGCTTACCATGACC
TGACCCTCGAACAAAATCACTACTGGAGTTAAACTTTGGCTGATGTTTGGCAACTCTGTG
CCAAGGTTCGCAGAAGACACTCACTTTTACTATAGTTATGACACTTGGTATACACGACTA
CGCGCAATAAGATGTCTTATAAAGGATTTTTCACAAAACGTGTGTTCACGCGATGACACA
AGGACAATTGTCAGTCGTCGCGTAAAGCACGTACTGCGCCGACGACTGGCAGTTGTCACT
CTCGGTTTGCCCGTGAAAACGTCGCGGCACGAAGTGGCGTAGCGAATCACGGAGAGAGAC
GGAAAAAGAGAAAGACATAAATGCACACTAGGGGGCACCGTGATGGCGGCGGACGACCCG
TGTTCC

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)