Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1386 cluster # 1386       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1386#0 length = 614 sequences # 2  

consensusID : consensus_1386#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 614
fasta sequence
                              [GTGTCATCACTCCCCTATTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTATCTTTCGTCTCGTTTAACAGTCTTGAGTGCCACCCAACCCCTTCGTCACCTGCGAGGGTTTACGATGCCTAATCTGATGAACGAGATATATGTTCACCCCTCGACATGCACGCACTTCTTTGTGGATAGGAAAGGGAGAAACTGGGGAAAATCTGGGATATATACCGTTTACGTTATTTGGTATATTGCTCGGATCTCGAGTATTTATTTTTAAGTAAATGGAATTGGAATGGAAAAAATTGATTTAAATTTTAGGGAGAGAAAGAATTTATTTTCTTAAGGAATTTTAAGTCTTTGAATGGTATTAATTTTCTTGGAATTTGCAAATANNATGTATAAGATGTTTCAGTTTTTTTAAGCTGTTCTTAAAAAAAATATATATATATTTTTTAAATAAATAAGAAAGAGAAATTACTTTAATCTATGAATTTGATTGATTATTGATTGGTTATCATCTAATAAATAATAGTTTAGTACTTTCATATATATAGAACATTAAAAATTAAATTAAAAATTATTGTATGAAATTTGAAAATTTTAAATAAAATTAATATTATAAAATAATTC]

[+] EMBL BI509230             [GTGTCATCACTCCCCTATTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTATCTTTCGTCTCGTTTAACAGTCTTGAGTGCCACCCAACCCCTTCGTCACCTGCGAGGGTTTACGATGCCTAATCTGATGAACGAGATATATGTTCACCCCTCGACATGCACGCACTTCTTTGTGGATAGGAAAGGGAGAAACTGGGGAAAATCTGGGATATATACCGTTTACGTTATTTGGTATATTGCTCGGATCTCGAGTATTTATTTTTAAGTAAATGGAATTGGAATGGAAAAAATTGATTTAAATTTTAGGGAGAGAAAGAATTTATTTTCTTAAGGAATTTTAAGTCTTTGAATGGTATTAATTTTCTTGGAATTTGCAAATANNATGTATAAGATGTTTCAGTTTTTTTAAGCTGTTCTTAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI506710             [                ATTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTATCTTTCGTCTCGTTTAACAGTCTTGAGTGCCACCCAACCCCTTCGTCACCTGCGAGGGTTTACGATGCCTAATCTGATGAACGAGATATATGTTCACCCCTCGACATGCACGCACTTCTTTGTGGATAGGAAAGGGAGAAACTGGGGAAAATCTGGGATATATACCGTTTACGTTATTTGGTATATTGCTCGGATCTCGAGTATTTATTTTTAAGTAAATGGAATTGGAATGGAAAAAATTGATTTAAATTTTAGGGAGAGAAAGAATTTATTTTCTTAAGGAATTTTAAGTCTTTGAATGGTATTAATTTTCTTGGAATTTGCAAATAGAATGTATAAGATGTTTCAGTTTTTTTAAGCTGTTCTTAAATTTTATATATATATATTTTTTAAATAAATAAGAAAGAGAAATTACTTTAATCTATGAATTTGATTGATTATTGATTGGTTATCATCTAATAAATAATAGTTTAGTACTTTCATATATATAGAACATTAAAAATTAAATTAAAAATTATTGTATGAAATTTGAAAATTTTAAATAAAATTAATATTATAAAATAATTC]


>consensus_1386#0 GTGTCATCACTCCCCTATTTCTCTCTTTCTCTCTCTCTTTTTCTTTATCTTTCGTCTCGT TTAACAGTCTTGAGTGCCACCCAACCCCTTCGTCACCTGCGAGGGTTTACGATGCCTAAT CTGATGAACGAGATATATGTTCACCCCTCGACATGCACGCACTTCTTTGTGGATAGGAAA GGGAGAAACTGGGGAAAATCTGGGATATATACCGTTTACGTTATTTGGTATATTGCTCGG ATCTCGAGTATTTATTTTTAAGTAAATGGAATTGGAATGGAAAAAATTGATTTAAATTTT AGGGAGAGAAAGAATTTATTTTCTTAAGGAATTTTAAGTCTTTGAATGGTATTAATTTTC TTGGAATTTGCAAATANNATGTATAAGATGTTTCAGTTTTTTTAAGCTGTTCTTAAAAAA AATATATATATATTTTTTAAATAAATAAGAAAGAGAAATTACTTTAATCTATGAATTTGA TTGATTATTGATTGGTTATCATCTAATAAATAATAGTTTAGTACTTTCATATATATAGAA CATTAAAAATTAAATTAAAAATTATTGTATGAAATTTGAAAATTTTAAATAAAATTAATA TTATAAAATAATTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)