Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1398 cluster # 1398       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1398#0 length = 648 sequences # 2  

consensusID : consensus_1398#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 648
fasta sequence
                              [AATATTTCATTATTTTTCAGAGAATTGTATGTGAAATTTATATGAAAAATAAAGACACGTCTATTATTTATGATAAATAAGTAAAAGAAGAAATGATATTTGAAATATCATTAGATAATTAAATTTTGGATAGCACAAGATTATCATTTTATTATTCGATTAGTTAATCAATAGTTTTATGTATGTCTTTTTTTTTTTTAATACATACACTTTTTAATGTATAAAGTGTAAAAAATGTAAAAATTTTCGACAATTATTGTAAGTTTTAAAAAGTACAAAAGGGTTAAATACATCCCGCCATCTAACAATATTCTCATTGTCATCGTTCTAACGCTATTCACTGTTAAAAAGAAACTCGCTGTTCACTTTTGCCGACAACTTTCGTCGACTTCGGATCTTCATTGTCATTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTATAAATCTATCCGCCAATTTCTACATCTATATTATATCACTGGTCCGGAGTATGCACGCTGAATCGAATGAAGATTAACTGAGTGCTTGAGTACACGCAGAAATTTCCAAAAGAGCTAGAAAACATTTATTTTTAAATTTAATACAATCATTTATTATCTCATTATTTTATAAATACATATATAATTAATCTAATTTCAAAATTTCTATTTCGAAATA]

[+] EMBL BI510920             [AATATTTCATTATTTTTCAGAGAATTGTATGTGAAATTTATATGAAAAATAAAGACACGTCTATTATTTATGATAAATAAGTAAAAGAAGAAATGATATTTGAAATATCATTAGATAATTAAATTTTGGATAGCACAAGATTATCATTTTATTATTCGATTAGTTAATCAATAGTTTTATGTATGTCTTTTTTTTTTTTAATACATACACTTTTTAATGTATAAAGTGTAAAAAATGTAAAAATTTTCGACAATTATTGTAAGTTTTAAAAAGTACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI506626             [                          GTATGTGAAATTTATATGAAAAATAAAGACACGTCTATTATTTATGATAAATAAGTAAAAGAAGAAATGATATTTGAAATATCATTAGATAATTAAATTTTGGATAGCACAAGATTATCATTTTATTATTCGATTAGTTAATCAATAGTTTTATGTATGTCTTTTTTTTTTTTAATACATACACTTTTTAATGTATAAAGTGTAAAAAATGTAAAAATTTTCGACAATTATTGTAAGTTTTAAAAAGTACAAAAGGGTTAAATACATCCCGCCATCTAACAATATTCTCATTGTCATCGTTCTAACGCTATTCACTGTTAAAAAGAAACTCGCTGTTCACTTTTGCCGACAACTTTCGTCGACTTCGGATCTTCATTGTCATTGTTGTTGTTGTTATTGTTGTTATAAATCTATCCGCCAATTTCTACATCTATATTATATCACTGGTCCGGAGTATGCACGCTGAATCGAATGAAGATTAACTGAGTGCTTGAGTACACGCAGAAATTTCCAAAAGAGCTAGAAAACATTTATTTTTAAATTTAATACAATCATTTATTATCTCATTATTTTATAAATACATATATAATTAATCTAATTTCAAAATTTCTATTTCGAAATA]


>consensus_1398#0 AATATTTCATTATTTTTCAGAGAATTGTATGTGAAATTTATATGAAAAATAAAGACACGT CTATTATTTATGATAAATAAGTAAAAGAAGAAATGATATTTGAAATATCATTAGATAATT AAATTTTGGATAGCACAAGATTATCATTTTATTATTCGATTAGTTAATCAATAGTTTTAT GTATGTCTTTTTTTTTTTTAATACATACACTTTTTAATGTATAAAGTGTAAAAAATGTAA AAATTTTCGACAATTATTGTAAGTTTTAAAAAGTACAAAAGGGTTAAATACATCCCGCCA TCTAACAATATTCTCATTGTCATCGTTCTAACGCTATTCACTGTTAAAAAGAAACTCGCT GTTCACTTTTGCCGACAACTTTCGTCGACTTCGGATCTTCATTGTCATTGTTGTTGTTGT TATTGTTGTTATAAATCTATCCGCCAATTTCTACATCTATATTATATCACTGGTCCGGAG TATGCACGCTGAATCGAATGAAGATTAACTGAGTGCTTGAGTACACGCAGAAATTTCCAA AAGAGCTAGAAAACATTTATTTTTAAATTTAATACAATCATTTATTATCTCATTATTTTA TAAATACATATATAATTAATCTAATTTCAAAATTTCTATTTCGAAATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)