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Apis mellifera
cluster # 1433 cluster # 1433       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1433#0 length = 713 sequences # 2  

consensusID : consensus_1433#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 713
fasta sequence
                              [TCTTATATTTGTCTATCTAATAATAAAAAAATAATAATAATTCGTTCAGTGTGTATCGTAAATTTTAATTCCAAAATTCTGCTCGCGGGATTTTCAGTGTTCAGTCATTTTTCAAATGTAAACTATGGTGTTAAATATTTC-TTCTAATATATCGATCAATGGAATTTTTATTCTGTTGATAAATTCGATTTCTATTGATTTAATTCGTATTGCATTATGCATATAAGAAATATTGTTCTAGTATTTCGCAAAAAGGATAATAAGACGCAAAAGTAAAATAGAGAATGCAGAAAGAATATAAATATCCTTGGAATGTGTAAAATCACGGGATAAGGACGAAAATGTACAGTTAAATAAGACATTTATGGCAATATCCTTTAATTAAGACAGATATAGTGTCCAGCACAATTGCTATTCAACTTTTACCATTAAATATCGTTATTTCACATACATACAGTGTAGTACTTAATTGTTAGCGTTATCTAATTGCGCTCAAAAGAAAAAGATAAAAAAAAAAAAGACAAAGATAAAGAAAAAGAACACAAAATATGCTAGAACGATCAAGTTATTATCGGGGCCCTTGTTTAACAAAGCGATTTTTTTATATCGAGTGGTGGTANGNAGGTAATCAAAAAGCAATGCAAAACGATTAGAAAACAGGTGGACAGAGTTGATGATATGATTCCTGAACGCGAACCAACGTGTCCCAACGT]

[-] EMBL BI512778             [TCTTATATTTGTCTATCTAATAATAAAAAAATAATAATAATTCGTTCAGTGTGTATCGTAAATTTTAATTCCAAAATTCTGCTCGCGGGATTTTCAGTGTTCAGTCATTTTTCAAATGTAAACTATGGTGTTAAATATTTCTTTCTAATATATCGATCAATGGAATTTTTATTCTGTTGATAAATTCGATTTCTATTGATTTAATTCGTATTGCATTATGCATATAAGAAATATTGTTCTAGTATTTCGCAAAAAGGATAATAAGACGCAAAAGTAAAATAGAGAATGCAGAAAGAATATAAATATCCTTGGAATGTGTAAAATCACGGGATAAGGACGAAAATGTACAGTTAAATAAGACATTTATGGCAATATCCTTTAATTAAGACAGATATAGTGTCCAGCACAATTGCTATTCAACTTTTACCATTAAATATCGTTATTTCACATACATACAGTGTAGTACTTAATTGTTAGCGTTATC                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI506420             [                                                                                                               TCAAATGTAAACTATGATGTTAAATATTTC TT TAATATATCGATCAATGGAATTTTTATTCTGTTGATAAATTCGATTTCTATTGATTTAATTCGTATTGCATTATGCATATAAGAAATATTGTTCTAATATTTCGCAAAAAGGATAATAAGACGCAAAAGTAAAATAGAGAATGCAGAAAGAATATAAATATCCTTGGAATGTGTAAAATCACGGGATAAGGACGAAAATGTACAGTTAAATAAGACATTTATGGCAATATCCTTTAATTAAGACAGATATAGTGTCCAGCACAATTGCTATTCAACTTTTACCATTAATTATCGTTATTTCATATACATACAGTGTAGTACTTAATTGTTAGCGTTATCTAATTGCGCTCAAAAGAAAAAGATAAAAAAAAAAAAGACAAAGATAAAGAAAAAGAACACAAAATATGCTAGAACGATCAAGTTATTATCGGGGCCCTTGTTTAACAAAGCGATTTTTTTATATCGAGTGGTGGTANGNAGGTAATCAAAAAGCAATGCAAAACGATTAGAAAACAGGTGGACAGAGTTGATGATATGATTCCTGAACGCGAACCAACGTGTCCCAACGT]


>consensus_1433#0 TCTTATATTTGTCTATCTAATAATAAAAAAATAATAATAATTCGTTCAGTGTGTATCGTA AATTTTAATTCCAAAATTCTGCTCGCGGGATTTTCAGTGTTCAGTCATTTTTCAAATGTA AACTATGGTGTTAAATATTTCTTCTAATATATCGATCAATGGAATTTTTATTCTGTTGAT AAATTCGATTTCTATTGATTTAATTCGTATTGCATTATGCATATAAGAAATATTGTTCTA GTATTTCGCAAAAAGGATAATAAGACGCAAAAGTAAAATAGAGAATGCAGAAAGAATATA AATATCCTTGGAATGTGTAAAATCACGGGATAAGGACGAAAATGTACAGTTAAATAAGAC ATTTATGGCAATATCCTTTAATTAAGACAGATATAGTGTCCAGCACAATTGCTATTCAAC TTTTACCATTAAATATCGTTATTTCACATACATACAGTGTAGTACTTAATTGTTAGCGTT ATCTAATTGCGCTCAAAAGAAAAAGATAAAAAAAAAAAAGACAAAGATAAAGAAAAAGAA CACAAAATATGCTAGAACGATCAAGTTATTATCGGGGCCCTTGTTTAACAAAGCGATTTT TTTATATCGAGTGGTGGTANGNAGGTAATCAAAAAGCAATGCAAAACGATTAGAAAACAG GTGGACAGAGTTGATGATATGATTCCTGAACGCGAACCAACGTGTCCCAACGT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)