Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1472 cluster # 1472       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1472#0 length = 653 sequences # 2  

consensusID : consensus_1472#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 653
fasta sequence
                              [ATAAAAAAATAACGTTTGACGATTGATGATGATAAAGATATATATAAAGAAAGGTGCTCGTGGTTCTTGGGGAGAAAAAGCGAATCAAGACCTCAAATACACGAGAGGAAAGTCATTTCGTCATGAAAAGACGAAGAAAAAACGTGGTAGCTACCGCGGCGGTCAAATAGATACTAGCGTCAATTCTATTAAGTTTGACGATTGAATAAACATTATATTGTAAAATATAAATGAACATGTTTTAACATTAGTAACTCGTATATTTAGTTAAGTGAACAGATAGAAAAATATTAGGACCGTTTAAGTTTACCTTAATAAGACACTTTGTTAATATCTTTGAAAACACAACACAATTAACGCTATGTTACAATCATAGAATATAAATTTTATTCATTTTATTATTACATAAGTTATTTTCACGTAGTTCTTTTTTAATATTAATTAGTATCTATAAGACTGCAAATTAAATATATTTGACGAAAATCTCTACCACTTATTTTAATATGAGGAGTATAATTTATGAAAGATACTTCGATATTGACTAGCTTTTGAATTAAAAATTAATGAATGTTGTCTATTGCAATATGTAACATATTTCATAAATTATCCTTCCTAGAATTCATAGGAAATTTGATAGATATCATTTAAATTTG]

[+] EMBL BI506492             [ATAAAAAAATAACGTTTGACGATTGATGATGATAAAGATATATATAAAGAAAGGTGCTCGTGGTTCTTGGGGAGAAAAAGCGAATCAAGACCTCAAATACACGAGAGGAAAGTCATTTCGTCATGAAAAGACGAAGAAAAAACGTGGTAGCTACCGCGGCGGTCAAATAGATACTAGCGTCAATTCTATTAAGTTTGACGATTGAATAAACATTATATTGTAAAATATAAATGAACATGTTTTAACATTAGTAACTCGTATATTTAGTTAAGTGAACAGATAGAAAAATATTAGGACCGTTTAAGTTTACCTTAATAAGACACTTTGTTAATATCTTTGAAAACACAACACAATTAACGCTATGTTACAATCATAGAATATAAATTTTATTCATTTTATTATTACATAAGTTATTTTCACGTAGTTCTTTTTTAATATTAATTAGTATCTATAAGACTGCAAATTAAATATATTTGACGAAAATCTCTACCACTTATTTTAATATGAGGAGTATAATTTATGAAAGATACTTCGATATTGACTAGCTTTTGAATTAAAAATTAATGAATGTTGTCTATTGCAATATGTAACATATTTCATAAATTATCCTTCCTAGAATTCATAGGAAATTTGATAGATATCATTTAAATTTG]
[+] EMBL BI506130             [ TAAAAAAATAACGTTTGACGATTGATGATGATAAAGATATATATAAAGAAAGGTGCTCGTGGTTCTTGGGGAGAAAAAGCGAATCAAGACCTCAAATACACGAGAGGAAAGTCATTTCGTCATGAAAAGACGAAGAAAAAACGTGGTAGCTACCGCGGCGGTCAAATAGATACTAGCGTCAATTCTATTAAGTTTGACGATTGAATAAACATTATATTGTAAAATATAAATGAACATGTTTTAACATTAGTAACTCGTATATTTAGTTAAGTGAACAGATAGAAAAATATTAGGACCGTTTAAGTTTACCTTAATAAGACACTTTGTTAATATCTTTGAAAACACAACACAATTAACGCTATGTTACAATCATAGAATATAAATTTTATTCATTTTATTATTACATAAGTTATTTTCACGTAGTTCTTTTTTAATATTAATTAGTATCTATAAGACTGCAAATTAAATATATTTGACGAAAATCTCTACCACTTATTTTAATATGAGGAGTATAATTTATGAAAGATACTTCGATATTGACTAGCTTTTGAATTAAAAATTAATGAATGTTGTCTATTGCAATATGTAACATATTTCATAAATTATCC                                            ]


>consensus_1472#0 ATAAAAAAATAACGTTTGACGATTGATGATGATAAAGATATATATAAAGAAAGGTGCTCG TGGTTCTTGGGGAGAAAAAGCGAATCAAGACCTCAAATACACGAGAGGAAAGTCATTTCG TCATGAAAAGACGAAGAAAAAACGTGGTAGCTACCGCGGCGGTCAAATAGATACTAGCGT CAATTCTATTAAGTTTGACGATTGAATAAACATTATATTGTAAAATATAAATGAACATGT TTTAACATTAGTAACTCGTATATTTAGTTAAGTGAACAGATAGAAAAATATTAGGACCGT TTAAGTTTACCTTAATAAGACACTTTGTTAATATCTTTGAAAACACAACACAATTAACGC TATGTTACAATCATAGAATATAAATTTTATTCATTTTATTATTACATAAGTTATTTTCAC GTAGTTCTTTTTTAATATTAATTAGTATCTATAAGACTGCAAATTAAATATATTTGACGA AAATCTCTACCACTTATTTTAATATGAGGAGTATAATTTATGAAAGATACTTCGATATTG ACTAGCTTTTGAATTAAAAATTAATGAATGTTGTCTATTGCAATATGTAACATATTTCAT AAATTATCCTTCCTAGAATTCATAGGAAATTTGATAGATATCATTTAAATTTG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)