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Apis mellifera
cluster # 1531 cluster # 1531       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1531#0 length = 633 sequences # 2  

consensusID : consensus_1531#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 633
fasta sequence
                              [TTTTCGAGGTTGATAAATGATAGAATAGATAATCCATTGTTTACATGGATTATTATTTTATATTTAACAATATACAAATTATTTTAATTAAAACATATATTTTAGATGAAGGAAAGTTAATTAAATATAACAGAATTTTTATACAAAAATGATATTCTGTTTAATGAAATTATATATTTTCTGTTAAAAAATATTTAATATTAAACAAATAAAAATATGGATTCTGCTACTGAATCAGAGCATATAGAAAAATTAATAAAAGAAGCTGAAAGCTTAAAAATTCGTTTAGAAGATGAACGACAGAAATTAAATGATATTACTCTTGCTAGTGTAGCAGATAGATTAGAAACCATTAATTGGATTAATGTAAAACCACGTCGTGTTCTAAAAGGTCATCAAGCGAAAGTTCTTTGTTCTGATTGGTCACCAGATAAACGTCATATTGTATCTTCTTCACAAGATGGCAAAATGATAATATGGGATGCTTTTACAACAAATAAAGAACATGCTCTTACTATGCCAACTATTTGGGTAATGGCTTGTGCTTATGCTCCAAGTGGTGCTCTTGTTGCTTGCGGAGGATTAGATAATAAAGTTACTGTATATCCTTTAAGTCAAGAAGATGATGTATCA]

[+] EMBL BI516217             [TTTTCGAGGTTGATAAATGATAGAATAGATAATCCATTGTTTACATGGATTATTATTTTATATTTAACAATATACAAATTATTTTAATTAAAACATATATTTTAGATGAAGGAAAGTTAATTAAATATAACAGAATTTTTATACAAAAATGATATTCTGTTTAATGAAATTATATATTTTCTGTTAAAAAATATTTAATATTAAACAAATAAAAATATGGATTCTGCTACTGAATCAGAGCATATAGAAAAATTAATAAAAGAAGCTGAAAGCTTAAAAATTCGTTTAGAAGATGAACGACAGAAATTAAATGATATTACTCTTGCTAGTGTAGCAGATAGATTAGAAACCATTAATTGGATTAATGTAAAACCACGTCGTGTTCTAAAAGGTCATCAAGCGAAAGTTCTTTGTTCTGATTGGTCACCAGATAAACGTCATATTGTATCTTCTTCACAAGATGGCAAAATGATAATATGGGATGCTTTTACAACAAATAAAGAACATGCTCTTACTATGCC                                                                                                                ]
[+] EMBL BI515153             [                                                                                                                                                                           ATATATTTTCTGTTAAAAAATATTTAATATTAAACAAATAAAAATATGGATTCTGCTACTGAATCAGAGCATATAGAAAAATTAATAAAAGAAGCTGAAAGCTTAAAAATTCGTTTAGAAGATGAACGACAGAAATTAAATGATATTACTCTTGCTAGTGTAGCAGATAGATTAGAAACCATTAATTGGATTAATGTAAAACCACGTCGTGTTCTAAAAGGTCATCAAGCGAAAGTTCTTTGTTCTGATTGGTCACCAGATAAACGTCATATTGTATCTTCTTCACAAGATGGCAAAATGATAATATGGGATGCTTTTACAACAAATAAAGAACATGCTCTTACTATGCCAACTATTTGGGTAATGGCTTGTGCTTATGCTCCAAGTGGTGCTCTTGTTGCTTGCGGAGGATTAGATAATAAAGTTACTGTATATCCTTTAAGTCAAGAAGATGATGTATCA]


>consensus_1531#0 TTTTCGAGGTTGATAAATGATAGAATAGATAATCCATTGTTTACATGGATTATTATTTTA TATTTAACAATATACAAATTATTTTAATTAAAACATATATTTTAGATGAAGGAAAGTTAA TTAAATATAACAGAATTTTTATACAAAAATGATATTCTGTTTAATGAAATTATATATTTT CTGTTAAAAAATATTTAATATTAAACAAATAAAAATATGGATTCTGCTACTGAATCAGAG CATATAGAAAAATTAATAAAAGAAGCTGAAAGCTTAAAAATTCGTTTAGAAGATGAACGA CAGAAATTAAATGATATTACTCTTGCTAGTGTAGCAGATAGATTAGAAACCATTAATTGG ATTAATGTAAAACCACGTCGTGTTCTAAAAGGTCATCAAGCGAAAGTTCTTTGTTCTGAT TGGTCACCAGATAAACGTCATATTGTATCTTCTTCACAAGATGGCAAAATGATAATATGG GATGCTTTTACAACAAATAAAGAACATGCTCTTACTATGCCAACTATTTGGGTAATGGCT TGTGCTTATGCTCCAAGTGGTGCTCTTGTTGCTTGCGGAGGATTAGATAATAAAGTTACT GTATATCCTTTAAGTCAAGAAGATGATGTATCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)