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Apis mellifera
cluster # 1562 cluster # 1562       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1562#0 length = 1276 sequences # 2  

consensusID : consensus_1562#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1276
fasta sequence
                              [TTTAATACTTAAAATGTGAATAAACAATAAAAGATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATAGAAAGAACAAAGAACATTGATTCAAATATTTTCCTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACATATTAAAATTCGTATTGGTTTATTTCATTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAAATCTGAATAAACAATAAGAAATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACATGTTAAAATTCGTATTGGTTTATTTCATTTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAAATCTGAATAAACAATAAAAAATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACGTGTTAAAATTCGTATTGGGAAACAAAAATCAAAATTTTCGCTATCGCGCTTCCGGCGAAATGTGCATTATGATAAACCTCCATGTTTAAATCGAGCTCGATTTCTTGAGGGCCTTGAATACTTTGCGTCATTACCAAAACAGCTTGTGTCGGTTCAGGCTTTCTCAGTGCGAAACACGATTCTGTGGCTCGTTGTATTCCAGTGGTGGCACGTGCTTCCAAAAACGCCATACTGAATTGTATCGCAGAGCCTGGCAGGTGATATCCTTTCATTTTAAACAGTTCTTCCGGTCTGTTTGGCATAACTGGCAACATGCTTACAAGAGTGATGAAATTATACGAGTAATGCGATGGTTGTCTAATGCAAGCATGATCGTTGATATGGCATGGCCATGACCTCACGCATCGGTTTTTTCTTTCGTGATCACGGTGATATCCATTGGGACACTTTATTTTATTGCAACGATAGCTACCTCTGACGTTGTGACAAATTTCATCTGCATCTCTACAAATATGTCCAGTTTGGCATTCATCGATATCTTCGCAAGTACGGCCATTATGTCCAAGCTTGTAACCATCTGGACATTTGCAAGCATAACTGCCTGGTGTATTTTCACAAATCCCTACGCATAAGTTATCTTTAAACTCTGTACATTCGTCGATGTCTGTACAAGAACGATTGTCAGGATTCAATTTGAATCCAGATTTACA]

[+] EMBL BQ103784             [TTTAATACTTAAAATGTGAATAAACAATAAAAGATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATAGAAAGAACAAAGAACATTGATTCAAATATTTTCCTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACATATTAAAATTCGTATTGGTTTATTTCATTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAAATCTGAATAAACAATAAGAAATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACATGTTAAAATTCGTATTGGTTTATTTCATTTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAAATCTGAATAAACAATAAAAAATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACGTGTTAAAATTCGTATTGAGAAACAAAAATCAAAATTTTCGCTATCGCGCTTCCGGCGAAATGTGCATTATGATAAACTTCCATGTTTAAATCGAGCTCGATTTCTTGAGGGCCTTGAATACTTTGCGTCATTACCAAAACAGCTTGTGTCGGTTCAGGCTTTCTCAGTGCGAAACACGATTCTGTGGCTCGTTGTATTCCAGTGGTGGCACGTGCTTCCAAAAACGCCATACTGAATTGTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL BQ103826             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGTTTCATAAGAACGTGTTAAAATTCGTATTGGGAAACAAAAATCAAAATTTTCGCTATCGCGCTTCCGGCGAAATGTGCATTATGATAAACCTCCATGTTTAAATCGAGCTCGATTTCTTGAGGGCCTTGAATACTTTGCGTCATTACCAAAACAGCTTGTGTCGGTTCAGGCTTTCTCAGTGCGAAACACGATTCTGTGGCTCGTTGTATTCCAGTGGTGGCACGTGCTTCCAAAAACGCCATACTGAATTGTATCGCAGAGCCTGGCAGGTGATATCCTTTCATTTTAAACAGTTCTTCCGGTCTGTTTGGCATAACTGGCAACATGCTTACAAGAGTGATGAAATTATACGAGTAATGCGATGGTTGTCTAATGCAAGCATGATCGTTGATATGGCATGGCCATGACCTCACGCATCGGTTTTTTCTTTCGTGATCACGGTGATATCCATTGGGACACTTTATTTTATTGCAACGATAGCTACCTCTGACGTTGTGACAAATTTCATCTGCATCTCTACAAATATGTCCAGTTTGGCATTCATCGATATCTTCGCAAGTACGGCCATTATGTCCAAGCTTGTAACCATCTGGACATTTGCAAGCATAACTGCCTGGTGTATTTTCACAAATCCCTACGCATAAGTTATCTTTAAACTCTGTACATTCGTCGATGTCTGTACAAGAACGATTGTCAGGATTCAATTTGAATCCAGATTTACA]


>consensus_1562#0 TTTAATACTTAAAATGTGAATAAACAATAAAAGATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAA ACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATAGAAAGAACAAAGAACATTGATTCAAATAT TTTCCTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACATATTAAAATTCGTATTGGTTT ATTTCATTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAAATCTGAATAAACAATAAGAAATTA TTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAATTATATTAAAAATTTAATACAAAGA ACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACATTTCTCCATTCATGCTTCATAAGAA CATGTTAAAATTCGTATTGGTTTATTTCATTTTTTTTTTCTCAACAATTTAATATTTGAA ATCTGAATAAACAATAAAAAATTATTTTACAGAATAATTGAAATAAAACACTCACAAAAT TATATTAAAAATTTAATACAAAGAACAAAGAACATTAATTCGAATATTTTTTTTAAACAT TTCTCCATTCATGCTTCATAAGAACGTGTTAAAATTCGTATTGGGAAACAAAAATCAAAA TTTTCGCTATCGCGCTTCCGGCGAAATGTGCATTATGATAAACCTCCATGTTTAAATCGA GCTCGATTTCTTGAGGGCCTTGAATACTTTGCGTCATTACCAAAACAGCTTGTGTCGGTT CAGGCTTTCTCAGTGCGAAACACGATTCTGTGGCTCGTTGTATTCCAGTGGTGGCACGTG CTTCCAAAAACGCCATACTGAATTGTATCGCAGAGCCTGGCAGGTGATATCCTTTCATTT TAAACAGTTCTTCCGGTCTGTTTGGCATAACTGGCAACATGCTTACAAGAGTGATGAAAT TATACGAGTAATGCGATGGTTGTCTAATGCAAGCATGATCGTTGATATGGCATGGCCATG ACCTCACGCATCGGTTTTTTCTTTCGTGATCACGGTGATATCCATTGGGACACTTTATTT TATTGCAACGATAGCTACCTCTGACGTTGTGACAAATTTCATCTGCATCTCTACAAATAT GTCCAGTTTGGCATTCATCGATATCTTCGCAAGTACGGCCATTATGTCCAAGCTTGTAAC CATCTGGACATTTGCAAGCATAACTGCCTGGTGTATTTTCACAAATCCCTACGCATAAGT TATCTTTAAACTCTGTACATTCGTCGATGTCTGTACAAGAACGATTGTCAGGATTCAATT TGAATCCAGATTTACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)