Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 1648 cluster # 1648       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1648#0 length = 769 sequences # 2  

consensusID : consensus_1648#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 769
fasta sequence
                              [TCGCGTGTGTTCGCTTGTTGAAACGTAATTTTCTCGATTTTAAAATTTTAACGATAGTGGAAATCCTGATTCGAATTTTCCACGCGACCAATTGTTAACATCGAAAGATTATTTTCGAGTCAACGAATGTATTTATTCTTTAGATCACCGGTAACAAATTTTGACAACGAAAACTTGAGAACTTTGATCTTCCAGAAAAAATAATCAGTTCTGTTGTTTTCTATTTCCTCACTTGTCTTGTATCTTATCTCGAACTACTTGCAATTCTTCTTGAACGAGTTTCCAAAACTTGTATTAGCATTTCGCAAAAATTCACATTATTTTGCAGTGGTG-CAAAGTCTTTGAATTAGTAGATTTGTTACGTAATATTCTGTGGCGTGACATGGCGTGATGTTGTAGAAAATTTAATCGACAAGCGAATGCAAACAGACTATTGGATCATCGATTAAACTTAAGACGAAGATCCGACAGTTGCGTTGATAGTTTAAGAGTTCGTCCACTCTTTGCCTTCCAGAATCTTTCACTAGATCTCTTTGTCTCTATCATCGACATGTGTTTTTCTTCAATTCACGTATATCATATTGCATAATTGCATACATACGTGTAAGCAGCCTTATCTGCGACTATGAAATATTTAGCGATTGAATAATAAAAGATGGAATCTGATGGATAAAATATTAATATTGATATTAATACAAATGGAGAAAAATTATGTAATAAAAGATTAATTTTGAAATAATATGTATAAAAAAATTAAATAGAATATGTC]

[+] EMBL BI515398             [TCGCGTGTGTTCGCTTGTTGAAACGTAATTTTCTCGATTTTAAAATTTTAACGATAGTGGAAATCCTGATTCGAATTTTCCACGCGACCAATTGTTAACATCGAAAGATTATTTTCGAGTCAACGAATGTATTTATTCTTTAGATCACCGGTAACAAATTTTGACAACGAAAACTTGAGAACTTTGATCTTCCAGAAAAAATAATCAGTTCTGTTGTTTTCTATTTCCTCACTTGTCTTGTATCTTATCTCGAACTACTTGCAATTCTTCTTGAACGAGTTTCCAAAACTTGTATTAGCATTTCGCAAAAATTCACATTATTTTGCAGTGGTGTCAAAGTCTTTGAATTAGTAGATTTGTTACGTAATATTCTGTGGCGTGACATGGCGTGATGTTGTAGAAAATTTAATCGACAAGCGAATGCAAATAGACTATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI513170             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TGTATTAGCATTTCGCAAAAATTCACATTATTTTGCAGTGGT      GTCTTTGAATTAGTAGATTTATTACGTAATATTCTGTGGCGTGACATGACGTGATGTTGTAGAAAATTTAATCGACAAGCGAATGCAAACAGACTATTGGATCATCGATTAAACTTAAGACGAAGATCCGACAGTTGCGTTGATAGTTTAAGAGTTCGTCCACTCTTTGCCTTCCAGAATCTTTCACTAGATCTCTTTGTCTCTATCATCGACATGTGTTTTTCTTCAATTCACGTATATCATATTGCATAATTGCATACATACGTGTAAGCAGCCTTATCTGCGACTATGAAATATTTAGCGATTGAATAATAAAAGATGGAATCTGATGGATAAAATATTAATATTGATATTAATACAAATGGAGAAAAATTATGTAATAAAAGATTAATTTTGAAATAATATGTATAAAAAAATTAAATAGAATATGTC]


>consensus_1648#0 TCGCGTGTGTTCGCTTGTTGAAACGTAATTTTCTCGATTTTAAAATTTTAACGATAGTGG AAATCCTGATTCGAATTTTCCACGCGACCAATTGTTAACATCGAAAGATTATTTTCGAGT CAACGAATGTATTTATTCTTTAGATCACCGGTAACAAATTTTGACAACGAAAACTTGAGA ACTTTGATCTTCCAGAAAAAATAATCAGTTCTGTTGTTTTCTATTTCCTCACTTGTCTTG TATCTTATCTCGAACTACTTGCAATTCTTCTTGAACGAGTTTCCAAAACTTGTATTAGCA TTTCGCAAAAATTCACATTATTTTGCAGTGGTGCAAAGTCTTTGAATTAGTAGATTTGTT ACGTAATATTCTGTGGCGTGACATGGCGTGATGTTGTAGAAAATTTAATCGACAAGCGAA TGCAAACAGACTATTGGATCATCGATTAAACTTAAGACGAAGATCCGACAGTTGCGTTGA TAGTTTAAGAGTTCGTCCACTCTTTGCCTTCCAGAATCTTTCACTAGATCTCTTTGTCTC TATCATCGACATGTGTTTTTCTTCAATTCACGTATATCATATTGCATAATTGCATACATA CGTGTAAGCAGCCTTATCTGCGACTATGAAATATTTAGCGATTGAATAATAAAAGATGGA ATCTGATGGATAAAATATTAATATTGATATTAATACAAATGGAGAAAAATTATGTAATAA AAGATTAATTTTGAAATAATATGTATAAAAAAATTAAATAGAATATGTC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)