These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1681#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 612 fasta sequence [TTTGTAACTCGTGGTATTCGTGAAACTTTAGAACGTCGTGTATGTCGTACAAATGTTTATTATCAAACATCTCAAGATCCAAATTCAAAAAATGAGGTTAAAACAAGTTTGATATGTAATCATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAAACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCAGAAGCCATAGGATGGGTAAATTGCGTCGTTTTGTTTATCTTTCATATTTATGATTTTTGCATTTAATATTTTTAAAATTTAATTTATATCTTTAAAGATAAAAATGTAAAAGTTTTTAAAATTTTGTGTATATTCTACATCGTAATATATTTTATTATTTCTAAATTTTTTCAATTATTCATTGTTTTTATTTTATTTTTTTTTCAATTCTTTAATTCATATTATAATTCGGTTTGTATTATATATATAATTATAGATATTTATTAAAATTATATAAATTTTTTAGACTTTAATCGTAAAACTTTTTAATATATTACTTATAATAATAGCAATAATAATACTAATTTTATTTTTTTAATAATTTTAATAAAT] [+] EMBL BI506169 [TTTGTAACTCGTGGTATTCGTGAAACTTTAGAACGTCGTGTATGTCGTACAAATGTTTATTATCAAACATCTCAAGATCCAAATTCAAAAAATGAGGTTAAAACAAGTTTGATATGTAATCATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAAACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCAGAAGCCATAGGATGGGTAAATTGCGTCGTTTTGTTTATCTTTCATATTTATGATTTTTGCATTTAATATTTTTAAAATTTAATTTATATCTTTAAAGATAAAAATGTAAAAGTTTTTAAAATTTTGTGTATATTCTACATCGTAATATATTTTATTATTTCTAAATTTTTTCAATTATTCATTGTTTTTATTTTATTTTTTTTTCAATTCTTTAATTCATATTATAATTCGGTTTGTATTATATATATAATTATAGATATTTATTAAAATTATATAAATTTTTTAGACTTTAATCGTAAAACTTTTTAATATATTACTTATAATAATAGCAATAATAATACTAATTTTATTTTTTTAATAATTTTAATAAAT] consensusID : consensus_1681#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 581 fasta sequence [AGGTTAAAACAAGTTTGAGATGTAATCATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAAACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCAGAAGCCATAGGATGGACAAGTGTATTAGCTGTTGGATGGGTAGTGTGTCAAACCTTATGTCTTCATAGGAGACTATTTGAAAAAGAGAAAACTGATTCTTTAAAAAATAAACTATTACAAGTGCCAGAAACATATAATTCTTACTTATTTGATCAAGTATTAAATTTAAAACCACATGTTCTACCTCTTATTAATTGTATTGGCAATAGTAAAATATATGCTCAAGAAAATAATGAAGAAGAATGGAAAGCTGATAAGCCATTTGGACCAATCACTAATGAAGAGGCTCTAAAAGAAGCCACTGAAGAATTTGCTAATACCCATAATTTTACTGTGGCTGAATTTGAACTTCATTATGGTTTAAAAGCTTTAGAAGAGAGACGTTATAAGGATGCTATAAGACATTTTACTGCTGGTGCAAATTTATCATCTGCT] [+] EMBL BI505412 [AGGTTAAAACAAGTTTGAGATGTAATCATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAAACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCAGAAGCCATAGGATGGACAAGTGTATTAGCTGTTGGATGGGTAGTGTGTCAAACCTTATGTCTTCATAGGAGACTATTTGAAAAAGAGAAAACTGATTCTTTAAAAAATAAACTATTACAAGTGCCAGAAACATATAATTCTTACTTATTTGATCAAGTATTAAATTTAAAACCACATGTTCTACCTCTTATTAATTGTATTGGCAATAGTAAAATATATGCTCAAGAAAATAATGAAGAAGAATGGAAAGCTGATAAGCCATTTGGACCAATCACTAATGAAGAGGCTCTAAAAGAAGCCACTGAAGAATTTGCTAATACCCATAATTTTACTGTGGCTGAATTTGAACTTCATTATGGTTTAAAAGCTTTAGAAGAGAGACGTTATAAGGATGCTATAAGACATTTTACTGCTGGTGCAAATTTATCATCTGCT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_1681#0 TTTGTAACTCGTGGTATTCGTGAAACTTTAGAACGTCGTGTATGTCGTACAAATGTTTAT 60 consensus_1681#1 ------------------------------------------------------------ consensus_1681#0 TATCAAACATCTCAAGATCCAAATTCAAAAAATGAGGTTAAAACAAGTTTGATATGTAAT 120 consensus_1681#1 ----------------------------------AGGTTAAAACAAGTTTGAGATGTAAT 26 ****************** ******* consensus_1681#0 CATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAA 180 consensus_1681#1 CATAAATTTTTACCACCAACTTTTTCCATCTTTAATAAAGAATTTTGTGGCTCAACAAAA 86 ************************************************************ consensus_1681#0 ACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCA 240 consensus_1681#1 ACTAGTGGTACAAAGGATAAAGATCATGATTCCAAGTGGAATACAAAATATACTTGGTCA 146 ************************************************************ consensus_1681#0 GAAGCCATAGGATGGGTAAAT---TGCGTCGTT---TTGTTTATCTTTCATATTTATGAT 294 consensus_1681#1 GAAGCCATAGGATGGACAAGTGTATTAGCTGTTGGATGGGTAGTGTGTCAAACCTTATGT 206 *************** ** * * * *** * * * * * *** * * * consensus_1681#0 TTTTGCATTTAATATTTTTAAAATTT--AATTTATATCTTTAAAGATAAAAATGTAAAAG 352 consensus_1681#1 CTTCATAGGAGACTATTTGAAAAAGAGAAAACTGATTCTTTAAAAAATAAACTATTACAA 266 ** * * *** **** ** * ******** * *** * * * * consensus_1681#0 TTTTTAAAATTTTGTGTATATTCTACATCGTAATATATTTTATTATTTCTAA--ATTTTT 410 consensus_1681#1 GTGCCAGAAACATATAATTCTTACTTATTTGATCAAGTATTAA-ATTTAAAACCACATGT 325 * * ** * * * ** ** * * * *** **** ** * * * consensus_1681#0 TCAATTATTCATTGTTTTTATTTTATTTTTTTTTCAATTCTTTAATTCATATTATAATTC 470 consensus_1681#1 TCTACCTCTTATTAATTGTATTGGCAATAGTAAAATATATGCTCAAGAAAATAATGAAGA 385 ** * * *** ** **** * * ** * * * ** ** * consensus_1681#0 GGTTTGTATTATATATATAATTATAGATATTTATTAAAATTATATAAATTTTTTAGACTT 530 consensus_1681#1 AGAATGGAAAGCTGATA-AGCCATTTGGACCAATCACTAATGAAGAGGCTCTAAAAGAAG 444 * ** * *** * ** * ** * * * * * * * * consensus_1681#0 TAATCGTAAAACTTTTTAATATATTACTTATAATAATAGCAATAAT-AATACTAATTTTA 589 consensus_1681#1 CCACTGAAGAATTTGCTAA-----TACCCATAATTTTACTGTGGCTGAATTTGAACTTCA 499 * * * ** ** *** *** ***** ** * *** ** ** * consensus_1681#0 TTTT--TTTAATAATTTTAATAAAT----------------------------------- 612 consensus_1681#1 TTATGGTTTAAAAGCTTTAGAAGAGAGACGTTATAAGGATGCTATAAGACATTTTACTGC 559 ** * ***** * **** * * consensus_1681#0 ---------------------- consensus_1681#1 TGGTGCAAATTTATCATCTGCT 581 |
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