These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_186#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 608 fasta sequence [TCTCAGTCTTTTTTCGAATAGTTTGAATATCTATTGAAGTTTAACACGTATTTAGCCAATATGAAAATCTATTTTATTGTCGGCCTTCTCTTCATGGCTATGGTTGCTATCATGGCTGCACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAATAATATAAGTAAATTATCTTTTGGTTTAATTTCTTTAAAGTATTATCTTTTGAATAAATAAATTTTTTTATATAGATAAATTAGATAATAATAGAAAATAAATTTTTTTTCTAAATATAAAAAAAAA] [+] EMBL AM15955 [TCTCAGTCTTTTTTCGAATAGTTTGAATATCTATTGAAGTTTAACACGTATTTAGCCAATATGAAAATCTATTTTATTGTCGGCCTTCTCTTCATGGCTATGGTTGCTATCATGGCTGCACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGTTGGATGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAAT ] [+] EMBL BI504686 [ ATTGTCGGCCTTCTCTTCATGGCTATGGTTGCTATCATGGCTGCACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAATAATATAAGTAAATTATCTTTTGGTTTAATTTCTTTAAAGTATTATCTTTTGAATAAATAAATTTTTTTATATAGATAAATTAGATAATAATAGAAAATAAATTTTTTTTCTAAATATAAAAAAAAA] [+] EMBL BI505342 [ TGCTATCATGGCTGCACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATG ] consensusID : consensus_186#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 459 fasta sequence [ACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAATAATATAAGTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL BI516384 [ACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAATAATATAAGTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL BI516540 [ACCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATT ] [+] EMBL BI504906 [ TGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGACATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGCGCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATTTGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGAAGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGAAAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAAATAATATAAGTAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA ] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_186#0 TCTCAGTCTTTTTTCGAATAGTTTGAATATCTATTGAAGTTTAACACGTATTTAGCCAAT 60 consensus_186#1 ------------------------------------------------------------ consensus_186#0 ATGAAAATCTATTTTATTGTCGGCCTTCTCTTCATGGCTATGGTTGCTATCATGGCTGCA 120 consensus_186#1 -----------------------------------------------------------A 1 * consensus_186#0 CCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGA 180 consensus_186#1 CCTGTTGAGGATGAATTCGAGCCACTTGAGCATTTTGAGAATGAAGAACGTGCCGACAGA 61 ************************************************************ consensus_186#0 CATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGC 240 consensus_186#1 CATAGAAGAGTAACTTGTGACCTTCTCTCATTCAAAGGACAAGTTAATGACAGTGCTTGC 121 ************************************************************ consensus_186#0 GCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATT 300 consensus_186#1 GCTGCTAACTGTCTCAGTTTGGGTAAAGCTGGAGGTCATTGCGAGAAAGGAGTTTGTATT 181 ************************************************************ consensus_186#0 TGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGA 360 consensus_186#1 TGTCGAAAAACCAGTTTCAAAGATCTCTGGGACAAACGTTTCGGTTAAGTGCCATTATGA 241 ************************************************************ consensus_186#0 AGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGA 420 consensus_186#1 AGATTCAACGATGAAATTTTTTAACAAAAAATATGAAAACGCGAAATGATTAAGAAATGA 301 ************************************************************ consensus_186#0 AAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAA 480 consensus_186#1 AAAATGAAAAACTGTATTATCATTGAAAATTCTATGAACTTTAATTTACTTATTTAATAA 361 ************************************************************ consensus_186#0 ATAATATAAGTAAATTATCTTTTGGTTTAATTTCTTTAAAGTATTATCTTTTGAATAAAT 540 consensus_186#1 ATAATATAAGTAAATTAA-----AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 416 ***************** ** *** * * ** *** consensus_186#0 AAATTTTTTTATATAGATAAATTAGATAATAATAGAAAATAAATTTTTTTTCTAAATATA 600 consensus_186#1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA----------------- 459 *** * * * * *** * * ** ** * **** *** consensus_186#0 AAAAAAAA 608 consensus_186#1 -------- |
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