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Apis mellifera
cluster # 190 cluster # 190       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_190#0 length = 687 sequences # 6  

consensusID : consensus_190#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 687
fasta sequence
                              [AGATTCCTGGAGGATTAGTGGGTGTCGTTGGTGATAATTGTACAAGTTTAGATTTATCTTATAATGAACTAACCTCCATCATTGCTGTCAAATACTTCGAAAACCTACAGGAACTGATACTCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGAAGGAAACCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAATGTAAATTGAGTAAGTCAAAATATTTT]

[+] EMBL BI509295             [AGATTCCTGGAGGATTAGTGGGTGTCGTTGGTGATAATTGTACAAGTTTAGATTTATCTTATAATGAACTAACCTCCATCATTGCTGTCAAATACTTCGAAAACCTACAGGAACTGATACTCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGNAGCATTTGGAAAATGT                                                                                           ]
[+] EMBL BI509857             [                                                                                           ATACTTCGAAAACCTACAGGAACTGATACTCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACGTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGANNGAAATCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAATGTAAATTGAGTA              ]
[+] EMBL BI510039             [                                                                                           ATACTTCGAAAACCTACAGGAACTGATACTCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACGTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATT                                                                              ]
[+] EMBL BI504274             [                                                                                                           CAGGAACTGATACTCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTACTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATATTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGAAGGAAATCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAATGTAAATTGAGTAAGTCAAAATATTTT]
[+] EMBL BI504522             [                                                                                                                                AATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGAAGGAAACCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAATGTAAATTGAGTAAGTCAA        ]
[+] EMBL BI508844             [                                                                                                                                                 AAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTCTCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAATGTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTACTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAACGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATACGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAGATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGAAATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTCCTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAATATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGAAGGAAACCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAATGTAAATTGAGTAAGTCAA        ]


>consensus_190#0 AGATTCCTGGAGGATTAGTGGGTGTCGTTGGTGATAATTGTACAAGTTTAGATTTATCTT ATAATGAACTAACCTCCATCATTGCTGTCAAATACTTCGAAAACCTACAGGAACTGATAC TCGATAATAATAAACTTCGGGATTTAAAGACATTACCTCATATACAAAATTTGACCACTC TCAGTTTAAACAATAACAAGATAACAGATATAGACAACGCATTGAGGAGAATACAAGAAT GTTGTCCAAAAATAATGTACGTGAGTTTATTGGGTAATCCAGGATGTCCCGATCAGTTAA CGAATCCAACCTCAACCGATGACGAGGATTATAATCGTTATAGACTCTATGCTATATATA CGTTACCTTCGACACTTCGATTTTTGGATTCACGTCCAGTGACGATGCAGGAACGAAAAG ATGCCGAAAGACGAGGAAAATACTCGAGGACTATTAAAATGGTTCCAGATTTATCACAGA AATTCGTTTCAAATACAATTGAAGATTTCGATGATATATTCTTCAATATTCATTATACTC CTTTACCAAGATCAATCCGCAATCCCCTTGATCACAAAGGAGCATTTGGAAAATGTAAAT ATCGATATTCTGGAAAGAATTCAGAAGGAAACCGGTTCATTTCTAATAATGATCTTTGAA TGTAAATTGAGTAAGTCAAAATATTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)