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Apis mellifera
cluster # 1977 cluster # 1977       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_1977#0 length = 1021 sequences # 2  

consensusID : consensus_1977#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 1021
fasta sequence
                              [TTTTTTAAGTGATCCAGAATTACAAAATAATATACCAGTAAAATATAAAAGTCATAAAGAGATATATGAAGATGCTGTACGAAAAGTATGTAGAGTTTTATATAAACTTAGAAAATTGCAAGAAACAGGAAAAGCGGGTATGGATGATTTTACTCATATTTTTGGAGCTAAACTTGGATCTGCGATATTAAAAGATGGAAATCCACTGGTATTGCATTATGCCATGTTTTTACCATCTATTATGGGACAAGGAACTACAAAACAACAAGAATATTGGATAACTAGATCTTGGAATGGTGATGTTATAGGAACATATGCTCAAACTGAATTAGGTCATGGAACATTTATCAGAGGTTTAGAAACTACAGCGATATACGATTCTAAAACAAAAGAATTCATTTTGAACAGTCCTACTTTAACGTCTTATAAATGGTGGCCAGGAGGATTGGGACATACTGCAAATCATGCGATAGTTGTTGCACAATTATACACACAAGGGGAATGTAAAGGTATTCATCCCTTTATTGTACAATTAAGAGATGTGAATACACATGAACCCTTACCAGGTATTAAAATTGGAGAAATTGGTATAAAATTGGGAATGAATGGTACCAATAATGGTTTTCTTGGATTCGAAAATTTCAGAATACCACGAGAGAATATGTTGATGAAGAATTCTAAGGTTTTAGAAGATGGAACATATGTAAAAGCATTGAATGATAAATTAACATATGGTACAATGGTATTCGTTCGAGTAGTGTTAGTATATGATATCGTAACTTATTTATCAAAAGCTGTTACTATTTCGATTCGATATAGTGCAGTGAGACGTCAGGGTCAAATAAATTCGGAAAAACCTGAAGTACAAATCCTTGATTATGTAACACAACAATACAAAATTTTTCCTCATCTTGCTACATGTTTTGCATTTAAAATAACTGCTAATTGGATATGGGACATGTACAATGTTATCAATGTTGAAATGGATCATGGAGAATTAGATAGATTACCAGAGTTACAT]

[+] EMBL BI509852             [TTTTTTAAGTGATCCAGAATTACAAAATAATATACCAGTAAAATATAAAAGTCATAAAGAGATATATGAAGATGCTGTACGAAAAGTATGTAGAGTTTTATATAAACTTAGAAAATTGCAAGAAACAGGAAAAGCGGGTATGGATGATTTTACTCATATTTTTGGAGCTAAACTTGGATCTGCGATATTAAAAGATGGAAATCCACTGGTATTGCATTATGCCATGTTTTTACCATCTATTATGGGACAAGGAACTACAAAACAACAAGAATATTGGATAACTAGATCTTGGAATGGTGATGTTATAGGAACATATGCTCAAACTGAATTAGGTCATGGAACATTTATCAGAGGTTTAGAAACTACAGCGATATACGATTCTAAAACAAAAGAATTCATTTTGAACAGTCCTACTTTAACGTCTTATAAATGGTGGCCAGGAGGATTGGGACATACTGCAAATCATGCGATAGTTGTTGCACAATTATACACACAAGGGGAATGTAAAGGTATTCATCCCTTTATTGTACAATTAAGAGATGTGAATACACATGAACCCTTACCAGGTATTAAAATTGGAGAAATTGGTATAAAATTGGGAATGAATGGTACCAATAATGGTTTTCTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI504460             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGGGACATACTGCAAATCATGCGATAGTTGTTGCACAATTATACACACAAGGGGAATGTAAAGGTATTCATCCCTTTATTGTACAATTAAGAGATGTGAATACACATGAACCCTTACCAGGTATTAAAATTGGAGAAATTGGTATAAAATTGGGAATGAATGGTACCAATAATGGTTTTCTTGGATTCGAAAATTTCAGAATACCACGAGAGAATATGTTGATGAAGAATTCTAAGGTTTTAGAAGATGGAACATATGTAAAAGCATTGAATGATAAATTAACATATGGTACAATGGTATTCGTTCGAGTAGTGTTAGTATATGATATCGTAACTTATTTATCAAAAGCTGTTACTATTTCGATTCGATATAGTGCAGTGAGACGTCAGGGTCAAATAAATTCGGAAAAACCTGAAGTACAAATCCTTGATTATGTAACACAACAATACAAAATTTTTCCTCATCTTGCTACATGTTTTGCATTTAAAATAACTGCTAATTGGATATGGGACATGTACAATGTTATCAATGTTGAAATGGATCATGGAGAATTAGATAGATTACCAGAGTTACAT]


>consensus_1977#0 TTTTTTAAGTGATCCAGAATTACAAAATAATATACCAGTAAAATATAAAAGTCATAAAGA GATATATGAAGATGCTGTACGAAAAGTATGTAGAGTTTTATATAAACTTAGAAAATTGCA AGAAACAGGAAAAGCGGGTATGGATGATTTTACTCATATTTTTGGAGCTAAACTTGGATC TGCGATATTAAAAGATGGAAATCCACTGGTATTGCATTATGCCATGTTTTTACCATCTAT TATGGGACAAGGAACTACAAAACAACAAGAATATTGGATAACTAGATCTTGGAATGGTGA TGTTATAGGAACATATGCTCAAACTGAATTAGGTCATGGAACATTTATCAGAGGTTTAGA AACTACAGCGATATACGATTCTAAAACAAAAGAATTCATTTTGAACAGTCCTACTTTAAC GTCTTATAAATGGTGGCCAGGAGGATTGGGACATACTGCAAATCATGCGATAGTTGTTGC ACAATTATACACACAAGGGGAATGTAAAGGTATTCATCCCTTTATTGTACAATTAAGAGA TGTGAATACACATGAACCCTTACCAGGTATTAAAATTGGAGAAATTGGTATAAAATTGGG AATGAATGGTACCAATAATGGTTTTCTTGGATTCGAAAATTTCAGAATACCACGAGAGAA TATGTTGATGAAGAATTCTAAGGTTTTAGAAGATGGAACATATGTAAAAGCATTGAATGA TAAATTAACATATGGTACAATGGTATTCGTTCGAGTAGTGTTAGTATATGATATCGTAAC TTATTTATCAAAAGCTGTTACTATTTCGATTCGATATAGTGCAGTGAGACGTCAGGGTCA AATAAATTCGGAAAAACCTGAAGTACAAATCCTTGATTATGTAACACAACAATACAAAAT TTTTCCTCATCTTGCTACATGTTTTGCATTTAAAATAACTGCTAATTGGATATGGGACAT GTACAATGTTATCAATGTTGAAATGGATCATGGAGAATTAGATAGATTACCAGAGTTACA T



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)