These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_202#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1123 fasta sequence [GCAACCCATTCTCGAACCAGCTTCTCACTTCGATGCGCAATCTTTTCCCCTTGAACATATCGTCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTA---CGTCGTTGAAGTTTCTCAA-TTTTTTTTTAAAACAAAGATATA-AAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAA-GGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAATTCTTTATTAAAATTACGTGTGTGATATGTTAGAGTATGTTTCATAAAAATTAATAATATAGACAATATAGATTAAAAAGTATGAAAAGTATTAAGTAGTAACGAGCTAATAAAATTAACACAATAATATAAATATTTTAAGAAAATTGCTTATAGATTATTAGATAC] [+] EMBL BI511040 [GCAACCCATTCTCGAACCAGCTTCTCACTTCGATGCGCAATCTTTTCCCCTTGAACATATCGTCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTATATCGTCGTTAAAGTTTCTCAATTTTTTTTTTACAACAAAGTTATA TAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAA GGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAANNCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAA ] [+] EMBL BI508268 [ TCCAAACTTCATCAACTGGATTCTAGAAATAAAAGATGAAAGAGAGAAATGAAAAATAATTCCTGTTA TCGTTGAAGTTTCTCAA TTTTTTTTTAAAACAAAAATATAGAAAAAAATAAATAATTGTTCAAATTAAATGGTCCAAGGGAATAATAATTTATGAAAAATGCCACGAGATTATTTTTTCAAATGCCAGATAATAGATTTGTGACAATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGATGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGA GATTGAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAA AGAGAGAGAGAGAGGGAATGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCAAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGATCAACACTGTCCGATTACAC ] [+] EMBL BI505424 [ AGATTATTTTTTCAAATGCGAGATAATAGATTTGTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCTTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGAT ] [+] EMBL BI510261 [ GTGACGATGGAAAATGTGATGCATAATCGATTCGACGATGAGAATTTCGGCTTGTTCGAGATGTGTAAAGAGGATGAAAAGGGTGTCTGTCGTGGAACGATGCATAAACTCGATATCAGGAAGTATTGAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGTGGAGAATGGTTAAGGCAAGAGATAATGAATATTCGTGTGACGTTGTCATTCGACATTGAAAATCGCATTTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAA ] [+] EMBL BI505041 [ TTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAATTCTTTATTAAAATTACGTGTGTGATATGTTAGAGTATGTTTCATAAAAATTAATAATATAGACAATATAGATTAAAAAGTATGAAAAGTATTAAGTAGTAACGAGCTAATAAAATTAACACAATAATATAAATATTTTAAGAAAATTGCTTATAGATTATTAGATAC] [+] EMBL BI515935 [ TTTTTAAACGAGGCTTACCATCGAGACAAGATGAATGTTTTGCATACATGTATCTTGAAGAGTGCATGATCATTGGAAAGATTCTTGCATGGATCGAGCACTTGGAAAATTGTTCAACACTGTTCGATTACACTGATTACACTCAACATTTTATTGGATACACAAGTTCTTTCTTGATCTTAAAATTCTCTTCAAAAACTGTCGCTAAAGTTTCTTCTCAATTGTTGAAAATTTTGAACGTATCATCAGTTTTTCCAAGAAAACTGCGTTCACTTCCTTTTTATGATGGCTTTCCTCTCTCTCTATGATAAAGAGAAATAAGATCCAGAGAAAAAGAGTCAGTAGATATAGAGCTTAATAGATTTTTAGAAGATATTGCTATAGATTCTTTTTTAAATATAATTATAATATTTAATTCAAAATATATAATTTAAAAAGGAGAAAAAAAATTAAGAAGTTAGTAAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |