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Apis mellifera
cluster # 212 cluster # 212       Sequences # 6       consensus # 2


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_212#0 length = 736 sequences # 5  
consensus_212#1 length = 556 sequences # 1  

consensusID : consensus_212#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 736
fasta sequence
                              [TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAAAATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGGATGA]

[+] EMBL BI506189             [TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAAAATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTA                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI507877             [                                                                                                    TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGT                                                          ]
[+] EMBL BI508827             [                                                                                                               GAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTA                             ]
[+] EMBL BI508607             [                                                                                                                               ATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCTCTGGTGTGAATTAGCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGGATGA]
[+] EMBL BI508874             [                                                                                                                               ATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCTCTGGTGTGAATTAGNTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCAATTAATATTTGTTATGGTCGACATCATCCCCAAAATTGG    ]


>consensus_212#0 TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAA AATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAA TCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATG GGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAA CATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAA AAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAA GAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTA GCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATGTGTGAGCTTGCTCAACGACAT GGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTTATGG AATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAATCAT ATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGGTCAT TCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACATCAT CCCCAAAATTGGATGA



consensusID : consensus_212#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 556
fasta sequence
                              [TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATATACTTATATGATTTGATAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTATATTCTGAATGAATTTATTATGTGCTTCTTTAATATCTATTTAATTTGATGATAATTTTGCATATATTGTATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGAATCTTCTTTTAATAATTTTCATTTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAATAATTTTTTATAAAATT]

[+] EMBL BI506066             [TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATATACTTATATGATTTGATAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTATATTCTGAATGAATTTATTATGTGCTTCTTTAATATCTATTTAATTTGATGATAATTTTGCATATATTGTATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGAATCTTCTTTTAATAATTTTCATTTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAATAATTTTTTATAAAATT]


>consensus_212#1 TATATGGCCGCGAATTACAATCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCG ATGTTCAAGGATATATTATGGGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTG TTCGTGTCGGCTTAATTCAACATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAAC AAAGAAATGCTTTGCATCAAAAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTG TTAATATACTCTGTCTTCAAGAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAA ATTATAATAATAAAAAAATATACTTATATGATTTGATAGTTTACATTAAATACAAATGAA ATTGAAAGTTTAATTTTATATTCTGAATGAATTTATTATGTGCTTCTTTAATATCTATTT AATTTGATGATAATTTTGCATATATTGTATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGAT TAGATAAGAATCTTCTTTTAATAATTTTCATTTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAAT AATTTTTTATAAAATT



consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_212#0      TTTTATAATAAAATGAATAACTTAATGTTTGATCAAACACTTGAAGATATTTTGGAAAAA 60
consensus_212#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                 

consensus_212#0      AATCTTCCAGAAAAGGAGCTAGCTGAAGTAAAACGCCTTTTATATGGCCGCGAATTACAA 120
consensus_212#1      ----------------------------------------TATATGGCCGCGAATTACAA 20
                                                             ********************

consensus_212#0      TCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATG 180
consensus_212#1      TCTTTAAATCTTCCGCAATGGAATGGAAGTCAAGATCTCGATGTTCAAGGATATATTATG 80
                     ************************************************************

consensus_212#0      GGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAA 240
consensus_212#1      GGTGGTAGCGTCACAGAGCAATTACGTCCTCCGCGTCTTGTTCGTGTCGGCTTAATTCAA 140
                     ************************************************************

consensus_212#0      CATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAA 300
consensus_212#1      CATTCTATAGTTTTACCAACTACAGAACCTTTGCAGAAACAAAGAAATGCTTTGCATCAA 200
                     ************************************************************

consensus_212#0      AAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAA 360
consensus_212#1      AAAATTCAAAAATATGTCGATTACGCCGCAACTTGTGGTGTTAATATACTCTGTCTTCAA 260
                     ************************************************************

consensus_212#0      GAAGCTTGGGCTATGCCATTTGTTTTCTGTACCAGAGAGAAATACCCCTGGTGTGAATTA 420
consensus_212#1      GAAGCTTGGGGTATGTTTCAAAATTTATAAAATAAAAAAAATTATAATAATAAAAAAATA 320
                     ********** ****        *** *  *  * * * ** **           ** **

consensus_212#0      GCTGAAGATGCTGAAAATGGACCAACCATAATACTCATG----TGTGAGCTTGCTCAACG 476
consensus_212#1      TACTTATATGATTTGA-TAGTTTACATTAAATACAAATGAAATTGAAAGTTTAATTTTAT 379
                          * *** *   * * *   *     *****  ***    **  ** **  *     

consensus_212#0      ACATGGAATGGTTATTGTATGCCCAATTCTTGAGAGAGATAATATGAATAGTGAAACTTT 536
consensus_212#1      ATTCTGAATGAATTTATTATGTGC--TTCTTTA-ATATCTATTTAATTTGATGATAATTT 436
                     *    *****  * *  ****  *  ***** * * *  ** *     *  *** * ***

consensus_212#0      ATGGAATACTTCTGTTGTGATTGGTAATGATGGAAATGTGCTTGGAAAGAGTAGAAAAAA 596
consensus_212#1      ------TGCATATATTGT-ATAATTCAAATCTTAAATTAGTTCAAAAAGATTAGATAAGA 489
                           * * * * **** **   * *      ****  * *   ***** **** ** *

consensus_212#0      TCATATTCCTCGCGTAGGAGATTTTAATGAATCTACTTACTACATGGAAGGAAATACAGG 656
consensus_212#1      --ATCTTCTTTTAATA----ATTTTCAT---TTTTCTTATAATTTAATAGTTTATTTAA- 539
                       ** *** *    **    ***** **   * * ****  *  *   **   **  *  

consensus_212#0      TCATTCTGTCTTTGATACATGTTTTGGACGTATAGCANTTAATATTTGTTATGGTCGACA 716
consensus_212#1      TAATTTTTTATAAAATT------------------------------------------- 556
                     * *** * * *   **                                            

consensus_212#0      TCATCCCCAAAATTGGATGA 736
consensus_212#1      --------------------
                                         




Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)