These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2205#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 579 fasta sequence [TATATTATTGGCTGAGCAGCCGTCTCTACTGACGGCATGTTTCAAATGTTTACCAATTATAAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAATCACATGAAATTCGATCTTATAAGAACGACTTTTATTGGAACACAGAAGAGGATTGATTTATTATGAAGCAGAGCAATACTGTTTCCGTTGATTTTATGAATAATATCACTAATGATATATTCATAACACTATGACTATTTTTATTTTTACATAAAGTACGAAACATCATTACTGCGTTTTCATAATCAGTGAAATATTAAATATTCCTATTCAACGATGTTTCTATAATATTTTAAAAAAATTCATTTTAAAAAATGAAAAAAAAATATAATTAAAAAGTCACCTGAAAATATATACCTTTTCGAGACGAATATTGACAGGATTAATATTCAGTTGTATAGGAGATGCATTATTGGTTTGGCCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGNTTATGTACATCAGTGCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATAT] [+] EMBL BI503859 [TATATTATTGGCTGAGCAGCCGTCTCTACTGACGGCATGTTTCAAATGTTTACCAATTATAAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAATCACATGAAATTCGATCTTATAAGAACGACTTTTATTGGAACACAGAAGAGGATTGATTTATTATGAAGCAGAGCAATACTGTTTCCGTTGATTTTATGAATAATATCACTAATGATATATTCATAACACTATGACTATTTTTATTTTTACATAAAGTACGAAACATCATTACTGCGTTTTCATAATCAGTGAAATATTAAATATTCCTATTCAACGATGTTTCTATAATATTTTAAAAAAATTCATTTTAAAAAATGAAAAAAAAATATAATTAAAAAGTCACCTGAAAATATATACCTTTTCGAGACGAATATTGACAGGATTAATATTCAGTTGTATAGGAGATGCATTATTGGTTTGGCCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGNTTATGTACATCAGTGCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATAT] consensusID : consensus_2205#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 463 fasta sequence [TTTACCAATTATAAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAATATACCTTTTCGAGACGAATATTGACAGGATTAATATTCAGTTGTATAGGAGATGCATTATTGGTTTGGCCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGATTATGTACATCAGTGCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATATGCGATGTGTTCGCTAGTCATATATACTTTAATGCCTGGTCTAAATGGAATTCTGGTCGTTGGAGTTCCAGTTTACACAATATTATTAACTACTATGGCATGGAGAGCAATTTCTAGAGTACAATTTTACAAAGAATTATGGACGTGGACTAAATTATGTAGCTGCATCGGCAGTATATGTTTTCTTATATCTGATACTTTACTTGGATTTCACTATTTTCATACA] [+] EMBL BI511586 [TTTACCAATTATAAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAATATACCTTTTCGAGACGAATATTGACAGGATTAATATTCAGTTGTATAGGAGATGCATTATTGGTTTGGCCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGATTATGTACATCAGTGCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATATGCGATGTGTTCGCTAGTCATATATACTTTAATGCCTGGTCTAAATGGAATTCTGGTCGTTGGAGTTCCAGTTTACACAATATTATTAACTACTATGGCATGGAGAGCAATTTCTAGAGTACAATTTTACAAAGAATTATGGACGTGGACTAAATTATGTAGCTGCATCGGCAGTATATGTTTTCTTATATCTGATACTTTACTTGGATTTCACTATTTTCATACA] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_2205#0 TATATTATTGGCTGAGCAGCCGTCTCTACTGACGGCATGTTTCAAATGTTTACCAATTAT 60 consensus_2205#1 ------------------------------------------------TTTACCAATTAT 12 ************ consensus_2205#0 AAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAATCACATGAAAT 120 consensus_2205#1 AAGTCTTATCGTTTTTGTTCTGCTACATGGAATTAATTTATCGCAGGAAT-ATACCTTTT 71 ************************************************** * * * consensus_2205#0 TCGATCTTATAAGAAC--GACTTTTATTGGAACACAGAAGAGGATTGATTTATTATGAAG 178 consensus_2205#1 CGAGACGAATATTGACAGGATTAATATTCAGTTGTATAGGAG-ATGCATTATTGGTTTGG 130 * *** ** ** * **** * * *** ** *** * * * consensus_2205#0 CAGAGCAATACTGTTTCCGTTGATTTTATGAATAATATCACTAATGATATATTCATAACA 238 consensus_2205#1 CCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGATTATGTACATCAGT 190 * ** * * * * *** * * * ** * *** * *** * consensus_2205#0 CTATGACTATTTTTATTTTTACATAAAGTACGAAACATCATTAC---TGCGTTTTCATAA 295 consensus_2205#1 GCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATATGCGATGTGTTCG 250 ** *** ** * *** * * * * * *** **** * * * consensus_2205#0 TCAGTGAAATATTAAATATT-CCTATTCAACGATGTTTCTATAATATTTTAAAAAAATTC 354 consensus_2205#1 CTAGTCATATATACTTTAATGCCTGGTCTA-AATGGAATTCTGGTCGTT---GGAGTTCC 306 *** * **** ** * *** ** * *** * * * ** * * * consensus_2205#0 ATTTTAAAAAATGAAAAAAA--AATATAATTAAAAAGTCACCTGAAAATATATACCTTTT 412 consensus_2205#1 AGTTTACACAATATTATTAACTACTATGGCATGGAGAGCAATTTCTAGAGTACAATTTTA 366 * **** * *** * ** * *** * ** * * ** * *** consensus_2205#0 CGAGACGAATATTGACA-GGATTAA--TATTCAGTTGTATAGGAGATGCATTATTGGTTT 469 consensus_2205#1 CAAAG-AATTATGGACGTGGACTAAATTATGTAGCTGCATCGGCAGTATATGTTTTCTTA 425 * * * *** *** *** *** *** ** ** ** ** * ** ** ** consensus_2205#0 GGCCCAGTTGTTTCACACCTGGAATGTGCATGTTTGCTTTAGCTCAGNTTATGTACATCA 529 consensus_2205#1 TATCTGATACTTT---ACTTGGATTTCACTATTTTCATACA------------------- 463 * * *** ** **** * * *** * * consensus_2205#0 GTGCATTCGGTTTTATACCGCTTAATATAATGCTAGGTACAATTTTATAT 579 consensus_2205#1 -------------------------------------------------- |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |