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Apis mellifera
cluster # 23 cluster # 23       Sequences # 13       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_23#0 length = 822 sequences # 13  

consensusID : consensus_23#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 13
consensus length = 822
fasta sequence
                              [TTTAAATATATCTATTTTAATCATTTGCAATCTTTGATTTTATAAAAAAATACGAGGATGTTGATGCCAAAAAAGAATCGTGTAGCAATTTATGAATATCTCTTTAAAGAAGGTGTTATGGTTGCAAAAAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCCTTACTTAAATAATAATTTTAATATATAAAAATTTTAAATAGTTAAATAAATTTAATAAGTAACATTAAGAAAAGTAAAGTCAAAAAAACAAATTTATTGTAATAATTCTTTACATCTTTTATTGCATTATAAAAGTGTACATTCAATTACAAATTGTATAGTTATATTATTAATACATAAATTTATAAATGGAAGCAAAAAAAACAAGTTGTATACAATTACAAAA]

[+] EMBL BI504579             [TTTAAATATATCTATTTTAATCATTTGCAATCTTTGATTTTATAAAAAAATACGAGGATGTTGATGCCAAAAAAGAATCGTGTAGCAATTTATGAATATCTCTTTAAAGAAGGTGTTATGGTTGCAAAAAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI504405             [TTTAAATATATCTATTTTAATCATTTGCAATCTTTGATTTTATAAAAAAATACGAGGATGTTGATGCCAAAAAAGAATCGTGTAGCAATTTATGAATATCTCTTTAAAGAAGGTGTTATGGTTGCAAAAAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI512963             [                                                                                                                GTGTTATGGTTGCAAAAAAAGATTATTATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI504039             [                                                                                                                     ATGGTTGCAAAAAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATAAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI504502             [                                                                                                                                AAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATATATAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI505206             [                                                                                                                                         TCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAA                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL BI507985             [                                                                                                                                                          CAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTTCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATATATATGTCTAATATTTAATTCCTTACTTAAATAATAATTTTAATATATAAAAATTTTAAATAGTTAAATAAATTTAATAAGTAACATTAAGAAAAGTAAAGTCAAAAAAACAAATTTATTGTAATAATTCTTTACATCTTTTATTGCATTATAAAAGTGTACATTCAATTACAAATTGTATAGTTATATTATTAATACATAAATTTATAAATGGAAGCAAAAAAAACAAGTTGTATACAATTACAAAA]
[+] EMBL BI504576             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATNNNAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI504303             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATNNNAAAAAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI503617             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATATAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI507143             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGTCAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAANAAAAGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI506445             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACAAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTCGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL BI508243             [                                                                                                                                                                                   TCAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCTTGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTGCATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACAAGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCTGGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGTGCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATATTTTAATGTAAAATA                                                                                                                                                                                                                                                                            ]


>consensus_23#0 TTTAAATATATCTATTTTAATCATTTGCAATCTTTGATTTTATAAAAAAATACGAGGATG TTGATGCCAAAAAAGAATCGTGTAGCAATTTATGAATATCTCTTTAAAGAAGGTGTTATG GTTGCAAAAAAAGATTATCATGCACCAAAACATCCAGAATTAGAATGTATTCCTAATCTT CAAGTTATTAAGGCTATGCAGTCTTTAAAATCTAAAGGATTTGTCAAAGAACAATTTGCT TGGAGACATTTTTATTGGTATTTGACAAATGAAGGTATTGAATATTTACGTGGATATTTG CATTTACCTCCTGAAATTGTACCTTCCACACTTAAGAGACAAACGAGATCAGAAACAACA AGGCCAAGACCTGCAGCAGGTGCAAGAAGTGAAGCATCTAGACCTACAGAAGATCGTGCT GGATATAGACGAGGTCCAGGAGGTCCAGCAGGTCCTGGTGATAAAAAAGCTGATGTTGGT GCTGGTACAGGAGATGTTGAATTTCGCGGTGGTTTTGGACGTGGTAAACCACAATAATAT TTTAATGTAAAATAATAAATAAAATTTAATAATAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCCTTAC TTAAATAATAATTTTAATATATAAAAATTTTAAATAGTTAAATAAATTTAATAAGTAACA TTAAGAAAAGTAAAGTCAAAAAAACAAATTTATTGTAATAATTCTTTACATCTTTTATTG CATTATAAAAGTGTACATTCAATTACAAATTGTATAGTTATATTATTAATACATAAATTT ATAAATGGAAGCAAAAAAAACAAGTTGTATACAATTACAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)