These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2306#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 581 fasta sequence [TATATGTATATATATATTTACAATTATTTAAATCTTTCGACATATAATGAATTTTATTATTAATTAATATTTGATTTTAAATATTTATAATTTAAAATATATTTATAATTCTACGATTACTTAACCAATATTTTAATTATTTTAAATTAATTTAATAAATTTATTAAATAATTATTATTATATTAAACTTATTTATTTAATAATTTTCTATTTTTAAAATGAAAAATTCAATAAGAATTATAAAAAAAAAATTGATTACATTGCTCATATTCGCAAATATAATAACATTATGTTCTATAGTTGAAAGTTCTGAAATAGATAATTCAAATGAAGAATCTTGTCATTGTAATAGTCGTACTTTTGACAGACAAACAAATATAAAGAATTATTATAAGAAAGAAATACAAGATTCTTGTTTGGCGAATGATATTCTTCATGTTTATGCAAAGACTGTGAATTCTATAAATCATTTAAAAAACATGATTAAGATAAAGNNNGGTATTTTTGGGATTGGTACAAACGATCCAATTTTTATTGCTGATGGCGAAGGACCAAAACAGCAAATATATTTAAATAGTTTT] [+] EMBL BI507747 [TATATGTATATATATATTTACAATTATTTAAATCTTTCGACATATAATGAATTTTATTATTAATTAATATTTGATTTTAAATATTTATAATTTAAAATATATTTATAATTCTACGATTACTTAACCAATATTTTAATTATTTTAAATTAATTTAATAAATTTATTAAATAATTATTATTATATTAAACTTATTTATTTAATAATTTTCTATTTTTAAAATGAAAAATTCAATAAGAATTATAAAAAAAAAATTGATTACATTGCTCATATTCGCAAATATAATAACATTATGTTCTATAGTTGAAAGTTCTGAAATAGATAATTCAAATGAAGAATCTTGTCATTGTAATAGTCGTACTTTTGACAGACAAACAAATATAAAGAATTATTATAAGAAAGAAATACAAGATTCTTGTTTGGCGAATGATATTCTTCATGTTTATGCAAAGACTGTGAATTCTATAAATCATTTAAAAAACATGATTAAGATAAAGNNNGGTATTTTTGGGATTGGTACAAACGATCCAATTTTTATTGCTGATGGCGAAGGACCAAAACAGCAAATATATTTAAATAGTTTT] consensusID : consensus_2306#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 512 fasta sequence [CTGATGGCGAAGGACCAAAACAGCAAATATATTTAAATAGTTTTTATATAGATAAGACGGAAGTGAGTAATCACGATTTTTCAAAATTCGTTGATGCCACTAATTATAAAACAGAAGCAGAAAGATTTGGAGATTCATTCGTATTTAGAGGTTTATTAAAACAAAAAGATCAAAAAAATATAACACTTGTTGTTGCTCAAGCTCCTTGGTGGCTACAAGTAAAAAATGCAAATTGGCTGCATCCAGAGGGTCCTGAATCAGATATTAAGAGTATGATTCATTTTTTGATTGCTTATTACGTAATTGGAAATAGCAACAATTAAAATTGAATAATCCAGATAGAATGGATCATCCTGTTATTCATGTATCATGGAATGATGCTATTGCCTATTGCAATTGGTTAGGAAAACGATTGCCTACTGAAGCAGAATGGGAAGTTGCATGTCGAGGAGGATTGTCGGATAGATTATATCCATGGGGAAATAAATTAATTCCAAATGGTCAATATAGAG] [+] EMBL BI503613 [CTGATGGCGAAGGACCAAAACAGCAAATATATTTAAATAGTTTTTATATAGATAAGACGGAAGTGAGTAATCACGATTTTTCAAAATTCGTTGATGCCACTAATTATAAAACAGAAGCAGAAAGATTTGGAGATTCATTCGTATTTAGAGGTTTATTAAAACAAAAAGATCAAAAAAATATAACACTTGTTGTTGCTCAAGCTCCTTGGTGGCTACAAGTAAAAAATGCAAATTGGCTGCATCCAGAGGGTCCTGAATCAGATATTAAGAGTATGATTCATTTTTTGATTGCTTATTACGTAATTGGAAATAGCAACAATTAAAATTGAATAATCCAGATAGAATGGATCATCCTGTTATTCATGTATCATGGAATGATGCTATTGCCTATTGCAATTGGTTAGGAAAACGATTGCCTACTGAAGCAGAATGGGAAGTTGCATGTCGAGGAGGATTGTCGGATAGATTATATCCATGGGGAAATAAATTAATTCCAAATGGTCAATATAGAG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_2306#0 TATATGTATATATATATTTACAATTATTTAAATCTTTCGACATATAATGAATTTTATTAT 60 consensus_2306#1 ------------------------------------CTGATG-GCGAAGGACCAAAACAG 23 ** * * * * * consensus_2306#0 TAATTAATATTTGATTTTAAATATTTATA-ATTTAAAATATATTTATAATTCTACGATTA 119 consensus_2306#1 CAAATA-TATTTAAAT---AGTTTTTATATAGATAAGACGGAAGTGAGTAATCACGATTT 79 ** ** ***** * * * * ****** * *** * * * ****** consensus_2306#0 CTTAACCAATATTTTAATTATTTTAAATTAATTTAATAAATTTATTAAATAATTATTATT 179 consensus_2306#1 TTCAA--AATTCGTTGATGCC-----ACTAATT--ATAAAACAGAAGCAGAAAGATTTGG 130 * ** *** ** ** * ***** ***** * ** *** consensus_2306#0 ATATTAAACTTATTTATTTAATAATTTTCTATTTTTAAAATGAAAAATTCAATAAGAATT 239 consensus_2306#1 AGATTCA---TTCGTATTTAGAGGTTTA------TTAAAACAAAAAGATCAA-AAAAATA 180 * *** * * ****** *** ****** **** **** ** *** consensus_2306#0 ATAAAAAAAAAATTGATTACATTGCTCA-TATTCGCAAATATAATAACATTATGTTCTAT 298 consensus_2306#1 TAACACTTGTTGTTGCTCAAGCTCCTTGGTGGCTACAAGTAAAAAATGCAAATTGGCTGC 240 * * *** * * * ** * *** ** ** * ** ** consensus_2306#0 AGTT-GAAAGTTCTGAAATAGATAATTCAAATGAAGAATCTTGTCATTGTAATAGTCGTA 357 consensus_2306#1 ATCCAGAGGGTCCTGAATCAGATATT-------AAGAGTATGATTCATTTTTTGATTGC- 292 * ** ** ***** ***** * **** * * * * * * * * consensus_2306#0 CTTTTGACAGACAAACAAATATAAAGAATTATTATAAGAAAGAAATACAAGATTCTTGTT 417 consensus_2306#1 ---TTATTACGTAATTGGAAATAGC-AACAATTAAAATTGAATAATCCAGA----TAGAA 344 ** * ** * *** ** **** ** * *** ** * * consensus_2306#0 TGGCGAATGATATTCTTCATGT-TTATGCAAAGACTGTGAATTCTAT---AAATCATTTA 473 consensus_2306#1 TGGATCATCCTGTTATTCATGTATCATGGAATGATGCTATTGCCTATTGCAATTGGTTAG 404 *** ** * ** ******* * *** ** ** * **** ** * ** consensus_2306#0 AAAAACA--TGATTAA-GATAAAGNNNGGTATTTTTGGGATTGGTACAAACGATCCAATT 530 consensus_2306#1 GAAAACGATTGCCTACTGAAGCAGAATGGGAAGTTGCATGTCGAGGAGGATTGTCGGATA 464 ***** ** ** ** ** ** * ** * * * ** ** consensus_2306#0 TTTATTGCTGATGGCGAAGGACCAAAACAGCAAATATATTTAAATAGTTTT 581 consensus_2306#1 GATTATATCCATGGGGAAATAAATTAATTCCAAATG-GTCAATATAGAG-- 512 * * **** *** * ** ***** * * **** |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |