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Apis mellifera
cluster # 253 cluster # 253       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_253#0 length = 655 sequences # 5  

consensusID : consensus_253#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 655
fasta sequence
                              [GATTGTTGTGATGATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG-CCGGAAAAGAAGATTGTTA-CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC-TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA-CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT-CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT-GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA-GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGCCAGANACTTAANTTTGTTATTAGANAACAATTNTTNTGTTCAAACGGGGGCCAATTGCANAAATAATTGTCATATTGGTAACAACAACAGTA]

[+] EMBL BI505188             [GATTGTTGTGATGATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGC                                                                                            ]
[+] EMBL BG101595             [          ATGATCTGCTTGATTAAACGTG ACAATGTCCAATCCTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGGGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATGCCCGGAAAAGAAGATTGTTACCTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTACTTTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTACCGTGGNGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTTCCCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTACCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATNTNTCACAGTGATTAGATACGATGAATGGGGACAAATACNCANGAG ATTGGGAGAATT AATCTCTNTGTGGGAAACTTTACGTCTGCAATAACAAATGNGGGGAGGAAATATTAATG AATGCCCCCTACTC ACCNTTGNGCCGNAGNAAAGAAGCCAGANACTTAANTTTGTT TTAGANAACAATTNTTNTGTTTAAACGGGGGCCAATTGCCNAAATAATTG                       ]
[+] EMBL BI516346             [             ATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTGGTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAG                                                                                                           ]
[+] EMBL BI505675             [                                                                  GGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAACATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGCCAGAGACTTAAATTTGTTATTAGATAACAATTCTTATGTTCAAAC GTGGTCAATTGCACAAATAATTGTCATATTGGTAACAACAACAGTA]
[+] EMBL BI506300             [                                                                                                      CACCCATGGTACGAAACTTTACCCGCGGTGGCCTTAGNTTACAAAGTTCATATTGATG CCGGAAAAGAAGATTGTTA CTTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTAC TTTCTATGTAAATTTTCAGGTNGTA CGTGGTGGAGATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAATGGGTT CCTAATTCNNNTTATCAAGATACTNTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGTATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACANNNATTAGATACGATGAAT GGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAAAACTTCACGTCTGCAATAACAGNTGTGGAGA GAAATATTAATGAAATGCTCCAA                                                                                                                         ]


>consensus_253#0 GATTGTTGTGATGATCTGCTTGATTAAACGTGAACAATGTCCAATCTTTTACGAAGTCTG GTTTTCGGAGTATTCCTTAGCCTCGCGAATACCAGCGTGTCTCACCCATGGTACGAAACT TTACCCGCGGTGGCCTTAGATTACAAAGTTCATATTGATGCCGGAAAAGAAGATTGTTAC TTTCAATATGTTAATGCTGGAGCTACTTTCTATGTAAATTTTCAGGTAGTACGTGGTGGA GATGGAAAAGCTGGTTTTGCAGTAAGAAATCCAGATGGAATAATAGTTCATCCTTACCAA TGGGTTCCTAATTCAGATTATCAAGATACTGTGAAAAATGCTGGTTATTACAGTATTTGT ATAGATAATCAATTTTCCAGATTTGCTTCAAAATTAATTAATTTATATATCACAGTGATT AGATACGATGAATGGGACAAATATACAAGAGAATTGGAAGAATTAAATCTCTCTGTGGAA AACTTCACGTCTGCAATAACAAATGTGGAGAGAAATATTAATGAAATGCTCCAAACTCAA CATTTGAGCAGAAGTAAAGAAGCCAGANACTTAANTTTGTTATTAGANAACAATTNTTNT GTTCAAACGGGGGCCAATTGCANAAATAATTGTCATATTGGTAACAACAACAGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)