Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 2544 cluster # 2544       Sequences # 2       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2544#0 length = 625 sequences # 2  
consensusID : consensus_2544#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 625
fasta sequence 
                              [GATATTAACGACCGATGTTAGTCGCGCGTTTACTTGCATACAATTCATACGCGTAAAAAGACCACAAGTATATACATTATATAATAGTATACACGGTTAATATGGTGTCTTAATTTTCTTATTATTAAATAACGTTATTAAATGCAAAGAAATGTGTATATAAATAAAGCAAAATTAATCAACATGGCATTAATAATGATGAATCTATGAACAAATATAAATTAAAATACAATATAACAATAACAATATAGAGTTATTTCGTTATAACAAAATTATATTAATATCATTCAAGATTAGATTAACAAAATTGAATTAATTCGAGTTTACTTATCGGTAAAAGGTAAGTTAGAGAATGGCTCGTATCTTGTGTTGCTCAAAGTGAAATATATAATTCCTTTTTAGGCGAGATATATCTTATATGTATTTATATATATATATATTATTAACGAATTCGTTAAAGAGTCGTACCNNNAGAATTTTTCCTTCGATAAAACACAAGTTTTCACGACCGTTACACGTTTTCTTTAATCGAAACTTAAAAATTTATTTTCCTTCATTNNNCAAAGTTAAATATATATTTGTACCGATTATTATGCTTCCGATTTTAAAAAAAAATTTCCATTAA]

[+] EMBL BI508429             [GATATTAACGACCGATGTTAGTCGCGCGTTTACTTGCATACAATTCATACGCGTAAAAAGACCACAAGTATATACATTATATAATAGTATACACGGTTAATATGGTGTCTT ATTTTCTTATTATTAAATAACGTTATTAAATGCAAAGAAATGTGTATATAAATAAAGCAAAATTAATCAACATGGTATTAATAATGATGAATCTATGAACAAATATAAATTAAAATACAATATAACAATAACAATATAGAGTTATTTCGTTATAACAAAATTATATTAATATCATTCAAGATTAGATTAACAAAATTGAATTAATTCGAGTTTACTTATCAGTAAAAGGTAAGTTAGAGAATGGCTCGTATCTTGTGTTGCTCAAAGTGAAATATATAATTCCTTTTTAGGCGAGATATATCTTATATGTATT    TATATATATATTATTAACGAATTCGTTAAAGAGTCGTACCGCTAGAATTTTTCCTTCGATAAAACACAAGTTTTCACGACCGTTACACGTTTTCTTTAATCGAAACTTAAAAATTTATTTTCCTTCATTNNNCAAAGTTAAATATATATTTGTACCGATTATTATGCTTCCGATTTTAAAAAAAAATTTCCATTAA]
[+] EMBL BI503114             [                GTTAGTCGCGCGTTTACTTGCATACAATTCATACGCGTAAAAAGACCACAAGTATATACATTATATAATAGTATACACGGTTAATATGGTGTCTTAATTTTCTTATTATTAAATAACGTTATTAAATGCAAAGAAATGTGTATATAAATAAAGCAAAATTAATCAACATGGCATTAATAATGATGAATCTATGAACAAATATAAATTAAAATACAATATAACAATAACAATATAGAGTTATTTCGTTATAACAAAATTATATTAATATCATTCAATATTAGATTAACAAAATTGAATTAATTCGAGTTTACTTATCGGTAAAAGGTAAGTTAGAGAATGGCTCGTATCTTGTGTTGCTTAAAGTGAAATATATAATTCCTTTTTAGGCGAGATATATCTTATATGTATTTATATATATATATATTATTAACGAATTCGTTAAAGAGTCGTACCNNNAGAATTTTTCCTTCGATAAAACACAAGTTTTCACGACCGTTACACGTTTTCTTTAATCGAAACTTAAAAATTTATTTTCCTTCATTGTTCAAAGTTAAATATATATTTGT                                           ]




>consensus_2544#0
GATATTAACGACCGATGTTAGTCGCGCGTTTACTTGCATACAATTCATACGCGTAAAAAG
ACCACAAGTATATACATTATATAATAGTATACACGGTTAATATGGTGTCTTAATTTTCTT
ATTATTAAATAACGTTATTAAATGCAAAGAAATGTGTATATAAATAAAGCAAAATTAATC
AACATGGCATTAATAATGATGAATCTATGAACAAATATAAATTAAAATACAATATAACAA
TAACAATATAGAGTTATTTCGTTATAACAAAATTATATTAATATCATTCAAGATTAGATT
AACAAAATTGAATTAATTCGAGTTTACTTATCGGTAAAAGGTAAGTTAGAGAATGGCTCG
TATCTTGTGTTGCTCAAAGTGAAATATATAATTCCTTTTTAGGCGAGATATATCTTATAT
GTATTTATATATATATATATTATTAACGAATTCGTTAAAGAGTCGTACCNNNAGAATTTT
TCCTTCGATAAAACACAAGTTTTCACGACCGTTACACGTTTTCTTTAATCGAAACTTAAA
AATTTATTTTCCTTCATTNNNCAAAGTTAAATATATATTTGTACCGATTATTATGCTTCC
GATTTTAAAAAAAAATTTCCATTAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)