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Apis mellifera
cluster # 27 cluster # 27       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_27#0 length = 729 sequences # 12  

consensusID : consensus_27#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 729
fasta sequence
                              [TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG-AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTTTTAACATTAAAAGCAA]

[+] EMBL BI514694             [TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI514703             [TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGGAAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI503691             [                                                                     CAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAAT                                                                                  ]
[+] EMBL BI506036             [                                                                                TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTT                ]
[+] EMBL BI508187             [                                                                                TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATT                                                                          ]
[+] EMBL BI508285             [                                                                                TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTAT                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI508779             [                                                                                TTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGT                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI508555             [                                                                                      GCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTTTTAACATTAAAAGCAA]
[+] EMBL BI516401             [                                                                                            TCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTANNAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTA                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI512436             [                                                                                                        GAAGACGTTTTTCTATCTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTNNNATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATACATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTT                                          ]
[+] EMBL BI508780             [                                                                                                                        CTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTG AAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTAT                                                                           ]
[+] EMBL BI516017             [                                                                                                                             TATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAGCAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTACGAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATATATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTGAAAAAAATTGACGTTAATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGGGTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGGAACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTTAAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAGTAGTTTTTATAATCAATCAATATATGTAT                                                                                                                       ]


>consensus_27#0 TTACTCATGTTATAAGAAATTTTTCAGTCATAACTATGAGTGGAAACGACAACTATAAGG AAGCGAAATCAATTTATGATTTCACTGCGAAATCCATCAAAGGCGAAGACGTTTTTCTAT CTAAATATAAAGGACATGTTTGTTTAATCGTAAATGTAGCGTCAAAATGCGGCCTTACAG CAACAAATTATAAAGAATTGAATGAGTTATACGATGAATATGCTGAATCTAAAGGTTTAC GAATTTTGGCTTTTCCTTGTAATCAATTTAATGGTCAAGAACCGGGAAATAGTGAAGATA TATGTAATTTTGCTGATCGACAAAAAGTTAAATTCGACTTGTTTGAAAAAATTGACGTTA ATGGAGATTCTGCGCATCCTTTATGGAAATATTTAAAAAAAGAACAAGGAGGAATTTTGG GTGATTTCATAAAATGGAATTTTACAAAATTTATTGTAAATAAAGAAGGCAAAGTGGTGG AACGCCATGGTCCAAATGTGGCTCCCAGTAATTTGAAAAATCATCTTGAAAAATATTTTT AAATATCTTGATCTTACAATTACAAATATTTGCACTAATAATAGTTTTTATAATCAATCA ATATATGTATCAATTGCAAATTATTGTTATGGAAAGGACAAAAAAATATTTTATTTATAC ATTTTTTATTTAATAGAAATTTATTTTTAAAATTATCGAATATTCAATATTTTTTAACAT TAAAAGCAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)