These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2767#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 483 fasta sequence [NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGATACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTCAACATCNANGTCTCAAACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATTACGCTGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTTATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTTAATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATANGGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAATAATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAATTNATTATG] [+] EMBL BG101679 [NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGATACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTCAACATCNANGTCTCAAACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATTACGCTGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTTATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTTAATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATANGGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAATAATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAATTNATTATG] consensusID : consensus_2767#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 407 fasta sequence [TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGATATAAAGATAATTTAATAGGGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTCGAAAATATACAAGGCTACAGATTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAGAANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAACTTCTCCTTTGATAGAGTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTATGGTAAAATATACGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGATTATTGGGACCAAATAAAAAAAT] [+] EMBL BI516642 [TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGATTGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGATATAAAGATAATTTAATAGGGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTCGAAAATATACAAGGCTACAGATTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAGAANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAACTTCTCCTTTGATAGAGTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTATGGTAAAATATACGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGATTATTGGGACCAAATAAAAAAAT] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_2767#0 NCTGACACTGATCAGCNCAAAGCNNATGACGTTATTGAAGGCACTATCGANGTAGAAGAT 60 consensus_2767#1 ---------------------TTACATAATATATTTAAGATTAAATTTGATTGGGAGGAT 39 ** * * ** * * * ** ** *** consensus_2767#0 ACAAAAGNTCAATTGNACCTGCCCGGGCNGCCGCTCCGACTATAATNGGNATCTTGGGTC 120 consensus_2767#1 TGGTAAATTTAATAAACTTTATTTAAGATTTAATTTTGA-TATAA-AGATAATTTAATAG 97 ** * *** * * * ** ***** * * ** consensus_2767#0 AACATCNANGTCTCA-----AACATCTTTATCTATATGGTCTATCAAANGATATT-ACGC 174 consensus_2767#1 GGAATTTGAGTCCAATTGTTACTGCTTTTATTNNNATGGTTAAAGCAGAGAGATTGATTC 157 ** *** * * ***** ***** * * ** *** * * consensus_2767#0 TGTTATCCCTAANGTAATTTATNCTNTTAANTACNNTTTATAATTCAAANAATTATCTTT 234 consensus_2767#1 GAAAATATACAAGGCTACAGA---TTTTACCTCCTTTAAAAGATGTAATGCATCGCCCAG 214 ** ** * * * * *** * * * * ** ** ** * consensus_2767#0 ATATCAAAATTAAATCTTAAATAAAGNNTATTAAATTTACCAATCCTCCCAATCAAATTT 294 consensus_2767#1 A-ANNAGGAACTACTTTGAGGGCGAAGTTGTNNNAATTATTAA-CTTCTCCTTTGATAGA 272 * * * * * * * * * * * * *** ** * ** * * * consensus_2767#0 AATCTTAAATATATCTATTAAAATTNTAAATAAATTNNANAATTAAATTAAATTCTATAN 354 consensus_2767#1 GTTACGNAATCTCGTTGCCGAGGTTTTATTCATACTCTGTAAAGAAAATGTTACTCGTAT 332 * *** * * * ** ** * * * ** *** * ** consensus_2767#0 GGTCTTATCGTCCCATAATTAAATTTTAGAATCTTAACTAAAAATTTAAATTCATTTAAT 414 consensus_2767#1 GGTAAAAT------ATA-CGGGATATGGAAATGCTGCTGGAATGTTTGCAAACAAAGGAT 385 *** ** *** ** * *** * ** *** * ** ** consensus_2767#0 AATTTANAGACNGTTNTTATTTCATTAATTCTTTCATACAATTCTTCAATTAANAGACAA 474 consensus_2767#1 TATTGGGACCAAATAAAAAAAT-------------------------------------- 407 *** * * * * consensus_2767#0 TTNATTATG 483 consensus_2767#1 --------- |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |