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Apis mellifera
cluster # 292 cluster # 292       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_292#0 length = 600 sequences # 5  

consensusID : consensus_292#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 600
fasta sequence
                              [GACTTTAATATTTTCGTCGACCTTTCGTTCTTTTGTTCA--CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT-AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAA-AGAGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT--AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA]

[+] EMBL BI515459             [GACTTTAATATTTTCGTCGACCTTTCGTTCTTTTGTTCA  CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAAGAAAAAAAAAAAN NNAGATATAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTC                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI506249             [                  GACCTTTCGTTCTTTTGTTCA  CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAGAGAGATATAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT  AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA]
[+] EMBL BI509760             [                  GACCTTTCGTTCTTTTGTTCA  CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAAT AAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAG AAAAAAAAAAAA AGAGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCT  AAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA]
[+] EMBL BI506737             [                        TCGTTCTTTTGTTCACTCATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGCACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAA    AGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATAAACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGTGATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCTAAAAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATAAGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTA                         ]
[+] EMBL BI504618             [                               TTTTCACT  CATTTATTGATCACGTTACGAGCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGCACCTAACGAACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTAAGACAGAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTACATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTCGGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAGGAGAAAAAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                      ]


>consensus_292#0 GACTTTAATATTTTCGTCGACCTTTCGTTCTTTTGTTCACATTTATTGATCACGTTACGA GCTATCTTGTGTATCTGAGTGAAAATCTTATCAAAGAATTCCGCTCGATCGTACCTAACG AACTTCATCTTTAACCCTTAAGAGAGCAAATTTTTTCATCTCTAAATGTAGAAATATTTA AGACAGAAAGTTAGAAGAGAAATAAAAAAAAAAATTAGTTTATTTACGGATAATATTTAC ATGTAAAAGCGAAGATGTCGACGCGATCAGATAAGCGCCGTCAAGTCAATTCAGTGATTC GGTAGAGTTTTTTAAAAAAGACAAGCAGACGCATTTACGCAAGAAGGAGAGTACGCAAAG GAGAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGAGANNNAGAGAGCAAACGAGTAAAAAATAATAATA AACGAGTAAAGAGAAATTTTTTCATCTTAATTGCACGTTTATCCAAGTTCTTCCTCTCGT GATATAGCGTTTACACTTTTAACGATTTATCTAAAAAAAAAAAAAAGTTTCTAAAATATA AGAGGAGAGATTATTGATGATAAATTAATTAATTAATTAAAAAAAAAAAAGTGGAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)