Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 307 cluster # 307       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_307#0 length = 437 sequences # 5  

consensusID : consensus_307#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 437
fasta sequence
                              [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGTGGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGTTTTAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI505717             [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGTGGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGTTTTAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI507205             [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGTGGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGTTTTAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI508712             [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGNNGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGTTTTAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI504211             [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGNNGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGTTTTAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI509701             [AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGACCCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATCTTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTTACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCTGCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAATAGCTCATTTACTAAATAAGGTGGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAAAAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTGAAGACTTCAAAAAAAA ]


>consensus_307#0 AAAGTGGCGAAAGCTCAATGTTTTTGGTCAAGTTGTAAATATGATACGCGAAGCAATGAC CCAGAGACGTCAACTCAATAACTTATCTACTGGAGTAACTCACATTCGTATTCCTGCATC TTATCAAGCAGGTATTACATTAGTTATGTGTGCAGACTCTTCAGCTGCTTCCGAATTGTT ACATACCGAACAATTACCACTACTCTAGTCTTGTTGATCAAAATTATTAAAATTCAGGCT GCCCCTTTTTATTTGTAATAAATTTAATTAGCAGGCTGATCCGCACAATGTTATTCACAA TAGCTCATTTACTAAATAAGGTGGGGTCAGAATCGAAATAATTTACATTTTTAACACAAA AAATGTTTGTATTCAAAGAGAATATTATTGATTAAAATATATTTCAATAGAATATTTCTG TTTTAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)