Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Apis mellifera
cluster # 365 cluster # 365       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_365#0 length = 765 sequences # 4  

consensusID : consensus_365#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 765
fasta sequence
                              [ATAAATCGTAGTATTTTCAATCAGTGATATAATTTAATAGAATTATTAAAAGAAATAAAAAATAAATAGTGATGGATCGATTATTGAGATTAGGAGGTGCTATGCCAGGTCTTAGTCAAGGACCTCCACCTTCAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCATTAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTTTAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGCCTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGTTAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGGCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATCCAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTCTTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTGTTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTCAAACTACATCCAATTTAGGTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCCATGGTTTAAATCGTCATTATTATAGCATTAGTATCAACTATCGTAAAAATGAATTAGAACAAAAAATGCTATTAAATTTACACAAAAAAACGTGGATGGATGGTCTTACAC]

[+] EMBL BI506147             [ATAAATCGTAGTATTTTCAATCAGTGATATAATTTAATAGAATTATTAAAAGAAATAAAAAATAAATAGTGATGGATCGATTATTGAGATTAGGAGGTGCTATGCCAGGTCTTAGTCAAGGACCTCCACCTTCAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCATTAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTTTAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGCCTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGTTAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGTCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATCCAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTCTTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTGTTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTCAAACTACATCCAATTTNNNTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCCATGGTTTAAATCGTCATTATTATAGC                                                                                     ]
[+] EMBL BI510442             [ATAAATCGTAGTATTTTCAATCAGTGATATAATTTAATAGAATTATTAAAAGAAATAAAAAATAAATAGTGATGGATCGATTATTGAGATTAGGAGGTGCTATGCCAGGTCTTAGTCAAGGACCTCCACCTTCAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCATTAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTTTAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGCCTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGTTAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGTCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATCCAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTCTTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTGTTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTCAAACTACATCCAATTTAGGTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCC                                                                                                               ]
[+] EMBL BI506877             [                                                                                                                TAGTCAAGGACCTCCACCTTCAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCATTAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTTTAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGCCTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGTTAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGGCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATCCAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTCTTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTGTTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTCAAACTACATCCAATTTAGGTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCCATGGTTTAAATCGTCATTATTATAGCATTAGTATCAACTATCGTAAAAATGAATTAGAACAAAAAATGCTATTAAATTTACACAAAAAAACGTGGATGGATGGTCTTACAC]
[+] EMBL BI506964             [                                                                                                                                    CAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCATTAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTTTAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGCCTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGTTAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGGCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATCCAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTCTTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTGTTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTCAAACTACATCCAATTTAGGTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCCATGGTTTAAATCGTCATTATTATAGCATTAGTATCAACTATCGTAAAAATGAATTAGAACAAAAAATGCTATTAAATT                                 ]


>consensus_365#0 ATAAATCGTAGTATTTTCAATCAGTGATATAATTTAATAGAATTATTAAAAGAAATAAAA AATAAATAGTGATGGATCGATTATTGAGATTAGGAGGTGCTATGCCAGGTCTTAGTCAAG GACCTCCACCTTCAGATGCTCCAGTTGTTGATACTGCAGAGCAGGTATACATATCGTCAT TAGCTCTTTTAAAAATGCTTAAACATGGACGTGCTGGTGTACCTATGGAAGTAATGGGTT TAATGCTTGGTGAATTTGTTGATGATTATACTGTACGTGTAATTGATGTATTTGCTATGC CTCAAACAGGAACGGGAGTCAGTGTAGAAGCAGTTGATCCAGTATTTCAAGCAAAAATGT TAGATATGCTTAAGCAAACTGGTCGGCCAGAAATGGTAGTAGGATGGTATCATTCTCATC CAGGATTTGGTTGTTGGCTCTCTGGTGTAGATATTAATACACAACAATCATTTGAAGCTC TTAGTGAAAGAGCAGTGGCTGTTGTTATTGATCCTATACAATCAGTAAAAGGAAAAGTTG TTATTGATGCATTTAGATTAATTACTCCTAATACCATGGTTTTAGGACAAGAACCTCGTC AAACTACATCCAATTTAGGTCATTTACAAAAGCCATCTGTTCAAGCATTGATCCATGGTT TAAATCGTCATTATTATAGCATTAGTATCAACTATCGTAAAAATGAATTAGAACAAAAAA TGCTATTAAATTTACACAAAAAAACGTGGATGGATGGTCTTACAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)