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Apis mellifera
cluster # 401 cluster # 401       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_401#0 length = 802 sequences # 4  

consensusID : consensus_401#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 802
fasta sequence
                              [AAAGATGGAAAATATATTATAATAAATATTTGTTAAGCAAATAAATAATGTTGTTGTATTAAAATTATTAAACTTTAATATAGAAGTGTTACACTTTCAATATCAAGTCGATATTTAATAATTGTAAACGTATTTGAGGTTATAAAGGTTAGAAAGTGAAAAAATATTTAAATATTTTCACTTCATAAAATATATATAATAAAGTAAAATTTAATAATCATCGTAGAAATGCAAGTTTATAAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTTGGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGGCTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAGAAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAGTACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGTATGACAATTTTAAGAAATATAGATTACAATAAAGTGTTTGCATTATGGAGAGTGCCTAGCCCTTGGCAACCAATAACTATGAAGAGTCATGGATTACGAATGGGTTCTGGTAAAGGAAGTATAAATCATTACGTCACTCCGGTAAAAGCGAAACAAGTTATTTTAGAAGTAGNAGGAAACATTGAATATTTCGAGNTTAAAAATATCTTAAAAAATATTGCGAAAAGGCTGCCATTTGACGCTATGGCAGTTAGTCAAGAAA]

[+] EMBL BI516245             [AAAGATGGAAAATATATTATAATAAATATTTGTTAAGCAAATAAATAATGTTGTTGTATTAAAATTATTAAACTTTAATATAGAAGTGTTACACTTTCAATATCAAGTCGATATTTAATAATTGTAAACGTATTTGAGGTTATAAAGGTTAGAAAGTGAAAAAATATTTAAATATTTTCACTTCATAAAATATATATAATAAAGTAAAATTTAATAATCATCGTAGAAATGCAAGTTTATAAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTTGGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGGCTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAGAAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAGTACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGTATGACAATTT                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI516169             [                                                                                                                                        AGGTTATAAAGGTTAGAAAGTGAAAAAATATTTAAATATTTTCACTTCATAAAATATATATAATAAAGTAAAATTTAATAATCATCGTAGAAATGCAAGTTTATAAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTTGGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGGCTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAGAAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAGTACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGTATGACAATTTTAAGAAATATAGATTACAATAAAGT                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI514960             [                                                                                                                                                                                                                               TAGAAATGCAAGTTTATAAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTTGGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGGCTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAGAAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAGTACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGTATGACAATTTTAAGAAATATAGATTACAATAAAGTGTTTGCATTATGGAGAGTGCCTAGCCCTTGGCAACCAATAACTATGAAGAGTCATGGATTACGAATGGGTTCTGGTAAAGGAAGTATAAATCATTACGTCACTCCGGTAAAAGCGAAACAAGTTATTTTAGAAGTAGGAGGAAACATTGAATATTTCGAGGTTAAAAATATCTTAAAAAATATTGCGAAAAGGCTGCCATTTGACGCTATGGCAGTTAGTCAAGAAA]
[+] EMBL BI510308             [                                                                                                                                                                                                                               TAGAAATGCAAGTTTATAAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTTGGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGGCTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAGAAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAGTACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGTATGACAATTTTAAGAAATATAGATTACAATAAAGTGTTTGCATTATGGAGAGTGCCTAGCCCTTGGCAACCAATAACTATGAAGAGTCATGGATTACGAATGGGTTCTGGTAAAGGAAGTATAAATCATTACGTCACTCCGGTAAAAGCGAAACAAGTTATTTTAGAAGTAGNAGGAAACATTGAATATTTCGAGNTTAAAAATATCTTAAAAAATATTGCGAAAAGGCTGCCATTTGACGC                    ]


>consensus_401#0 AAAGATGGAAAATATATTATAATAAATATTTGTTAAGCAAATAAATAATGTTGTTGTATT AAAATTATTAAACTTTAATATAGAAGTGTTACACTTTCAATATCAAGTCGATATTTAATA ATTGTAAACGTATTTGAGGTTATAAAGGTTAGAAAGTGAAAAAATATTTAAATATTTTCA CTTCATAAAATATATATAATAAAGTAAAATTTAATAATCATCGTAGAAATGCAAGTTTAT AAAAATATTACGAAACTATTGCTAACGCCATATTCTGTATTTAAGTCGGCACCAGCGGTT GGAGTAAAATCACTTAAACCATCATCTAAAATGGATGTTGAATATCCTGAACGTAACAGG CTTAGAGTTGTATTAAGAGTACCTCAGTTTTTAACTATTGGAAAACCTTACAAAATGCAG AAAAAATTGAGATTAATGCGTGGTCCAGAATTATTTCATAATACTCTTTTGCATAAACAG TACGGCATAATAGCGACTGGTGGTGGTAGAATGAAATTTAGTCACTTTGAAATGATCCGT ATGACAATTTTAAGAAATATAGATTACAATAAAGTGTTTGCATTATGGAGAGTGCCTAGC CCTTGGCAACCAATAACTATGAAGAGTCATGGATTACGAATGGGTTCTGGTAAAGGAAGT ATAAATCATTACGTCACTCCGGTAAAAGCGAAACAAGTTATTTTAGAAGTAGNAGGAAAC ATTGAATATTTCGAGNTTAAAAATATCTTAAAAAATATTGCGAAAAGGCTGCCATTTGAC GCTATGGCAGTTAGTCAAGAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)