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Apis mellifera
cluster # 425 cluster # 425       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_425#0 length = 1180 sequences # 4  

consensusID : consensus_425#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1180
fasta sequence
                              [ACGCACAGACGTAAAACCATGATTCTTCTTGCGTCGCGTGAAACGTCGGGCAAAATATAATAAAATGAAAAACTATCATTTTTAATTATTGTCGTCGATAACCTCGTAAGTAATTGGTAATTATCGTATAGCCATAATTTGTTCATTGTCCTATCCTGCAAAACGAATGTTGAAAAAATGGAGAGAGAGAAGTTATATAGTATGGAGGAATGTGAGTTCGCAGTGAAAACAGATGTCCGGTTCGCATTCTTGAATTTCGCGAGTCTTTCGGTATTAATATATTAATTACGTATACAAATCGCTAATTCATTCCACGTTCTATTGAAGTTGAAACACGGTCTTTCGAAGACGAGCGCGCATTCACGAGTAGTACATCTTAAAAAAAGCACATAATATCCATGATTATTCAATAATTTAGATATTGGTGATTCAAAATTATTTTCTTAAATTTTGTTTTATAATACTGGCTGAATGTATGTGCATATTTGTATCTTTTATATGCATATTTTATGCATATTTTACATTTTTTATAAAATACATTTCGTAAAAAATATTTAAAGCAAAGTAACAGTTGCTTGATTCTATATTTTAATGTGCTAATAATAACAATATAGATAATGACTGAATTTAATTAAGACTGAATTCATCGATCTATCATCTTTCATCTTTTACTCTCTGAATAAATGGTCCCTCTTTCATTTAATTTTCCGTATTAAATGAACTCTGCCTCTATTAAAATATTTCGATCAGTTAAGCTTATTATTGATGACATATCAATGAAATTTTTCGAAAATCGAATTTGAAAAAAGATATAAAATAATAATTTCGATTAAAAAATCGATCGTCTGGATCGGAAAATCTGGATGTCATGTGCTTTAAAAAAGATCAAATGTACATAGCGTAAACATAATGAAGAAAAATCGGCGTGTAGTATACGAAACCTTACGATTCGCGATGCCGAAAAGGAAGATAATTATGTTTTGAGCCGCGTTGCCGTTCACAGGGCATGCGACCATGCCACTTGTTTCAATCGATTCAATTCGATTAATTAAAACCCCATTCGATTCGCCTAAGGTTTTCAACCGTGTATGCCTCACAGACAACGAATCTCTCGACTTGCTAAGCGACTCGCGACTAGCAATAGTTTCTGCAATCTCCTCAATACAATTATTTTAAGTGC]

[+] EMBL BI509783             [ACGCACAGACGTAAAACCATGATTCTTCTTGCGTCGCGTGAAACGTCGGGCAAAATATAATAAAATGAAAAACTATCATTTTTAATTATTGTCGTCGATAACCTCGTAAGTAATTGGTAATTATCGTATAGCCATAATTTGTTCATTGTCCTATCCTGCAAAACGAATGTTGAAAAAATGGAGAGAGAGAAGTTATATAGTATGGAGGAATGTGAGTTCGCAGTGAAAACAGATGTCCGGTTCGCATTCTTGAATTTCGCGAGTCTTTCGGTATTAATATATTAATTACGTATACAAATCGCTAATTCATTCCACGTTCTATTGAAGTTGAAACACGGTCTTTCGAAGACGAGCGCGCATTCACGAGTAGTACATCTTAAAAAAAGCACATAATATCCATGATTATTCAATAATTTAGATATTGGTGATTCAAAATTATTTTCTTAAATTTTGTTTTATAATACTGGCTGAATGTATGTGCATATTTGTATCTTTTATATGCATATTTTATGCATATTTTACATTTTTTATAAAATACATTTCGTAAAAAATATTTAAAGCAAAGTAACAGTTGCTTGATTCTATATTTTAATGTG TAATAATAACAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI507440             [                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATATATTAATTACGTATACAAATCGCTAATTCATTCCACGTTCTATTGAAGTTGAAACACGGTCTTTCGAAGACGAGCGCGCATTCACGAGTAGTACATCTTAAAAAAAGCACATAATATCCATGATTATTCAATAATTTAGATATTGGTGATTCAAAATTATTTTCTTAAATTTTGTTTTATAATACTGGCTGAATGTATGTGCATATTTGTATCTTTTATATGCATATTTTATGCATATTTTACATTTTTTATAAAATACATTTCGTAAAAAATATTTAAAGCAAAGTAACAGTTGCTTGATTCTATATTTTAATGTGCTAATAATAACAATATAGATAATGACTGAATTTAATTAAGACTGAATTCATCGATCTATCATCTTTCATCTTTTACTCTCTGAATAAATGGTCCCTCTTTCATTTAATTTTCCGTATTAAATGAACTCTGCCTCTATTAAAATATTTCGATCAGTTAAGCTTATTATTGATGACATATCAATGAAATTTTTCGAAAATCGAATTTGAAAAAAGATATAAAATAATAATTTCGATTAAAAAATCGATCGTCTGGATCGGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL BI509578             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ACATTTCGTAAAAAATATTTAAAGCAAAGTAACAGTTGCTTGATTCTATATTTTAATGTGCTAATAATAACAATATAGATAATGACTGAATTTAATTAAGACTGAATTCATCGATCTATCATCTTTCATCTTTTACTCTCTGAATAAATGGTCCCTCTTTCATTTAATTTTCCGTATTAAATGAACTCTGCCTCTATTAAAATATTTCGATCAGTTAAGCTTATTATTGATGACATATCAATGAAATTTTTCGAAAATCGAATTTGAAAAAAGATATAAAATAATAATTTCGATTAAAAAATCGATCGTCTGGATCGGAAAATCTGGATGTCATGTGCTTTAAAAAAGATCAAATGTACATAGCGTATACATAATGAAGAAAAATCGGCGTGTAGTATACGAAACCTTACGATTCGCGATGCCGAAAAGGAAGATAATTATGTTTTGAGCCGCGTTGCCATTCACAGGGCATGCGACCATGCCACTTGTTTCAATCGATTCAATTCGATTAATTAAAA                                                                                                                              ]
[-] EMBL BI508494             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGAATTTAATTAAGACTGAATTCATCGATCTATCATCTTTCATCTTTTACTCTCTGAATAAATGGTCCCTCTTTCATTTAATTTTCCGTATTAAATGAACTCTGCCTCTATTAAAATATTTCGATCAGTTAAGCTTATTATTGATGACATATCAATGAAATTTTTCGAAAATCGAATTTGAAAAAAGATATAAAATAATAATTTCGATTAAAAAATCGATCGTCTGGATCGGAAAATCTGGATGTCATGTGCTTTAAAAAAGATCAAATGTACATAGCGTAAACATAATGAAGAAAAATCGGCGTGTAGTATACGAAACCTTACGATTCGCGATGCCGAAAAGGAAGATAATTATGTTTTGAGCCGCGTTGCCGTTCACAGGGCATGCGACCATGCCACTTGTTTCAATCGATTCAATTCGATTAATTAAAACCCCATTCGATTCGCCTAAGGTTTTCAACCGTGTATGCCTCACAGACAACGAATCTCTCGACTTGCTAAGCGACTCGCGACTAGCAATAGTTTCTGCAATCTCCTCAATACAATTATTTTAAGTGC]


>consensus_425#0 ACGCACAGACGTAAAACCATGATTCTTCTTGCGTCGCGTGAAACGTCGGGCAAAATATAA TAAAATGAAAAACTATCATTTTTAATTATTGTCGTCGATAACCTCGTAAGTAATTGGTAA TTATCGTATAGCCATAATTTGTTCATTGTCCTATCCTGCAAAACGAATGTTGAAAAAATG GAGAGAGAGAAGTTATATAGTATGGAGGAATGTGAGTTCGCAGTGAAAACAGATGTCCGG TTCGCATTCTTGAATTTCGCGAGTCTTTCGGTATTAATATATTAATTACGTATACAAATC GCTAATTCATTCCACGTTCTATTGAAGTTGAAACACGGTCTTTCGAAGACGAGCGCGCAT TCACGAGTAGTACATCTTAAAAAAAGCACATAATATCCATGATTATTCAATAATTTAGAT ATTGGTGATTCAAAATTATTTTCTTAAATTTTGTTTTATAATACTGGCTGAATGTATGTG CATATTTGTATCTTTTATATGCATATTTTATGCATATTTTACATTTTTTATAAAATACAT TTCGTAAAAAATATTTAAAGCAAAGTAACAGTTGCTTGATTCTATATTTTAATGTGCTAA TAATAACAATATAGATAATGACTGAATTTAATTAAGACTGAATTCATCGATCTATCATCT TTCATCTTTTACTCTCTGAATAAATGGTCCCTCTTTCATTTAATTTTCCGTATTAAATGA ACTCTGCCTCTATTAAAATATTTCGATCAGTTAAGCTTATTATTGATGACATATCAATGA AATTTTTCGAAAATCGAATTTGAAAAAAGATATAAAATAATAATTTCGATTAAAAAATCG ATCGTCTGGATCGGAAAATCTGGATGTCATGTGCTTTAAAAAAGATCAAATGTACATAGC GTAAACATAATGAAGAAAAATCGGCGTGTAGTATACGAAACCTTACGATTCGCGATGCCG AAAAGGAAGATAATTATGTTTTGAGCCGCGTTGCCGTTCACAGGGCATGCGACCATGCCA CTTGTTTCAATCGATTCAATTCGATTAATTAAAACCCCATTCGATTCGCCTAAGGTTTTC AACCGTGTATGCCTCACAGACAACGAATCTCTCGACTTGCTAAGCGACTCGCGACTAGCA ATAGTTTCTGCAATCTCCTCAATACAATTATTTTAAGTGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)