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Apis mellifera
cluster # 44 cluster # 44       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_44#0 length = 534 sequences # 10  

consensusID : consensus_44#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 534
fasta sequence
                              [CAAAAAGAAGAGGTTCAAGTATCTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAAAAAAAAATATTTTTATATATTATATATATATATATATATATATATA]

[+] EMBL BI509154             [CAAAAAGAAGAGGTTCAAGTATCTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAA                                                                 ]
[+] EMBL BI508884             [      GAAGAGGTTCAAGTATCTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAA                                                                           ]
[+] EMBL BI507300             [                      CTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAAAAAAA                                         ]
[+] EMBL BI506434             [                      CTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAATCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGAGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAAAAAAA                                         ]
[+] EMBL BI505308             [                                             GGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAATCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGAGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAAAAAAAAA                                       ]
[+] EMBL BI506955             [                                             GGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAATCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGAGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAA                                                                   ]
[+] EMBL BI503505             [                                             GGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTTCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAA                                                                   ]
[+] EMBL BI507767             [                                             GGAGAAGTTGTTTTTGGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTAC                                                                      ]
[+] EMBL BI509074             [                                                                           TTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCTGGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAATGTTGCATATTTTTATATATTATATATATATATATATATATATATA]
[+] EMBL BI505311             [                                                                                                                                                  TGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAAGCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAATCTCTTGGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGAGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCTGGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGAATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGTCGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAAAAAATAAAAAAAAA                                        ]


>consensus_44#0 CAAAAAGAAGAGGTTCAAGTATCTCTCGGACCTCAATTGCGTGAAGGAGAAGTTGTTTTT GGTGTTGCTCATATTTTTGCAAGTTTTAATGATACATTTGTCCATGTAACAGATCTTTCT GGAAGAGAAACCATTGCGCGAGTTACTGGTGGAATGAAAGTCAAAGCAGATCGTGATGAA GCTTCTCCATATGCTGCTATGCTTGCTGCTCAGGATGTAGCAGAGAAATGTAAGTCTCTT GGAATTACAGCACTTCATATTAAATTGAGGGCAACAGGAGGTAACAAAACAAAAACTCCT GGTCCAGGTGCACAATCTGCTTTACGTGCACTTGCACGTTCTAGTATGAAAATTGGTCGA ATTGAAGATGTCACACCAATTCCATCTGACTCTACTCGCAGAAAGGGTGGTCGTCGTGGT CGGAGATTATAAATTATATTTCTGTGTATGGTTTATTAACTTACAAAAATAAAAATTTAA AAAATAAAAAAAAAATATTTTTATATATTATATATATATATATATATATATATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)