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Apis mellifera
cluster # 506 cluster # 506       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_506#0 length = 1037 sequences # 4  

consensusID : consensus_506#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 1037
fasta sequence
                              [TGCGGCTCAAAAGCAATAAATTCAAATAAATTTGCATGTTTAGAAAATGTATCAACTTTAGATCAAGATAAACGAATAACATCTCCACAACTCTCTGGATCAAGGTCTACTGGACCAAGAGAGTATGGTCGTGACTACAAACCTTCCTATGATGGTAGGAGTTCACGAAATGGTAGTCATCAACTAAACAGTTCGTCGTCAAGTAGAGAAAGCTCATTATTAGATAATTCACAAAGTCAAAATGTTTCTATGCCACCACCCTCATTGAAGTCCTCACAATCTACCTCTAGCAGTCATAAACCTTCGATGACACATGAAGAATTTTTGAAAACATTAAATAAGATAATGAAAGATTATCTAAAAAATCCTATTCTCGAAAAAGTTTCATTGGCTATTCAACAAAATTTCGACAACGAATTATCAAAATTCACATCTGAATTGATTAACTTTGTACTTGAAAAATCACCCCTTGATAGAGAAATCATATCGGTTCTTCTATCTCATTTGATTACTCAAAAGATTTTACCTATATCACATCTAAGGAATGGATTCATTGAAATATTGGATGTAGTTGATGATCTTGTGCTTGACATACCTAAAGTTTGGTCATATATACCGGAGATACTATCACATCCAATAGAAGAGGAAATACTCTCTCTAAATGAATTGAAACCTATATTTGATAGTTTAAGGGGTAGGGGATATNNNANGAATATTCCTTGGAGAATTATTATCAAAACTATCCCGGGATAAAGGATCTAAATGGGTTGCAGATAAGTGGGACCAAAGTGGACTTCAATTGAATAATATAATTGATACAGAACTTGAAAAAGTTGATAAAATTATTAAAGATTATNNTTTGGAGTTCTGCACTGGTGATTATAATAGTGCCAAAAGCTCAACTAGTAATCAGCTCACATTACAACAAATTCATGATGAACTTAGAAAACTCATGAAAGAAAGTAATTTCGATGTAATTTGTGGTTGGATAATTGAAAATGTAGGTAATCGAATTAAAGAACCTGAATTTATTCGAG]

[+] EMBL BI505602             [TGCGGCTCAAAAGCAATAAATTCAAATAAATTTGCATGTTTAGAAAATGTATCAACTTTAGATCAAGATAAACGAATAACATCTCCACAACTCTCTGGATCAAGGTCTACTGGACCAAGAGAGTATGGTCGTGACTACAAACCTTCCTATGATGGTAGGAGTTCACGAAATGGTAGTCATCAACTAAACAGTTCGTCGTCAAGTAGAGAAAGCTCATTATTAGATAATTCACAAAGTCAAAATGTTTCTATGCCACCACCCTCATTGAAGTCCTCACAATCTACCTCTAGCAGTCATAAACCTTCGATGACACATGAAGAATTTTTGAAAACATTAAATAAGATAATGAAAGATTATCTAAAAAATCCTATTCTCGAAAAAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL BI509930             [                                                                                                                                                                                                                                           GTCAAAATGTTTCTATGCCACCACCCTCATTGAAGTCCTCACAATCTACCTCTAGCAGTCATAAACCTTCGATGACACATGAAGAATTTTTGAAAACATTAAATAAGATAATGAAAGATTATCTAAAAAATCCTATTCTCGAAAAAGTTTCATTGGCTATTCAACAAAATTTCGACAACGAATTATCAAAATTCACATCTGAATTGATTAACTTTGTACTTGAAAAATCACCCCTTGATAGAGAAATCATATCGGTTCTTCTATCTCATTTGATTACTCAAAAGATTTTACCTATATCACATCTAAGGAATGGATTCATTGAAATATTGGATGTAGTTGATGATCTTGTGCTTGACATACCTAAAGTTTGGTCATATATACCGGAGATACTATCACATCCAATAGAAGAGGAAATACTCTCTCTAAATGAATTGAAACCTATATTTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI505400             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACCCCTTGATAGAGAAATCATATCGGTTCTTCTATCTCATTTGATTACTCAAAAGATTTTACCTATATCACATCTAAGGAATGGATTCATTGAAATATTGGATGTAGTTGATGATCTTGTGCTTGACATACCTAAAGTTTGGTCATATATACCGGAGATACTATCACATCCAATAGAAGAGGAAATACTCTCTCTAAATGAATTGAAACCTATATTTGATAGTTTAAGGGGTAGGGGATATNNNANGAATATTCCTTGGAGAATTATTATCAAAACTATCCCGGGATAAAGGATCTAAATGGGTTGCAGATAAGTGGGACCAAAGTGGACTTCAATTGAATAATATAATTGATACAGAACTTGAAAAAGTTGATAAAATTATTAAAGATTATNNTTTGGAGTTCTGCACTGGTGATTATAATAGTGCCAAAAGCTCAACTAGTAATCAGCTCACATTACAACAAATTCATGATGAACTTAGAAAACTCATGAAAGAAAGTAATTTCGATGTAATTTGTGGTTGGATAATTGAAAATGTAGGTAATCGAATTAAAGAACCTGAATTTATTCGAG]
[+] EMBL BI506295             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACCCCTTGATAGAGAAATCATATCGGTTCTTCTATCTCATTTGATTACTCAAAAGATTTTACCTATATCACATCTAAGGAATGGATTCATTGAAATATTGGATGTAGTTGATGATCTTGTGCTTGACATACCTAAAGTTTGGTCATATATACCGGAGATACTATCACATCCAATAGAAGAGGAAATACTCTCTCTAAATGAATTGAAACCTATATTTGATAGTTTAAGGGGTAGGGGATAT GTAGGAATATTCCTTGGAGAATTATTATCAAAACTATCCCGGGATAAAGGATCTAAATGGGTTGCAGATAAGTGGGACCAAAGTGGACTTCAATTGAATAATATAATTGATACAGAACTTGAAAAAGTTGATAAAATTATTAAAGATTATNNTTTGGAGTTCTGCACTGGTGATTATAATAGTGCCAAAAGCTCAACTAGTAATCAGCTCACATTACAACAAATTCATGATGAACTTAGAAAACTCATGAAAGA                                                                             ]


>consensus_506#0 TGCGGCTCAAAAGCAATAAATTCAAATAAATTTGCATGTTTAGAAAATGTATCAACTTTA GATCAAGATAAACGAATAACATCTCCACAACTCTCTGGATCAAGGTCTACTGGACCAAGA GAGTATGGTCGTGACTACAAACCTTCCTATGATGGTAGGAGTTCACGAAATGGTAGTCAT CAACTAAACAGTTCGTCGTCAAGTAGAGAAAGCTCATTATTAGATAATTCACAAAGTCAA AATGTTTCTATGCCACCACCCTCATTGAAGTCCTCACAATCTACCTCTAGCAGTCATAAA CCTTCGATGACACATGAAGAATTTTTGAAAACATTAAATAAGATAATGAAAGATTATCTA AAAAATCCTATTCTCGAAAAAGTTTCATTGGCTATTCAACAAAATTTCGACAACGAATTA TCAAAATTCACATCTGAATTGATTAACTTTGTACTTGAAAAATCACCCCTTGATAGAGAA ATCATATCGGTTCTTCTATCTCATTTGATTACTCAAAAGATTTTACCTATATCACATCTA AGGAATGGATTCATTGAAATATTGGATGTAGTTGATGATCTTGTGCTTGACATACCTAAA GTTTGGTCATATATACCGGAGATACTATCACATCCAATAGAAGAGGAAATACTCTCTCTA AATGAATTGAAACCTATATTTGATAGTTTAAGGGGTAGGGGATATNNNANGAATATTCCT TGGAGAATTATTATCAAAACTATCCCGGGATAAAGGATCTAAATGGGTTGCAGATAAGTG GGACCAAAGTGGACTTCAATTGAATAATATAATTGATACAGAACTTGAAAAAGTTGATAA AATTATTAAAGATTATNNTTTGGAGTTCTGCACTGGTGATTATAATAGTGCCAAAAGCTC AACTAGTAATCAGCTCACATTACAACAAATTCATGATGAACTTAGAAAACTCATGAAAGA AAGTAATTTCGATGTAATTTGTGGTTGGATAATTGAAAATGTAGGTAATCGAATTAAAGA ACCTGAATTTATTCGAG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)