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Apis mellifera
cluster # 516 cluster # 516       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_516#0 length = 733 sequences # 4  

consensusID : consensus_516#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 733
fasta sequence
                              [CTCACTGATAAGAGCTGCTACTTGTTCCATTAACCAAACATTTTTTCCAGCTGACTTTTTCACAGTTTTTAACAGTTTTTTAACTGTTTCTTGTTCTAATATCACAAGAGCATATTTTTTGGATTTGGATAAGTGATTGAATGCAGCTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGTATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGATCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTACATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTAGTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCTAAACATCTTGTAATACTGCTTCCTGCTCGAGGTCCTGCTAAACCTAAAGCAGTTAAAGCTGCTAAAGCACCTCTAGTTAATGTAGTGTCATCTTTCGGTGCTTCTTCCAATCCTCTGACTACTCTCTATAACATGATAATTTTAGTTATAATAGTTATATTATTATATTTTTTTAATATATAACATTTTTTATTATTAATTATTTCACAATATTATATAATATAAAATCTTACTTCGATATAAAAATCTAAGCGAGTATTTACAGCACTGTCAACAAAATTCTTCATATTTTGTAATTGTGATAATATTTCTTTTAAGCTGTTTTGATAAATTCTACGCG]

[+] EMBL BI516324             [CTCACTGATAAGAGCTGCTACTTGTTCCATTAACCAAACATTTTTTCCAGCTGACTTTTTCACAGTTTTTAACAGTTTTTTAACTGTTTCTTGTTCTAATATCACAAGAGCATATTTTTTGGATTTGGATAAGTGATTGAATGCAGCTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGTATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGATCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTACATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTAGTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCTAAACATCTTGTAATACTGCTTCCTGCTCGAGGTCCTGCTAAACCTAAAGCAGTTAAAGCTGCTAAAGCACCTCTAGTTAATGTAGTGTCATCTTTCGGTGCTTCTTCCAATCCTCTGACTACTCTCTATAACATGATAATTTTAGTTATAATAGTTATATTATTATATTTTTTTAATATATAACATTTTT                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL BI505446             [                                                                                 AACTGTTTCTTGTTCTAATATCACAAGAGCATATTTTTTGGATTTGGATAAGTGATTGAATGCAGCTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGTATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGATCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTACATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTAGTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCTAAACATCTTGTAATACTGCTTCCTGCTCGAGGTCCTGCTAAACCTAAAGCAGTTAAAGCTGCTAAAGCACCTCTAGTTAATGTAGTGTCATCTTTCGGTGCTTCTTCCAATCCTCTGACTACTCTCTATAACATGATAATTTTAGTTATAATAGTTATATTATTATATTTTTTTAATATATAACATTTTTTATTATTAATTATTTCACAATATTATATAATATAAAATCTTACTTCGATATAAAAATCTAAGCGAGTATTTACAGCACTGTCAACAAAATTCTTCATATTTTGTAATTGTGATAATATTTCTTTTAAGCTGTTTTGATAAATTCTACGCG]
[+] EMBL BI512986             [                                                                                                                                 TAAGTGATTGAATGCAGCTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGTATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGATCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTACATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTAGTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCTAAACATCTTGTAATACTGCTTCCTGCTCGAGGTCCTGCTAAACCTAAAGCAGTTAAAGCTGCTAAAGCACCTCTAGTTAATGTAGTGTCATCTTTCGGTGCTTCTTCCAATCCTCTGACTACTCTCTATAACATGATA                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL BI508154             [                                                                                                                                                  CTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGTATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGATCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTACATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTAGTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]


>consensus_516#0 CTCACTGATAAGAGCTGCTACTTGTTCCATTAACCAAACATTTTTTCCAGCTGACTTTTT CACAGTTTTTAACAGTTTTTTAACTGTTTCTTGTTCTAATATCACAAGAGCATATTTTTT GGATTTGGATAAGTGATTGAATGCAGCTGCAACTAACAACAAAGTCTGTCCACAATTGGT ATTTTCGACTAGACAATTTAAGGATGGTATTAAATCTTTTGCAAAAGATTCCAAATAAGA TCTATCAATATTTCTGGACCACCATCTTTAACAAATTGGTTTATCGCCATGGCGGAACTA CATACACTCGCTAATGCTCGTAAAGATGCTGCGACGAAATCTATTGATGTTTTTCCAGTA GTGATTACAGATGTCAAAAGTGCTCTAATACCTAAACATCTTGTAATACTGCTTCCTGCT CGAGGTCCTGCTAAACCTAAAGCAGTTAAAGCTGCTAAAGCACCTCTAGTTAATGTAGTG TCATCTTTCGGTGCTTCTTCCAATCCTCTGACTACTCTCTATAACATGATAATTTTAGTT ATAATAGTTATATTATTATATTTTTTTAATATATAACATTTTTTATTATTAATTATTTCA CAATATTATATAATATAAAATCTTACTTCGATATAAAAATCTAAGCGAGTATTTACAGCA CTGTCAACAAAATTCTTCATATTTTGTAATTGTGATAATATTTCTTTTAAGCTGTTTTGA TAAATTCTACGCG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)