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Apis mellifera
cluster # 525 cluster # 525       Sequences # 4       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_525#0 length = 777 sequences # 4  

consensusID : consensus_525#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 777
fasta sequence
                              [GTTTATATTCTAAGGTATTTCCTTCGATACGTTATAATGAATGTGTGAAATTCAGCCAGAAAGAAATCGAATTCGAAGATGATGCAATATCGTCGCGTTCATGTTATCTATTATTATTTGTTGTACCATTGATTTTCTAACGTGAAATTGAGAATTTCGCTCCTGTATATTTCATTGGAAATTGTATAACGAGGTTTCTATATATTTTTTAACTAGTAGAGTACGATGACATTTAATTTTCACAAAGAGACAGGCACAACCAGCGTACCTTAGAATACTAAACAATTTTTAAGTCTTTACCTCCCTTAGGATTTATCGTATAAAGAGACTGCATAATTTGCGCGTATCCTGCACGTTTTTCTACGATCTTACTATATTACATTTCGTTTCTTTAAAAGAGAATGAGAAAAGAGAGGACGAATTTAGGAAAAGATGATTGTTCGTGAACTGTTTCCTTAAATCGATGATGCATTTTNNNATTTTCTTTAAAGGGACAGTGTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGGATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGTTCCCCCATTATGTGTATAAATTTTTAATTTTTAGAGCACTCGGAATACTTGTCTAGACGACAGCTGTAATTTTTAGCTGTAATTATAAATATAAATATCTAGGGATAATTCGCGCACGTAACGCGAGTGAAACACTTGTAAAACATTGTTAATAAACATATTACAAGATAAAAAAAAAA]

[+] EMBL BI510389             [GTTTATATTCTAAGGTATTTCCTTCGATACGTTATAATGAATGTGTGAAATTCAGCCAGAAAGAAATCGAATTCGAAGATGATGCAATATCGTCGCGTTCATGTTATCTATTATTATTTGTTGTACCATTGATTTTCTAACGTGAAATTGAGAATTTCGCTCCTGTATATTTCATTGGAAATTGTATAACGAGGTTTCTATATATTTTTTAACTAGTAGAGTACGATGACATTTAATTTTCACAAAGAGACAGGCACAACCAGCGTACCTTAGAATACTAAACAATTTTTAAGTCTTTACCTCCCTTAGGATTTATCGTATAAAGAGACTGCATAATTTGCGCGTATCCTGCACGTTTTTCTACGATCTTACTATATTACATTTCGTTTCTTTAAAAGAGAATGAGAAAAGAGAGGACGAATTTAGGAAAAGATGATTGTTCGTGAACTGTTTCCTTAAATCGATGATGCATTTTNNNATTTTCTTTAAAGGGACAGTGTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGGATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGT                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL BI507194             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTTTAAAGGGACAGTGTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGGATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGTTCCCCCATTATGTGTATAAATTTTTAATTTTTAGAGCACTCGGAATACTTGTCTAGACGACAGCTGTAATTTTTAGCTGTAATTATAAATATAAATATCTAGGGATAATTCGCGCACGTAACGCGAGTGAAACACTTGTAAAACATTGTTAATAAACATATTACAAGATAAAAAAAAAA]
[+] EMBL BI505533             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGGATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGTTCCCCCATTATGTGTATAAATTTTTAATTTTTAGAGCACTCGGAATACTTGTCTAGACGACAGCTGTAATTTTTAGCTGTAATTATAAATATAAATATCTAGGGATAATTCGCGCACGTAACGCGAGTGAAACACTTGTAAAACATTGTTAATAAACATATTACAAGATAAAAAAAA  ]
[+] EMBL BI506924             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  GTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGGATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGTTCCCCCATTATGTGTATAAATTTTTAATTTTTAGAGCACTCGGAATACTTGTCTAGACGACAGCTGTAATTTTTAGCTGTAATTATAAATATAAATATCTAGGGATAATTCGCGCACGTAACGCGAGTGAAACACTTGTAAAACATTGTTAATAAACATATTACAAGATAAAAAAAAAA]


>consensus_525#0 GTTTATATTCTAAGGTATTTCCTTCGATACGTTATAATGAATGTGTGAAATTCAGCCAGA AAGAAATCGAATTCGAAGATGATGCAATATCGTCGCGTTCATGTTATCTATTATTATTTG TTGTACCATTGATTTTCTAACGTGAAATTGAGAATTTCGCTCCTGTATATTTCATTGGAA ATTGTATAACGAGGTTTCTATATATTTTTTAACTAGTAGAGTACGATGACATTTAATTTT CACAAAGAGACAGGCACAACCAGCGTACCTTAGAATACTAAACAATTTTTAAGTCTTTAC CTCCCTTAGGATTTATCGTATAAAGAGACTGCATAATTTGCGCGTATCCTGCACGTTTTT CTACGATCTTACTATATTACATTTCGTTTCTTTAAAAGAGAATGAGAAAAGAGAGGACGA ATTTAGGAAAAGATGATTGTTCGTGAACTGTTTCCTTAAATCGATGATGCATTTTNNNAT TTTCTTTAAAGGGACAGTGTCACTTTTTGTGGCGAATGTTTTCCGTTGTGGATTATTCGG ATCATCCGACGGATGATCCCACGGTATATTTGCGATATATTTCGAATGTATGTTTTGTTC CCCCATTATGTGTATAAATTTTTAATTTTTAGAGCACTCGGAATACTTGTCTAGACGACA GCTGTAATTTTTAGCTGTAATTATAAATATAAATATCTAGGGATAATTCGCGCACGTAAC GCGAGTGAAACACTTGTAAAACATTGTTAATAAACATATTACAAGATAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)