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Apis mellifera
cluster # 55 cluster # 55       Sequences # 9       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_55#0 length = 1144 sequences # 9  

consensusID : consensus_55#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1144
fasta sequence
                              [TTGAAAGAATGGCCAAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCTTTTTGGTTCAGATTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTATATATTATTAATAATATAGGTATGTAATACCTATTATTAGTATCATTTT]

[+] EMBL BI515698             [TTGAAAGAATGGCCAAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL BI515440             [              cAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAAGTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGGATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAGATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAGCTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTAAACCTCAACCATCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATCTTTTTGGTTCAGATTCAGNGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTNNNGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
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[+] EMBL BI506402             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAA                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI508052             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           GCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGACTGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTTTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAA                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL BI506571             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAATATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTCGAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTA                                                 ]
[-] EMBL BI503897             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTGGAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGCTTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTAATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTGCAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATAAATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTACTCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTTTAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATGTTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCTATCATAATGCTATTATATATTATTAATAATATAGGTATGTAATACCTATTATTAGTATCATTTT]


>consensus_55#0 TTGAAAGAATGGCCAAGGGAAATCAACAAACTACTAGTCCAATTCTATCTGCTGGTGGAA GTTTAGCCAATGAGGTTGCCAAGGCTCGTCAACATATTAAACAGTCTTTACAGTGTATGG ATGACATTGCAGCTGTTGCTGGTTTTGCTACTCCCAATGAAAATAAAAAAGATATTCTAG ATTCTAGTGTCTTCCAAGAATTGAAAAATACTGTTGAAAAATTGGAGGAACGTGTCAAAG CTCTTGAAATCAAGATTCGTACTTTTGTACCTGCTGATCCAATAGCAGTTTGTCCTGCTA AACCTCAACCAGCTTCAAAACCAACACAAGAAAAAGCTGATGATGATGAAGATGTTGATC TTTTTGGTTCAGATTCAGAGGGAGAAGATGCAGAAGCTGCAAAACTTAGAGAAGAAAGAC TGGCTGCATATGCTGCAAAGAAAGCTAAAAAGCCAGCCTTAATTGCTAAATCAAATATAA TATTGGATGTAAAACCGTGGGATGATGAAACGGATATGAAAGCCATGGAAGAAGAAGTTC GAAAGATTGAAACTGATGGACTTTTATGGGGAGCGTCAAAACTTGTTCCGCTTGCCTTTG GAATTCACAAACTTCAAATTTCGTGTGTTGTTGAAGATGACAAAGTTTCTGTAGATTGGC TTACAGAACAGATTCAAGATATCGAAGATTATGTACAAAGCGTAGATATTGCAGCCTTTA ATAAAGTATAAAATATTAACGAAGCTTTCTTCGTAGAAAAATATCTGACGGTTCTAATTG CAACCAGGCATTGGTCTGTTGTGCCATCATTTCATTCCATTAGCAATATCTACTTTGATA AATACATGTTCTATCACTAAAAAGGACTGTCTAAAAATAAAAAACATAGCGCTATTGTAC TCCAATTTTAATATTCGATGTCAATTTATCAATCGTTTTTAAAATATTCAAGCAAATTTT TAAATTGTGGTTGTATGATCAATATATTCTTTATAAAGAAAAAAATATAAACCATAAATG TTTTAAACGTAATTCAATGTATAAAATTTAATGTAACATCATATAGATATTTCATTTGCT ATCATAATGCTATTATATATTATTAATAATATAGGTATGTAATACCTATTATTAGTATCA TTTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)