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Apis mellifera
cluster # 69 cluster # 69       Sequences # 8       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_69#0 length = 741 sequences # 8  

consensusID : consensus_69#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 8
consensus length = 741
fasta sequence
                              [TAAACATCGATTTGGCTATCCATTTTCGGTTACTCTTCTCAAACTATCATGCCACGTTCTACAGTGATATTATTTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGATGCTATCTAAAATAATTAGTCTT-AAAAAAAAAAAACAAGAAATAATTCTCGAAATGTATATAGTTCCTAGTTTCTAATTCTCGAAATGTATATGTATATACATTTTAAGTTAGATAATAAATATAATTTATCGCATTAAAA]

[+] EMBL BI513064             [TAAACATCGATTTGGCTATCCATTTTCGGTTACTCTTCTCAAACTATCATGCCACGTTCTACAGTGATATTATTTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATAT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL BI516768             [      TCGATTTGGCTATCCATTTTCGGTTACTCTTCTCAAACTATCATGCCACGTTCTACAGTGATATTATTTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL BI507087             [                                                                     TTATTTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGATGCTATCTAAAATAATTAGTCTTAAAAAAAAAAAAACAAGAAATAATTCTCGAAATGTATATAGTTCCTAGTTTCTAATTCTCGAAATGTATATGTATATACATTTTAAGTTAGATAATAAATATA                ]
[+] EMBL BI505744             [                                                                         TTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGATGCTATCTAAAATAATTAGTCTT AAAAAAAAAAAACAAGAAATAATTCTCGAAATGTATATAGTTCCTAGTTTCTAATTCTCGAAATGTATATGTATATACATTTTAAGTTAGATAATAAATATAATTTATCGCATTAAAA]
[+] EMBL BI506611             [                                                                                                    GTCAGGAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGATGCTATCTAAAATAATTAGTCTT AAAAAAAAAAAACAAGAAATAATTCTCGAAATGTATATAGTTCCTAGTTTCTAATTCTCGAAAT                                                      ]
[+] EMBL BI511089             [                                                                                                         GAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTT                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BI511205             [                                                                                                         GAAATTCTTGGACGAAGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACT                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL BI513489             [                                                                                                                                     GAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGAAAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTGTTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTCGCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACTCATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTGGAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATGTATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGNCTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTATATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGATGCTATCTAAAATAATTAGTCTT AAAAAAAAAAAACAAGA                                                                                                     ]


>consensus_69#0 TAAACATCGATTTGGCTATCCATTTTCGGTTACTCTTCTCAAACTATCATGCCACGTTCT ACAGTGATATTATTTTTCTTAATCGTACTACTGCTAAATAGTCAGGAAATTCTTGGACGA AGAGGACGAGGCAGAGGAAAAACCAGATCGCGTGTCCAAATAGGATTACCTATCACTGGA AAATATCGTGATCCAGAAAGTGATCAATATTATAACAATCATAATGGTGCAAAAATATTG TTGGCATCACACTTTGATTTGGAGTACGTTTTAGGACACAAAATTGTTTTCCTTTGCGTC GCACGTGGAAACCCACGACCGCATATCACATGGTTCAAGGATGGAGCTGAGATTTATACT CATCTTTATTTGCATGTGCACGAATGGCAAGTTGGAGAAGATAAAGTAAAATCAAAATTG GAAATAGATCCTGCAACTCAAATGGATGCTGGAGTTTACGAATGTACAGCTGATAATATG TATAGTATTGATCGAAGATCCTTCAAGACTGACTTTTCTATTGCTTTTGATTAAATTTAT ATTTTTTAAAGTAGTTTAATATAATTATAAATAAAGTTTAAAATCTTACTATCTTTAAGA TGCTATCTAAAATAATTAGTCTTAAAAAAAAAAAACAAGAAATAATTCTCGAAATGTATA TAGTTCCTAGTTTCTAATTCTCGAAATGTATATGTATATACATTTTAAGTTAGATAATAA ATATAATTTATCGCATTAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)