These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_736#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 2 consensus length = 604 fasta sequence [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTATCTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT] [+] EMBL BI508519 [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTATCTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT] [+] EMBL BI505020 [ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGTATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAAAATATGATTTTTAAATTAATTCTCTTTTAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAAGTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGCCGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGGACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCTTTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAA ] consensusID : consensus_736#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 317 fasta sequence [TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTTAAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGATTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAG] [+] EMBL BI516657 [TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTTAAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGATTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTAGTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGAAATTATAGCGATCAAAG] consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment consensus_736#0 ------------------ATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGT- 41 consensus_736#1 TAATAGAAATAATAAAAACTAAATATGTAGTTTTTGTAATATTTATTCATGTAATATTTT 60 **** * **** ** * ** ** * * * consensus_736#0 ------ATTATTTTAATAA--TATTTATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGT 93 consensus_736#1 AAAGTGATTATATACAAAAATTGTCTAAAGACAGTAGCAAAAATGCGTAACAATGTAAGA 120 ***** * * ** * * ** * * * ** * ** * consensus_736#0 ATGTATTTTTACTTCTGTATATATATATCAAAATAATGATAATAAAATTTTAA-AATATG 152 consensus_736#1 TTATAAACAAACAGTTACAGTTACGAGAGAAAATATAGTTTGTATTATTTTAATAATATT 180 * ** ** * * ** ****** * * ** ******* ***** consensus_736#0 -----ATTTTTAAATTAATTCTCTTT----TAGGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTA 203 consensus_736#1 TATTCGTTTTCATATTTTTTTAGTTCACTATATGAAATATCGACGATATATTTGTTGTTA 240 **** * *** ** ** ** *************************** consensus_736#0 GTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGA 263 consensus_736#1 GTATTAATTTTATGTGCAGAAGTGTATATGATAAATGCAAGACATCTGATTAAAAAGAGA 300 ************************************************************ consensus_736#0 AATTATAGCGATCAAAGTGTAAGAGGTTATTTAGCAGAGCGGACTTGTTGGTGGAATGAA 323 consensus_736#1 AATTATAGCGATCAAAG------------------------------------------- 317 ***************** consensus_736#0 GTTTGTAAAGAAGAATTTCACAGTAAATTTCGATGCCGTTGTCCAAGATGGTCCTATTGC 383 consensus_736#1 ------------------------------------------------------------ consensus_736#0 CGTGCTCCTGGTAGATATTATGATGCACATTGTAGTATGACACGTACAGGATATATTTGG 443 consensus_736#1 ------------------------------------------------------------ consensus_736#0 ACTCAACCAGAAACTTCATTAACTCTCGAAGTTAATAAATGAATTTCTTTTTATAAATCT 503 consensus_736#1 ------------------------------------------------------------ consensus_736#0 TTTATAAATTGCATGTATTGCAAATCAAAAATTCTGAATATCAAATTTATGTAATATTAT 563 consensus_736#1 ------------------------------------------------------------ consensus_736#0 CTTATAGAAGTTAATTAAATTTATTTAAATTTAATCTTGTT 604 consensus_736#1 ----------------------------------------- |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |