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Apis mellifera
cluster # 765 cluster # 765       Sequences # 3       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_765#0 length = 917 sequences # 3  

consensusID : consensus_765#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 3
consensus length = 917
fasta sequence
                              [ATCATTTTTTAAAAGAAATTGAGCTTGAGATGAGTAATTTTATATCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTTAGGCTAAAATTTCATTAATTTTGCACTGAGAGATATTCATTATTATTAGATGACACCGATAGTGCCCGAACAGCTACAGATGGATGCTTAAATATTAATAGAGATGCAATAGCAGAACCTCTTTATACACTTTTAGGTGAAATTTTCGATCTTCGAGNNNTATTTCGATGGCTTNGACGCTCATTAATTACTTTTGTTCAAATTACTTATGGGCGAACTATAAATAGACAAATCAGAGATACTATTGCATGGGTGTTCTCAGAACCAATGCTTCATTACTACATACAATTGTTTACGAAATCATGNNNGCCAAATGGTCATTTAGTTTCTGAGACAATTTCTCGTTCAGATGAAGAAAAACTAAAAACTCGAGNAGAAGCACGAAGACAATTTTTAAATAATATACCCGATGTTTTAACAAATTTAGTAGGATCACAAAGTGCACAACGTGGTGCAATTAAGATTTTTGACTCTTTACAGAATGTGAATTTAAATAAACAATTATTTTATGATATCTTTGAAGTTTTGATGTATGAAATATTTCCAGAATTTAAACGAATACAATAAATTTTTAAATTATATTTTTTATATATGTTAAAATTGAAAAGAATCATGTTATTATATTTGTATTATATATGATTTATTCAATTGAAATTATTTTGTATAATACAACATAAGTATATGACACAAATTATTTAAAATCTTAAATATAAGAAATCAAATATTTTTAATAAAAGTTAAATAATATTATTAATTATTGTTATAAAATACGTATACTATATAAAAATAATGTAAATTATGTAAATTATTTATATAGGATTTTAAATAATAACAAATGATA]

[+] EMBL BI508203             [ATCATTTTTTAAAAGAAATTGAGCTTGAGATGAGTAATTTTATATCCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTTAGGCTAAAATTTCATTAATTTTGCACTGAGAGATATTCATTATTATTAGATGACACCGATAGTGCCCGAACAGCTACAGATGGATGCTTAAATATTAATAGAGATGCAATAGCAGAACCTCTTTATACACTTTTAGGTGAAATTTTCGATCTTCGAGNNNTATTTCGATGGCTTNGACGCTCATTAATTAC TTTGTTCAAATTACTTATGGGCGAACTATAAATAGACAAATCAGAGATACTATTGCATGGGTGTTCTCAGAACCAATGCTTCATTACTACATACAATTGTTTACGAAATCATGNNNGCCAAATGGTCATTTAGTTTCTGAGACAATTTCTCGTTCAGATGAAGAAAAACTAAAAACTCGAGNAGAAGCACGAAGACAATTTTTAAATAATATACCCGATGTTTTAACAAATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL BI504883             [                                                                                                                                                                                                                        AATTTTCGATCTTCGAGGTGTATTTCGATGGCTTAGACGCTCATTAATTACTTTTGTTCAAATTACTTATGGTCGAACTATAAATAGACAAATCAGAGATACTATTGCATGGGTGTTCTCAGAACCAATGCTTCATTACTACATACAATTGTTTACGAAATCATGGTGGCCAAATGGTCATTTAGTTTCTGAGACAATTTCTCGTTCAGATGAAGAAAAACTAAAAACTCGAGGAGAAGCACGAAGACAATTTTTAAATAATATACCCGATGTTTTAACAAATTTAGTAGGATCACAAAGTGCACAACGTGGTGCAATTAAGATTTTTGACTCTTTACAGAATGTGAATTTAAATAAACAATTATTTTATGATATCTTTGAAGTTTTGATGTATGAAATATTTCCAGAATTTAAACGAATACAATAAATTTTTAAATTATATTTTTTATATATGTTAAAATTGAAAAGAATCATGTTATTATATTTGTATTATATATGATTTATTCAATTGAAATTATTTTGTATAATACAACATAAGTATATGACACAAATTATTTAAAATCTTAAATATAAGAAATCAAATATTTTTAATAAAAGTTAAATAATATTATTAATTATTGTTATAAAATACGTATAC                                                                ]
[-] EMBL BI516635             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TACCCGATGTTTTAACAAATTTAGTAGGATCACAAAGTGCACAACGTGGTGCAATTAAGATTTTTGACTCTTTACAGAATGTGAATTTAAATAAACAATTATTTTATGATATCTTTGAAGTTTTGATGTATGAAATATTTCCAGAATTTAAACGAATACAATAAATTTTTAAATTATATTTTTTATATATGTTAAAATTGAAAAGAATCATGTTATTATATTTGTATTATATATGATTTATTCAATTGAAATTATTTTGTATAATACAACATAAGTATATGACACAAATTATTTAAAATCTTAAATATAAGAAATCAAATATTTTTAATAAAAGTTAAATAATATTATTAATTATTATTATAAAATACGTATACTATATAAAAATAATGTAAATTATGTAAATTATTTATATAGGATTTTAAATAATAACAAATGATA]


>consensus_765#0 ATCATTTTTTAAAAGAAATTGAGCTTGAGATGAGTAATTTTATATCCTTTTCTTTTTTTT TTTTTTTTAATTTCTTAGGCTAAAATTTCATTAATTTTGCACTGAGAGATATTCATTATT ATTAGATGACACCGATAGTGCCCGAACAGCTACAGATGGATGCTTAAATATTAATAGAGA TGCAATAGCAGAACCTCTTTATACACTTTTAGGTGAAATTTTCGATCTTCGAGNNNTATT TCGATGGCTTNGACGCTCATTAATTACTTTTGTTCAAATTACTTATGGGCGAACTATAAA TAGACAAATCAGAGATACTATTGCATGGGTGTTCTCAGAACCAATGCTTCATTACTACAT ACAATTGTTTACGAAATCATGNNNGCCAAATGGTCATTTAGTTTCTGAGACAATTTCTCG TTCAGATGAAGAAAAACTAAAAACTCGAGNAGAAGCACGAAGACAATTTTTAAATAATAT ACCCGATGTTTTAACAAATTTAGTAGGATCACAAAGTGCACAACGTGGTGCAATTAAGAT TTTTGACTCTTTACAGAATGTGAATTTAAATAAACAATTATTTTATGATATCTTTGAAGT TTTGATGTATGAAATATTTCCAGAATTTAAACGAATACAATAAATTTTTAAATTATATTT TTTATATATGTTAAAATTGAAAAGAATCATGTTATTATATTTGTATTATATATGATTTAT TCAATTGAAATTATTTTGTATAATACAACATAAGTATATGACACAAATTATTTAAAATCT TAAATATAAGAAATCAAATATTTTTAATAAAAGTTAAATAATATTATTAATTATTGTTAT AAAATACGTATACTATATAAAAATAATGTAAATTATGTAAATTATTTATATAGGATTTTA AATAATAACAAATGATA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)