These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Apis mellifera see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_861#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 860 fasta sequence [CCATTTTTAGCAATATTAGGAGGTGCTAAAGTTGCAGATAAAATACAGTTAATTGATAATTTACTAGATAAAGTTAATGAAATGATAATAGGTGGTGGAATGGCTTATACCTTTTTAAAAATATCGAAAAATATGAAGATTGGTAATTCATTATTTGACGAGGAAGGAGCAAAAATCATTAATAATTTATTATCAAAAGCTGAAAAAAATAAAGTCCAAATACATTTGCCAATTGATTTTGTTACGGCAGATAAATCTGCAGAAAATGCAACTGTTGGTGCAGCAGATATAGAAAGTGGTATACCTGATGGCTGGATGGGACTTGATGTTGGACCAAAATCAAGAGAATTGTTCAGTCAACCTATTAAAAGAGCAAAAACAATCGTATGGAATGGTCCTGCTGGTGTTTTTGAATTTGAAAATTTTAGTAAAGGCACTAAAAGTCTAATGGATAATGTTGTTGAAGCAACATCAAAAGGTGCTATTTCTATAATTGGTGGTGGTGATACAGCTACTTGCGCTGCTAAATGGAAAACAGAAGATAAAGTAAGCCATGTTAGTACTGGCGGTGGTGCAAGTTTGGAATTACTTGAAGGAAAAGTTTTACCAGGAGTTGCTGCTTTATCTTCGTTGTAATTTCTAGTTTATTCGATATCATCTACATCTATAGATTTTGGTTAGATCTCAAAAATGTTAATTTCATTTAATTATTAAATTAGCAATAATATATAATAAAACAAAAATGTTTATTNNTAAATGTTATATAAATTACCTTTGTAATCTATATTATATGTAATTTATATTTAGAAAATATCTATATTCATCTCATATTTATATATGAGATACATCAATATTCGTAA] [+] EMBL BI513224 [CCATTTTTAGCAATATTAGGAGGTGCTAAAGTTGCAGATAAAATACAGTTAATTGATAATTTACTAGATAAAGTTAATGAAATGATAATAGGTGGTGGAATGGCTTATACCTTTTTAAAAATATCGAAAAATATGAAGATTGGTAATTCATTATTTGACGAGGAAGGAGCAAAAATCATTAATAATTTATTATCAAAAGCTGAAAAAAATAAAGTCCAAATACATTTGCCAATTGATTTTGTTACGGCAGATAAATCTGCAGAAAATGCAACTGTTGGTGCAGCAGATATAGAAAGTGGTATACCTGATGGCTGGATGGGACTTGATGTTGGACCAAAATCAAGAGAATTGTTCAGTCAACCTATTAAAAGAGCAAAAACAATCGTATGGAATGGTCCTGCTGGTGTTTTTGAATTTGAAAATTTTAGTAAAGGCACTAAAAGTCTAATGGATAATGTTGTTGAAGCAACATCAAAAGNNNCTATTTCTATAATTGGTGGTGGTGATACAGCTACTTGCGCTGCTAAATGGAAAACAGAAGATAAAGTA ] [+] EMBL BI504768 [ CTGAAAAAAATAAAGTCCAAATACATTTGCCAATTGATTTTGTTACGGCAGATAAATTTGCAGAAAATGCAACTGTTGGTGCAGCAGATATAGAAAGTGGTATACCTGATGGCTGGATGGGACTTGATGTTGGACCAAAATCAAGAGAATTGTTCAGTCAACCTATTAAAAGAGCAAAAACAATCGTATGGAATGGTCCTGCTGGTGTTTTTGAATTTGAAAATTTTAGTAAAGGCACTAAAAGTCTAATGGATAATGTTGTTGAAGCAACATCAAAAGGTGCTATTTCTATAATTGGTGGTGGTGATACAGCTACTTGCGCTGCTAAATGGAAAACAGAAGATAAAGTAAGCCATGTTAGTACTGGCGGTGGTGCAAGTTTGGAATTACTTGAAGGAAAAGTTTTACCAGGAGTTGCTGCTTTATCTTCGTTGTAATTTCTAGTTTATTCGATATCATCTACATCTATAGATTTTGGTTAGATCTCAAAAATGTTAATTTCATTTAATTATTAAATTAGCAATAATATATAATAAAACAAAAATGTTTATTGTTAAATGTTATATAAATTACCTTTGTAATCTATATTATATGTAATTTATATTTAGAAAATATCTATATTCATCTCATATTTATATATGAGATAC ] [+] EMBL BI512468 [ AGAAAGTGGTATACCTGATGGCTGGATGGGACTTGATGTTGGACCAAAATCAAGAGAATTGTTCAGTCAACCTATTAAAAGAGCAAAAACAATCGTATGGAATGGTCCTGCTGGTGTTTTTGAATTTGAAAATTTTAGTAAAGGCACTAAAAGTCTAATGGATAATGTTGTTGAAGCAACATCAAAAGGTGCTATTTCTATAATTGGTGGTGGTGATACAGCTACTTGCGCTGCTAAATGGAAAACAGAAGATAAAGTAAGCCATGTTAGTACTGGCGGTGGTGCAAGTTTGGAATTACTTGAAGGAAAAGTTTTACCAGGAGTTGCTGCTTTATCTTCGTTGTAATTTCTAGTTTATTCGATATCATCTACATCTATAGATTTTGGTTAGATCTCAAAAATGTTAATTTCATTTAATTATTAAATTAGCAATAATATATAATAAAACAAAAATGTTTATTNNTAAATGTTATATAAATTACCTTTGTAATCTATATTATATGTAATTTATATTTAGAAAATATCTATATTCATCTCATATTTATATATGAGATACATCAATATTCGTAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |