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Apis mellifera
cluster # 99 cluster # 99       Sequences # 7       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_99#0 length = 660 sequences # 7  

consensusID : consensus_99#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 660
fasta sequence
                              [CAGCTCTACAGACAAGAGCATTACAAATCTTGTGCTTAAGAGTTCGAAAAAAATAAACAATTTCCAAGATGAAATTCATCGTGTTGGTTCTCTTCTGTGCCGTTGCATACGTTTCTGCTCAAGCGGAATTGGAACCTGAGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA-------TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTATAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL AM15956              [CAGCTCTACAGACAAGAGCATTACAAATCTTGTGCTTAAGAGTTCGAAAAAAATAAACAATTTCCAAGATGAAATTCATCGTGTTGGTTCTCTTCTGTGCCGTTGCATACGTTTCTGCTCAAGCGGAATTGGAACCTGAGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA       TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATAT                         ]
[+] EMBL BI946515             [                             TTGTGCTTAAGAGTTCGAAAAAAATAAACAATTTCCAAGATGAAATTCATCGTGTTGGTTCTCTTCTGTGCCGTTGCATACGTTTCTGCTCAAGCGGAATTGGAACCTGAGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAATCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGA                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL BI506074             [                                                                                                                                          AGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA       TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTATAAAAAAAA   ]
[+] EMBL BI508391             [                                                                                                                                          AGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA       TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTATAAAAAAAA   ]
[+] EMBL BI507668             [                                                                                                                                                                              GACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAATCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA       TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTAAAAAAAAA    ]
[+] EMBL BI509977             [                                                                                                                                                                              GACAAGAAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACATTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGACTAAACATTCGTCCTGGACAATCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAA       TAACAATTAAATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTAAAAAAAAA    ]
[+] EMBL BI509687             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAATATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTTCACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAATAACAATTAACAATTAAATTAGAGATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTTGATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATTGTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTATAAAAAAAAAAA]


>consensus_99#0 CAGCTCTACAGACAAGAGCATTACAAATCTTGTGCTTAAGAGTTCGAAAAAAATAAACAA TTTCCAAGATGAAATTCATCGTGTTGGTTCTCTTCTGTGCCGTTGCATACGTTTCTGCTC AAGCGGAATTGGAACCTGAGGATACAATGGATTATATCCCGACTCGTTTCCGACGACAAG AAAGAGGATCCATTGTCATTCAAGGAACTAAAGAGGGAAAAAGTCGTCCATCCTTGGACA TTGATTACAAACAACGTGTCTACGATAAGAATGGAATGACAGGAGACGCCTATGGTGGAC TAAACATTCGTCCTGGACAACCTAGTCGACAGCATGCAGGATTCGAGTTTGGGAAAGAAT ATAAGAATGGTTTCATCAAAGGACAAAGTGAAGTTCAACGTGGTCCTGGTGGCAGGCTTT CACCATACTTTGGAATAAATGGTGGATTTAGATTTTGAGATATTTTCAAATAACAATTAA ATTAGCCATTTACATAGCATTTAATAATTATTTATTCCAGTAATGCATTTATTTCATTTT GATCTTATTAATTTATAAAAATTTGGCATTGAAAGAAAATTGATAGATTGTAATTCAATT GTATTAATTACAATATAAGAGATTCGAATAAATATAATTTTATCATTATAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Fri Aug 8 13:08:45 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)