These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_10590#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 2328 fasta sequence [AGCGCTCGCCGCCGCCGCCGCCTCCTCTTCTCCGTCGCCGGCAGCCGGTCGCCGCCACCGCCGCCGATCCGAGCCCGACCGCCAGCCACCCGCTAGCTCCCTCTCTCGCGTTTCCAAACCCCCAAAAAGGTGGTGCCGCCGCCCCGTGTTCCTCAGGCGCTACCACTAATAACAAACTAGAAGAAAAGGGAGGGTTTCCTGCGATTTCTCCTCGATGCTCCGGATCGCCTCTCGCGCGGGTTTGCTCGGTGGTAGGAGATGCTACAGCGCCGCCGCCAAGAGCGGCCCCTCGATCGCCGGGGTAAGCGACATCATCGCCGTCGCCTCCGGGAAAGGCGGCGTCGGCAAGTCCACCACTGCAGTTAACATTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGCGTAGCAACAAGCAAGTCCATACGCATGTTATTGAAATATGGTTGCTTTTTGTAATTTTTGTAATCTTCGGGACAACAGTGTTGGTAGGATAGAAAGAGCTAGTGGATGTGGACGTTTTCTTTACCTTTTCATTCCACATTTTTAGTTTTTCTCTATCAAAACTACAATATATATTGAAATGACTAGTTAAAATTATTTAATATTGCCCCTGAAACCTTTAAATGCTGCATGTTTGATAATTCCATGGCAATAGCACATCATGATTCATGAATTGCAACAAAATAGGCTATTTTCTAGAATTTTCAAAAAAAAAAAAAAACTCATCTATTTGTCTATGCAAATTTAACAAACAGGTTCAATCCTACGTGTGAGGTAGAAAAAAAAAGACAAATTGTACGTGCAATACCAACAAAAATATATTATTGACATCAATACCACTCTTTTGTGGTATTCCTTTAGTTGTGCAATTGTTTGTGAAATTTTTTGTATGGACGCAAGACATAACCTCACCTATGGCTGTGTTTTCTTTGAGAATTTCGTAGAGCTTCTTTGTATGATTCTCTAGGAATATGCACATTGATAATATGTTTACCTTGAAAGACTATTGTTTCATGCTTCCATTTTGGTCTATTGTTTTATAAAATTTATGTTCCTTATACTACAACATTTCTTGGTATCAGGTAATGAGTGCTCTTGAGAAGATTACAAGGGGGGTAGCCTGGGGTAATCTTGATATTCTTGTTGTTGATATGCCCCCGGGCACTGGTGATGCTCAGCTATCAATGTCCCAAAGGCTTCGGTTATCTGGTGCTTTAATTGTTTCAACTCCCCAAGATATCGCTCTAATTGATGCTAGAAGAGGAGCAAATATGTTTCGTAAAGTTCAAGTCCCTATTCTGGGTTTAGTGGAGAATATGAGCTGTTTCAAGTGCCCGAAGTGTGGTGAGAAGTCTTACATTTTTGGGGAAGGTGGAGGTCAGAGAACTGCAGAAGAAATGGATATGAAATTAATCGGTGAGATACCTCTTGAAATCGACATCAGAACAGGTTCAGATGAAGGTACTCCAATTGTGATATCATCACCAGATTCTGCATCGGCACAGGCCTACATACAGGTCGCTGAGAAGGTGATCCACAGGCTGAAGGAGTTAGCCGAGGAACGACAGATGGGACCAGAAATCTTGCTTTGAGAGTTCATACCGCCCCTGTAGAACTGTTCCCGTTCCTCTTCTGGTTCGAGCTGCATCCCAGTAGCTGATAGCCTTTCACTCAAAATAAGAAGTAAACATTTGGTAACATCCTTGTCAGCCCCACAAAGTGTAGAGGCCGGGTTTGATAATCCTTTATCTAAAAAAACATCCTTGTCACCCATGTACTTTTGCCAAATTTTGTAACATTGCAGAAATATTGTTGAATCCTGGTATAGGATCATATACTCATGTACCATTTTAGAGAAGTAAGGAATTTT] [+] EMBL AK106686 [AGCGCTCGCCGCCGCCGCCGCCTCCTCTTCTCCGTCGCCGGCAGCCGGTCGCCGCCACCGCCGCCGATCCGAGCCCGACCGCCAGCCACCCGCTAGCTCCCTCTCTCGCGTTTCCAAACCCCCAAAAAGGTGGTGCCGCCGCCCCGTGTTCCTCAGGCGCTACCACTAATAACAAACTAGAAGAAAAGGGAGGGTTTCCTGCGATTTCTCCTCGATGCTCCGGATCGCCTCTCGCGCGGGTTTGCTCGGTGGTAGGAGATGCTACAGCGCCGCCGCCAAGAGCGGCCCCTCGATCGCCGGGGTAAGCGACATCATCGCCGTCGCCTCCGGGAAAGGCGGCGTCGGCAAGTCCACCACTGCAGTTAACATTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGCGTAGCAACAAGCAAGTCCATACGCATGTTATTGAAATATGGTTGCTTTTTGTAATTTTTGTAATCTTCGGGACAACAGTGTTGGTAGGATAGAAAGAGCTAGTGGATGTGGACGTTTTCTTTACCTTTTCATTCCACATTTTTAGTTTTTCTCTATCAAAACTACAATATATATTGAAATGACTAGTTAAAATTATTTAATATTGCCCCTGAAACCTTTAAATGCTGCATGTTTGATAATTCCATGGCAATAGCACATCATGATTCATGAATTGCAACAAAATAGGCTATTTTCTAGAATTTTCAAAAAAAAAAAAAAACTCATCTATTTGTCTATGCAAATTTAACAAACAGGTTCAATCCTACGTGTGAGGTAGAAAAAAAAAGACAAATTGTACGTGCAATACCAACAAAAATATATTATTGACATCAATACCACTCTTTTGTGGTATTCCTTTAGTTGTGCAATTGTTTGTGAAATTTTTTGTATGGACGCAAGACATAACCTCACCTATGGCTGTGTTTTCTTTGAGAATTTCGTAGAGCTTCTTTGTATGATTCTCTAGGAATATGCACATTGATAATATGTTTACCTTGAAAGACTATTGTTTCATGCTTCCATTTTGGTCTATTGTTTTATAAAATTTATGTTCCTTATACTACAACATTTCTTGGTATCAGGTAATGAGTGCTCTTGAGAAGATTACAAGGGGGGTAGCCTGGGGTAATCTTGATATTCTTGTTGTTGATATGCCCCCGGGCACTGGTGATGCTCAGCTATCAATGTCCCAAAGGCTTCGGTTATCTGGTGCTTTAATTGTTTCAACTCCCCAAGATATCGCTCTAATTGATGCTAGAAGAGGAGCAAATATGTTTCGTAAAGTTCAAGTCCCTATTCTGGGTTTAGTGGAGAATATGAGCTGTTTCAAGTGCCCGAAGTGTGGTGAGAAGTCTTACATTTTTGGGGAAGGTGGAGGTCAGAGAACTGCAGAAGAAATGGATATGAAATTAATCGGTGAGATACCTCTTGAAATCGACATCAGAACAGGTTCAGATGAAGGTACTCCAATTGTGATATCATCACCAGATTCTGCATCGGCACAGGCCTACATACAGGTCGCTGAGAAGGTGATCCACAGGCTGAAGGAGTTAGCCGAGGAACGACAGATGGGACCAGAAATCTTGCTTTGAGAGTTCATACCGCCCCTGTAGAACTGTTCCCGTTCCTCTTCTGGTTCGAGCTGCATCCCAGTAGCTGATAGCCTTTCACTCAAAATAAGAAGTAAACATTTGGTAACATCCTTGTCAGCCCCACAAAGTGTAGAGGCCGGGTTTGATAATCCTTTATCTAAAAAAACATCCTTGTCACCCATGTACTTTTGCCAAATTTTGTAACATTGCAGAAATATTGTTGAATCCTGGTATAGGATCATATACTCATGTACCATTTTAGAGAAGTAAGGAATTTT] [+] EMBL CB664480 [ CCGCCGCCGCCGCCTCCTCTTCTCCGTCGCCGGCAGCCGGTCGCCGCCACCGCCGCCGATCCGAGCCCGACCGCCAGCCACCCGCTAGCTCCCTCTCTCGCGTTTCCAAACCCCCAAAAAGGTGGTGCCGCCGCCCCGTGTTCCTCAGGCGCTACCACTAATAACAAACTAGAAGAAAAGGGAGGGTTTCCTGCGATTTCTCCTCGATGCTCCGGATCGCCTCTCGCGCGGGTTTGCTCGGTGGTAGGAGATGCTACAGCGCCGCCGCCAAGAGCGGCCCCTCGATCGCCGGGGTAAGCGACATCATCGCCGTCGCCTCCGGGAAAGGCGGCGTCGGCAAGTCCACCACTGCAGTTAACATTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATANATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGCGTAGC ACAAGCA ] [+] EMBL CB664482 [ CCGCCGCCGCCGCCTCCTCTTCTCCGTCGCCGGCAGCCGGTCGCCGCCACCGCCGCCGATCCGAGCCCGACCGCCAGCCACCCGCTAGCTCCCTCTCTCGCGTTTCCAAACCCCCAAAAAGGTGGTGCCGCCGCCCCGTGTTCCTCAGGCGCTACCACTAATAACAAACTAGAAGAAAAGGGAGGGTTTCCTGCGATTTCTCCTCGATGCTCCGGATCGCCTCTCGCGCGGGTTTGCTCGGTGGTAGGAGATGCTACAGCGCCGCCGCCAAGAGCGGCCCCTCGATCGCCGGGGTAAGCGACATCATCGCCGTCGCCTCCGGGAAAGGCGGCGTCGGCAAGTCCACCACTGCAGTTAACATTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAAT ] [+] EMBL CB664521 [ CCGCCGCCGCCGCCTCCTCTTCTCCGTCGCCGGCAGCCGGTCGCCGCCACCGCCGCCGATCCGAGCCCGACCGCCAGCCACCCGCTAGCTCCCTCTCTCGCGTTTCCAAACCCCCAAAAAGGTGGTGCCGCCGCCCCGTGTTCCTCAGGCGCTACCACTAATAACAAACTAGAAGAAAAGGGAGGGTTTCCTGCGATTTCTCCTCGATGCTCCGGATCGCCTCTCGCGCGGGTTTGCTCGGTGGTAGGAGATGCTACAGCGCCGCCGCCAAGAGCGGCCCCTCGATCGCCGGGGTAAGCGACATCATCGCCGTCGCCTCCGGGAAAGGCGGCGTCGGCAAGGCCACCACTGCAGGTAACATTGCTGTATCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCGATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTGTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGGCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTGTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCGTAGTGAATATAGAAGGATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTA ] [-] EMBL CB664522 [ TTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTCCCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAAGTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGTGTAGCAACAAGCAAGTCCATACGCATGTTATTGAAATATGGTTGCTTTTTGTAATTTTTGTAATCTTCGGGACAACAGTGTTGGTAGGATAGAAAGAGCTAGTGGATGTGGACGTTTTCTTTACCTTTTCATTCCACATTTTTAGTTTTTTTCTATCAAAATTACAATATATATTGAAATGACTAGTTAAAATTATTTAATATTGCCCCTGAAACCTTTAAATGCTGCATGTTTGATAATTCCATGGCAATAGCACATCATGATTCAGGAATTGCAACAAAATAGGGTATTTTGTAGAAT ] [-] EMBL CB664481 [ TTGCTGTAGCACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGCGTAGCAACAAGCAAGTCCATACGCATGTTATTGAAATATGGTTGCTTTTTGTAATTTTTGTAATCTTCGGGACAACAGTGTTGGTAGGATAGAAAGAGCTAGTGGATGTGGACGTTTTCTTTACCTTTTCATTCCACATTTTTAGTTTTTCTCTATCAAAACTACAATATATATTGAAATGACTAGTTAAAATTATTTAATATTGCCCCTGAAACCTTTAAATGCTGCATGTTTGATAATTCCATGGCAATAGCACATCATGATTCGTGAATTGCAACAAAATAGGCTATTTTCTAGAAT ] [-] EMBL CB664483 [ CACTTGCCAAGAAGTTTCAGCTTAAGGTTGGTCTGTTAGATGCCGACATATATGGACCATCCATACCCACAATGATGAATCTCCATGCAAAACCTGAAGTAAGTGAAGATATGAGGATGATTCCAGTTGACAACTATGGAGTACAATGCATGTCCATTGGGTTTCTTGTTGACAAAGATGCACCAATTGTTTGGAGAGGTCCTATGGTTTGTTTTTATGTGCTTCTGTTAACTTCTCATTTAAAGTGTCTATACCCTTAGTGGACGTGTATTTTTCATATAAACTATAAAGTATTTTGTCTGTTCTTTGCCCATTCTTAATGAATATAAAAAAATCTGCAAAGATTTACCATTGGAAGCATGCATATCAATGTGGAAGTAAACTATTGCGAAGTTAGAAACATGATTTAATTTTCTTCCATAAATTTTCAGCCCTCATGCACTAACACAATGATGGGCACATGGAGTACATGTTTTCTTTTGCGTAGCAACAAGCAAGTCCATACGCATGTTATTGAAATATGGTTGCTTTTTGTAATTTTTGTAATCTTCGGGACAACAGTGTTGGTAGGATAGAAAGAGCTAGTGGATGTGGACGTTTTCTTTACCTTTTCATTCCACATTTTTAGTTTTTCTCTATCAAAACTACAATATATATTGAAATGACTAGTTAAAAGGATTTAATATTGCCCCTGAAACCTTTAAATGCTGCATGTTTGATAATTCCATGGCAATAGCACATCATGATTCGTGAATTGCAACAAAATAGGCTATTTTCTAGAAT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||