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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11100#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 885 fasta sequence
[TTGCCGTCCGATTGCTGTCCCCCGAGCTCCTATGCGCCGCCGCCGGCTCACTCCCCGCGTGAAGACGACGCCCTCCCTTCGCTGCGAAGATTCCCCGAAGATCGCTCTACTCCAGGTACAAGCCATGCGATCTTCAGAAGAGAGTAGTTCTGATGAGGACGATGAGATCCTTTCTGAGCTCAAAGAGAAGTGGGATGCTATTGAGAACAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGTATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCAGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATTCAGTAGTCCGAGAAGATTTCTGTTCTTGTGCCAACAGCATATGTATCCTCTTGCTAGTTGACCGGTTAAGAGAGTTGATTCTTCTGTGCATGTTAATTCAGGGTAGTTAGTC]
[+] EMBL AK060045 [TTGCCGTCCGATTGCTGTCCCCCGAGCTCCTATGCGCCGCCGCCGGCTCACTCCCCGCGTGAAGACGACGCCCTCCCTTCGCTGCGAAGATTCCCCGAAGATCGCTCTACTCCAGGTACAAGCCATGCGATCTTCAGAAGAGAGTAGTTCTGATGAGGACGATGAGATCCTTTCTGAGCTCAAAGAGAAGTGGGATGCTATTGAGAACAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGTATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCAGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATTCAGTAGTCCGAGAAGATTTCTGTTCTTGTGCCAACAGCATATGTATCCTCTTGCTAGTTGACCGGTTAAGAGAGTTGATTCTTCTGTGCATGTTAATTCAGGGTAGTTAGTC]
[+] EMBL AK068922 [TTGCCGTCCGATTGCTGTCCCCCGAGCTCCTATGCGCCGCCGCCGGCTCACTCCCCGCGTGAAGACGACGCCCTCCCTTCGCTGCGAAGATTCCCCGAAGATCGCTCTACTCCAGGTACAAGCCATGCGATCTTCAGAAGAGAGTAGTTCTGATGAGGACGATGAGATCCTTTCTGAGCTCAAAGAGAAGTGGGATGCTATTGAGAACAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGTATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCGGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATT ]
[+] EMBL CF332756 [TTGCCGTCCGATTGCTGTCCCCCGAGCTCCTATGCGCCGCCGCCGGCTCACTCCCCGCGTGAAGACGACGCCCTCCCTTCGCTGCGAAGATTCCCCGAAGATCGCTCTACTCCAGGTACAAGCCATGCGATCTTCAGAAGAGAGTAGTTCTGATGAGGACGATGAGATCCTTTCTGAGCTCAAAGAGAAGTGGGATGCTATTGAGAACAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTNTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTG ]
[+] EMBL CF332668 [TTGCCGTCCGATTGCTGTCCCCCGAGCTCCTATGCGCCGCCGCCGGCTCACTCCCCGCGTGAAGACGACGCCCTCCCTTCGCTGCGAAGATTCCCCGAAGATCGCTCTACTCCAGGTACAAGCCATGCGATCTTCAGAAGAGAGTAGTTCTGATGAGGACGATGAGATCCTTTCTGAGCTCAAAGAGAAGTGGGATGCTATTGAGAACAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTT AAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTG ]
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[+] EMBL CB000093 [ agTTTGTGAGATGAAAGAGAAGTGGGATGATATTGCGTTCAAGTCCTCTGTTCTCTTTTACGGAGGCGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGAATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCAGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATTCAGTAGTCCGAGAAGATTTCTGTTCTTGTGCCAACAGCGTATGTAaaaaaaaa ]
[-] EMBL CF332755 [ CGGAGCAATCATCGCTGTCTGGCTATCCTCGATTGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGTATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCAGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATTCAGTAGTCCGAGAAGATTTCaaaaaaaa ]
[-] EMBL CF332667 [ TGTTGTCAAAGCTGTCGATTCAGTTCCAGTGCTTCCGAACATACTGGAGCTAGTTGGGCTTGGCTACTCGGGATGGTTTGTGTACCGCTACCTGCTCTTCAAGGAAAACCGGGAAGAACTGGCCAATGGCTTTGATGCTCTAAAGAAAAGGATCACTGGAAATGAGGAATAGCTGTGTATCCTGTTTCTCTGCTTGAACGTTGTCATTAGAGCCTTTTGTTTTTTCTCATGTAAATGCTGGAAGCGTTATTGATGTTTATGGCCTCCCACATCTTCTGTACTGTCTGCAGCTCAGCGGGGTTTGCAGTATCATCTGACTTCTGAACAGATCTCCACATTTATGGCTGCGCTAAAATGCTTGTGATTCTTCTGATATGGAGGTCAGCTGGTCCTGTTTCTTGGCTGGCTTCCTTTCCCCAATGATTCAGCTGTATGTTACTACTGCTAAGTTTAAGCCAGAACTGATAAGTTTAAGCTGTAGTACAAGCAATTATTTGAAATAAATTCAGTAGTCCGAGAAGATTTCaaaaaaaa ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||