These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Oryza sativa see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_11105#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 1376 fasta sequence [GCTGTCGCTGTCCACCCGTCCGTCCGTCGTCGATGGCGTCGTCGTCGCCGCCGGTCCGGCCATGGGCGGACCTGCAGCACGACCTGCTCGTGATGATCATGTCCCGGGTGGGCCTCCCCGATCTCCTCTCCGGCGGCGCCACCCGCGCCTGCTCCGCATGGCGGGCCTCGGCGCGCGACCCGCTCGTGTGGCGCCGCGTTGACCTCCGCGACTGGGCCGTCCTGACCTCGGCCCGGCGCCGGCTCGCTGCGGGAGACGGTGAAGCAGCAGCCGCCGGGCGCGGGCGTGTCCCTCTTCAAGCCGCTCTCTGCAGTGTGCTGGAGATCGTCGTGCGGCGGGCGGCCGGTCGGATGGAGGCCTTGCTCCTACCGGAGTTCGCCGATGAGGAGCACCTCCTCTTCCTCGCTCAGAGGAATCCAAATCTGCACTATTTCAGCCTTCCTGCCACATGTATAACTTATGATCAGTTCCGTAAGGCAATTGACAAATTACAATTTCTTAAAGGCATGGCAGTGGATGAGGGTCTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT-GATTGCCTAGAGGAGCTTG-AGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC-AAGTGCTGTGCTCC-AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG-CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA-CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGCAACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAATTTTAAGTCGTTGCAGTCTCTTGGGCCTGAGCGAGCTGGCAACGCATGGCTGTTCGGCTGTTCCGCCTGTGCAGAGTACTCTGCTTTGTACTCTTTTGTTAACCAAAGATGCCCTGTGTTTCCNCGAGAGGCATTTACGTTGGAGATCTCCATGATTGCACTCTTTAAAAAA] 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CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGGTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAAaaa ] [+] EMBL CF332378 [ CTTATTAATCACGATGTTCTCAGCCATGTACATCAGTGTTGTCCAGATTTTCTGGAGTTGAAGGTGTTTGCTCTTTATGTCGACGAAGAGATGGCTTCAATCATTTGCAACTCCCTTCCACGTCTGAAGAAGCTTGAGATACCAAACTCTGATATGTCTTGTGCTGCAATAATAAAATTCCTT GATTGCCTANAGGAGCTTG TGTACTTGGACATATCTGGTTATGAGACTTCGGCAATATC AAGTGCTGTGCTCC AAAAAGCTTCTCGGCTGAACATCTTCATCTGGAACTCAAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAG CCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCA CAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACAATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATC ] [+] EMBL BQ907396 [ CTGGAACTCCAAATTTGAGCTTGGGGAGTTCACGGACTGTTCGAATTGTGGTGAACATTGCATTAATCCTCAAGAGCCCTTGTAAGTGCGTGATGGAGCACCAGAGTCATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCAC ACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACTATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGTTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTCAATGATGTCTTGTGAGAACGAAGC ACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAATTTTAAGTCGTTGCAGTCTCTTGGGCCTGAGCGAGCTGGCAACGCATGGCTGTTCGGCTGTTCCGCCTGTGCAGAGTACTCTGCTTTGTACTCTTTTGTTAACCAAAGATGCCCTGTGTTTCCNCGAGAGGCATTTACGTTGGAGATCTCCATGATTGCACTCTTTAAAAAA] [+] EMBL BI808786 [ ATGGACTGGCTGGCTGGACCTTCACAACCTTCCTGATGCAGTAAACTGTGACTTAAGTTAAATTGACTATCCTACCTGCTCGTCAAATTTCAACATTTGTCTGGGTTACTTGTCAATCAAATGGTGGGTAAGGTGTTACCACGCTTTGATGTGCCTTATGTGGCACTTTATTTTGGAGTTTAATATGTATGTGATATCACGATTTCCAGCATTTTATTGTC ATGATGTCTTGTGAGAACGAAGC ACGCACGCTACTTGGTGCAGTGTTGAGCCTTGTTTTACAATAAAaaaaaa ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Mon Feb 16 12:49:02 CET 2004 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||